Establishment of clinical diagnosis on fish disease using small RNA

小RNA鱼病临床诊断方法的建立

• 批准号: 22K05833
• 负责人: 小山 喬
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Nagasaki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K05833/
• 关键词: やせ病; 多検体mRNA-seq; 小分子RNA; トラフグ

本研究では、トラフグのやせ病をモデルとして、魚類感染症の感染初期に宿主体液中に現れる小分子RNAを同定し、当該小分子RNAを非侵襲的に検出する方法を開発することを目的として研究を進めている。令和4年度は、宿主遺伝子発現情報をもとにした感染ステージの分類を行うため、トラフグをやせ病に人為感染させ、標的組織である腸管の経時サンプリングと、それより抽出したtotal RNAを材料に多検体mRNA-seq解析を行った。約300検体を解析に付したところ、やせ病感染トラフグの腸管トランスクリプトーム情報を元に、感染状態を少なくとも３ステージに分類できることを明らかした。これらのうち、感染初期に特徴的に現れたグループは、やせ病PCR検査陰性であった。よって、宿主トランスクリプトーム情報を用いれば、従来法よりも早くやせ病感染を検出できる可能性が示唆された。しかしその一方、腸管の遺伝子発現は外環境による遺伝子発現変化が大きく、感染ステージの把握を行う組織として適当ではない可能性が考えられた。

In this study, we developed a non-invasive method for the detection of small molecules of RNA in the body fluid of the host in the early stage of infection. Objective to conduct a comprehensive study. In the year 4, the host and the host have found that the infection rate is classified into three categories: the virus is infected by human infection, the organization of the virus is responsible for human infection, and the tissue of the virus is used to analyze the multi-body mRNA-seq of the total RNA materials. About 300 people are responsible for the diagnosis and treatment of the disease, and the status of the infection is very high. In the early stage of infection, the disease was caused by PCR, especially in the early stage of infection. If you are sick, the host will tell you that your feelings will be abetted by the possibility of infection. On the other hand, the management and management department is concerned about the realization of the environmental impact of the outside environment, and the possibility that the organization will be affected by the situation.