大規模ゲノム再編の時空間ダイナミクスの解析

大规模基因组重排的时空动态分析

• 批准号: 22K06186
• 负责人: 片岡 研介
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: National Institute for Basic Biology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06186/
• 关键词: ヘテロクロマチン; HP1; ゲノム再編; テトラヒメナ

ヘテロクロマチンは、特徴的なヒストンのメチル化を認識するHP1タンパク質を中心にして、様々なトランス作用因子がクロマチン上にリクルートされることにより形成されているが、その形成機構には多くの謎が残されている。本年度は、ヘテロクロマチン形成を同調的に解析することが可能なテトラヒメナを用いて、HP1タンパク質とトランス作用因子による協調／排他関係の経時的なダイナミクスの解明を目指した。本計画では、ヘテロクロマチンで起こるダイナミックな連続反応が、１）分子間の強固な相互作用による安定的な複合体形成と、２）弱い静電相互作用によって支えられた動的な凝集体形成、という異なる構成原理によって担われていると想定し、１）の相互作用解析には、免疫沈降法、２）の相互作用解析には、近接因子標識法を用いた。これらの解析では、ヘテロクロマチンを構成する中心的なHP1様タンパク質であるPdd1に着目し、１）の解析には、Pdd1に免疫沈降に最適なエピトープタグが融合した融合タンパク質を発現する細胞株を、２）の解析には、Pdd1に近接因子標識可能なペルオキシダーゼが融合した融合タンパク質を発現する細胞を用いた。これらの細胞株において、ヘテロクロマチンが新規に形成される時期、複数のヘテロクロマチン領域が集合する時期、ヘテロクロマチン標識されたゲノム領域がゲノムから排除される時期において、Pdd1と相互作用または、近接する因子を質量分析により同定し、ヘテロクロマチン構成因子の経時的なダイナミクスを明らかにした。

ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン は, trevor 徴 な ヒ ス ト ン の メ チ ル change を know す る HP1 タ ン パ ク qualitative を center に し て, others 々 な ト ラ ン ス effect factor が ク ロ マ チ ン on に リ ク ル ー ト さ れ る こ と に よ り form さ れ て い る が, そ の form institutions に は more く の mystery が residual さ れ て い る. This year は, ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン form を homology に parsing す る こ と が may な テ ト ラ ヒ メ ナ を with い て, HP1 タ ン パ ク qualitative と ト ラ ン ス effect factor に よ る coordination/exclusive masato is の 経 when な ダ イ ナ ミ ク ス の interpret を refers し た. This project で は, ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン で up こ る ダ イ ナ ミ ッ ク な even 続 anti 応 が, 1) intermolecular の strong な interaction に よ る stable な complex formation と, 2) weak electrostatic interaction に い よ っ て branch え ら れ た moving な coagulation collective formation, と い う different な る principle に よ っ て bear わ れ て い る と し scenarios, 1) の interaction parsing Youdaoplaceholder0 に, immunoprecipitation method, 2) <s:1> interaction analysis に, proximity factor identification method を using に た. こ れ ら の parsing で は, ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン を constitute す る center な HP1 others タ ン パ ク qualitative で あ る Pdd1 に し, 1) の parsing に は, Pdd1 に immune sink に optimum な エ ピ ト ー プ タ グ が fusion し た fusion タ ン パ ク qualitative を 発 now す る cell lines を, 2) の analytic に は, Pdd1 に nearly meet factor to identify potential な ペ ル オ キ シ ダ ー ゼ が fusion し た fusion タ ン パ ク qualitative を 発 now す る cells を using い た. こ れ ら の cell lines に お い て, ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン が new rules に form さ れ る period, plural の ヘ テ ロ ク ロ マ チ が ン field collection す る period, ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン logo さ れ た ゲ ノ ム field が ゲ ノ ム か ら exclude さ れ る period に お い て, Pdd1 と interaction ま た は, nearly す る factor を quality analysis に よ り with し, ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン constitute factor の 経 when な ダ イ ナ ミ ク ス を Ming ら か に し た.

项目成果

テトラヒメナのゲノム削減は複数のHP1様タンパク質の協調的作用により制御される

四膜虫的基因组减少是由多种 HP1 样蛋白的协调作用控制的

• 发表时间: 2022
• 作者: 片岡 研介;Olivera Valentirovic;吉村 ゆり子;Eliot Geraud;西本 裕希;中川 れい子;谷 直紀;望月 一史;中山 潤一
• 通讯作者: 中山 潤一