パイオニア転写因子による再生エンハンサーのプライミング機構

先驱转录因子再生增强子的启动机制

• 批准号: 22K06233
• 负责人: 越智 陽城
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Yamagata University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06233/
• 关键词: 再生; エンハンサー; パイオニア因子; 遺伝子発現制御; ゲノム; ATAC-seq; KLF; ツメガエル; ゲノム機能; エピゲノム

エンハンサーのプライミングとプライミングが維持されている状態 (Primed状態) は、細胞の運命を決定するプロセスにおいて極めて重要なステップである。再生エンハンサーを活性化させるには、なにより最初に閉じたクロマチンを開ける必要がある。これを担う転写因子はパイオニア転写因子と呼ばれるが、再生においていずれの転写因子がその役割を担うのか、それら因子がどのように再生エンハンサーのヌクレオソーム上の標的DNA配列を探索 しオープニングに導きプライミングするのか、プライミングされた状態のエンハンサーに如何なる情報が加わると、標的遺伝子の転写が開始されるかなど、全く不明であり、解決すべき問題として残されている。この目的で、本研究課題は、損傷した組織を再生させるか否か、損傷後の細胞の運命決定のプロセスにおいて最初のステップであるクロマチンのオープニングを担うパイオニア転写因子の同定と、それら因子によるプライミング機構とプライムされた状態(Primed状態)から脱してPoised状態に向かうメカニズムを明らかにする。本年度は、オープンクロマチン領域にエンリッチしている転写因子結合モチーフのKLFファミリーに着目し、KLFファミリーのいずれが再生特異的なオープンクロマチン領域の活性化因子でるのか検討すると伴に、標的遺伝子の一つAdra1aについて阻害剤を用いて再生への影響を検討した。

エンハンサーのプライミングとプライミングが maintains the されている status (Primed status) It is very important to determine the fate of cells. Regeneration and activation of エンハンサーをActivation and なによりInitial closing of じたクロマチンをOpening and necessities.これを聆転WRITING FACTORS はパイオニア転WRITING FACTORS とHUばれるが、RESINGRAPHIC においていずれの転WRITING factors がその丶Exploration of the DNA alignment of the target of the うのか、それらfactor がどのように regeneration エンハンサーのヌクレオソームしオープニングに道きプライミングするのか、プライミングされた Status のエンハンサーにHow なるInformation がAdd わると, target left 伝子の転写がstart されるかなど, all くUnknown であり, solve すべきproblem として residual されている. The purpose of this research, the purpose of this research, the regeneration of damaged tissue, and the fate of cells after damage Deciding on the first step of the decisionニア転无同定と、それら Factor によるプライミングMechanism とプライムされたSTATE( Primed state)から出してPoised stateに向かうメカニズムを明らかにする. This year's は, オープンクロマチン field にエンリッチしている転 write factor combination モチーフのKLFファミリーに目し, KLFファミリーのいずれがRegeneration Special The activating factor of the naオープンクロマチン field, the target legacy伝子の一つAdra1aについて hinders 剤を用いて regeneration へのeffect を検question した.

项目成果

NBRP Clawed frogs / Newt; Genetic and genomic resources of amphibian model organisms and their applications

NBRP 爪蛙/蝾螈；

• 发表时间: 2022
• 作者: Makoto Suzuki;Takeshi Igawa;Nanoka Suzuki;Ichiro Tazawa;Keisuke Nakajima;Nobuaki Furuno;Ken-ichi T. Suzuki;Haruki Ochi;Takashi Kato;Toshinori Hayashi;Hajime Ogino
• 通讯作者: Hajime Ogino

Transgenic Xenopus laevis with a limb-specific shh enhancer, outlines the competence to express shh in regenerating limbs

具有肢体特异性 shh 增强子的转基因非洲爪蟾，概述了再生肢体中表达 shh 的能力

• 发表时间: 2022
• 作者: Reimi Tada;Takuya Higashidate;Takanori Amano;Shoma Ishikawa;Saki Nara;Koshiro Ishida;Akane Kawaguchi;Haruki Ochi;Hajime Ogino;Nayuta Yakushiji-Kaminatsui;Joe Sakamoto;Yasuhiro Kamei;Koji Tamura;and Hitoshi Yokoyama
• 通讯作者: and Hitoshi Yokoyama

McGovern Medical School(米国)

麦戈文医学院（美国）

Retinoic acid control of pax8 during renal specification of Xenopus pronephros involves hox and meis3

原爪蟾肾脏特化过程中视黄酸对 pax8 的控制涉及 hox 和 meis3

• DOI: 10.1016/j.ydbio.2022.10.009
• 发表时间: 2023
• 期刊: Developmental Biology
• 影响因子: 2.7
• 作者: Durant-Vesga Jennifer;Suzuki Nanoka;Ochi Haruki;Le Bouffant Ronan;Eschstruth Alexis;Ogino Hajime;Umbhauer Muriel;Riou Jean-Fran?ois
• 通讯作者: Riou Jean-Fran?ois

全ゲノム動態解析が解き明かす腎再生におけるアドレナリンレセプターの役割

全基因组动力学分析揭示肾上腺素受体在肾脏再生中的作用

• 发表时间: 2022
• 作者: 鈴木菜花;荻野肇;*越智陽城
• 通讯作者: *越智陽城