Molecular mechanism governing plant plasticity through pre-mRNA 3'UTR regulation
Molecular mechanism governing plant plasticity through pre-mRNA 3'UTR regulation
批准号:
22K06279
负责人:
柘植 知彦
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
中文摘要
本課題では、光環境の変化に適応する植物をモデルに用い、CFI がmRNA前駆体の3'UTRを制御する分子機構を解明する。pre-mRNAの3'UTR切断部位を決定するプロセスで重要な役割を担うCFIタンパク質複合体の全構成因子を植物で同定し、研究基盤を整備する。pre-mRNAには複数のポリアデニル化部位が存在し、その選択により異なった構造をもつ成熟mRNAができる。選択的ポリアデニル化は、3'UTRの構造やmiRNA標的などによる安定性、転写産物の局在、翻訳産物の多様化に貢献する。特にCFIが3'UTRの選択的ポリアデニル化制御に不可欠と考えられる。本年度は、シロイヌナズナでCFI構成因子(AtCFI)を単離して、植物における機能を解析した。これまでの成果は、国内外の学会、論文などに発表した。以下その成果の一部を列記する。1)AtCFIは、AtCFI 25a、AtCFI 25b、AtCFI 59、AtCFI 68、により構成され、核において、AtCFI 25aとAtCFI 59、AtCFI 25aとAtCFI 68がそれぞれ共局在する。また、AtCFI 59とAtCFI 68も共局在することから、CFIを構成するサブユニット構成の組み合わせは多様と考えられた。2)免疫沈降とLC-MSを組み合わせた生化学的実験などから、AtCFIの構成因子が相互に確認でき、シロイヌナズナにおいてCFIがタンパク質複合体として存在することが判明した。3)AtCFI構成因子の機能欠損変異植物を同定し、その多重変異体を作製した。AtCFI 25aの機能欠損変異体は形態形成に異常を示した。またAtCFI 59とAtCFI 68の機能欠損変異体は、1遺伝子変異では異常を示さないが、2重欠損変異体で形態形成に異常を示したことから、AtCFI 59とAtCFI 68には重複した機能があると考えられた。
英文摘要
本課題では、光環境の変化に適応する植物をモデルに用い、CFI がmRNA前駆体の3'UTRを制御する分子機構を解明する。pre-mRNAの3'UTR切断部位を決定するプロセスで重要な役割を担うCFIタンパク質複合体の全構成因子を植物で同定し、研究基盤を整備する。pre-mRNAには複数のポリアデニル化部位が存在し、その選択により異なった構造をもつ成熟mRNAができる。選択的ポリアデニル化は、3'UTRの構造やmiRNA標的などによる安定性、転写産物の局在、翻訳産物の多様化に貢献する。特にCFIが3'UTRの選択的ポリアデニル化制御に不可欠と考えられる。本年度は、シロイヌナズナでCFI構成因子(AtCFI)を単離して、植物における機能を解析した。これまでの成果は、国内外の学会、論文などに発表した。以下その成果の一部を列記する。1)AtCFIは、AtCFI 25a、AtCFI 25b、AtCFI 59、AtCFI 68、により構成され、核において、AtCFI 25aとAtCFI 59、AtCFI 25aとAtCFI 68がそれぞれ共局在する。また、AtCFI 59とAtCFI 68も共局在することから、CFIを構成するサブユニット構成の組み合わせは多様と考えられた。2)免疫沈降とLC-MSを組み合わせた生化学的実験などから、AtCFIの構成因子が相互に確認でき、シロイヌナズナにおいてCFIがタンパク質複合体として存在することが判明した。3)AtCFI構成因子の機能欠損変異植物を同定し、その多重変異体を作製した。AtCFI 25aの機能欠損変異体は形態形成に異常を示した。またAtCFI 59とAtCFI 68の機能欠損変異体は、1遺伝子変異では異常を示さないが、2重欠損変異体で形態形成に異常を示したことから、AtCFI 59とAtCFI 68には重複した機能があると考えられた。
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Cleavage Factor I is essential for maintaining the diversity at the 3' ends of mRNA in plants.
切割因子 I 对于维持植物 mRNA 3 端的多样性至关重要。
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tanaka Takahiro, Koyama Daiki, Saraumi Mitsuru, Motose Hiroyasu, Takahashi Taku, Tomohiko TSUGE, Tomohiko TSUGE]
通讯作者:
Tomohiko TSUGE
シロイヌナズナPLDζ1とPLDζ2は根においてそれぞれトランスゴルジネットワークとゴルジ後の膜コンパートメントに局在する
拟南芥 PLD z1 和 PLD z2 分别定位于根部的跨高尔基体网络和后高尔基体膜室
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[島村亮太*, 大橋洋平, 谷口(山本)幸美, 加藤真理子, 柘植知彦, 青山卓史]
通讯作者:
青山卓史
CNB-CSIC(スペイン)
CNB-CSIC(西班牙)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Is CSN involved in pre-mRNA processing? - CSN binding protein complex CF1 is essential for maintaining the diversity at the 3' ends of mRNA.
CSN 是否参与前 mRNA 加工?
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Matsuo Hirotoshi, Fukushima Hiroko, Kurokawa Shinpei, Kawano Eri, Okamoto Takashi, Motose Hiroyasu, Takahashi Taku, Tomohiko TSUGE]
通讯作者:
Tomohiko TSUGE
mRNA 3'UTRの長さを制御するAtCFI 25の機能解析
AtCFI 25(控制 mRNA 3UTR 长度)的功能分析
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[張暁娟, 野元美佳, Marta Garcia-Leon, 高橋直紀, 加藤真理子, 由良敬, 梅田正明, Vicente Rubio, 多田安臣, 古本強, 青山卓史, 柘植知彦*]
通讯作者:
柘植知彦*
共 12 条
単子葉植物イネを用いた光形態形成に関する分子生物学的解析
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批准号:09740620
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1997
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负责人:柘植 知彦
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依托单位:
海外基金