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遺伝的多様性と種多様性を種内集団構造によって結びつける

遺伝的多様性と種多様性を種内集団構造によって結びつける
通过种内种群结构将遗传多样性和物种多样性联系起来
批准号:
22K06399
负责人:
村上 正志
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31

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项目成果

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本研究では「種内の多様性が種分化を通じていかに種多様性に繋がるか」の解明に取り組んでいる。種内の遺伝的な多様性から種多様性への階層性は、生態学において極めて基本的な概念であり、集団遺伝学のモデルで予測されているが、実際の生物におけるそのスケールや遺伝子流動に対する分散制限の実際の要因は未解明である。具体的には、鳥類を対象として、COI遺伝子によるDNAバーコードに基づき、各種内の遺伝的多様性構造としてα多様度とβ多様度を計測し、その空間的な分布を解析することを計画した。本年度は、BOLD system に登録された、5,9445種(bin)、49,931地点の情報を解析途中である。なお、この数は申請時点での数(5,875種、48,044地点)からも増加しており、この増加の度合い、またその空間的な分布を解析することで、多様性の全体を推定することも計画に加える。これまでの解析では、全球で記録されているDNAバーコード配列について、スケールを変えた全球のメッシュごとにα多様度を算出し、同時にサンプル間の総当りでの遺伝的な違い(塩基置換数)と空間的距離の関係の傾きをβ多様度として、種ごとにこれらの関係を解析を進めている。β多様度は鳥類の分類群ごとに異なっており、特に各種の分散能力がこの関係に影響している。この関係自体は自明といえるが、この効果がさらに、アルファ多様度とどのように関わるか、さらに分析をすすめる。また、ここではβ多様度に対する空間的距離に加えて分散の障壁となる、水域と山域の効果を確かめている。これらの成果は、2023年度中に学術論文として発表の予定である。
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会议论文
節足動物における遺伝的多様性の空間パターンの比較と推定
节肢动物遗传多样性空间格局的比较和估计
DOI: --
发表时间: 2023
期刊:
影响因子: --
作者: [柴田匡人, 村上正志]
通讯作者: 村上正志
ソテツ類の適応的な多様化により、生態的種分化のゲノムメカニズムを明らかにする
  • 批准号:
    18F18076
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.47万
  • 财政年份:
    2018
  • 负责人:
    村上 正志
  • 依托单位:
森林土壌における物質循環活性の変化に伴う微生物の進化と群集構造の関係
  • 批准号:
    21657023
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额:
    $1.98万
  • 财政年份:
    2009
  • 负责人:
    村上 正志
  • 依托单位:
森林地下圏における物質循環網を駆動する微生物群集の空間構造の解明
森林の空間構造が植物-植食者-寄生蜂群集の動態に及ぼす影響の機械的解明
  • 批准号:
    17687003
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
  • 资助金额:
    $4.16万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    村上 正志
  • 依托单位:
海外基金