森林地下圏における物質循環網を駆動する微生物群集の空間構造の解明

阐明驱动森林地下物质循环网络的微生物群落的空间结构

• 批准号: 19657006
• 负责人: 村上 正志
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Chiba University (2008)Hokkaido University (2007)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19657006/
• 关键词: T-RFLP法; 土壌微生物群集; 生態系機能; PCRバイアス; 微生物; 酸化還元境界; 空間分布; 地下圏観察アクアリウム

森林地下土壌圏の微生物群集の調査、解析手法について、検討した。調査手法として、北海道大学苫小牧研究林において、地表面の土地利用が火山噴出降下物の下に埋没した、腐植相のび生物群集に与える影響を検討するために、縦穴を彫り込み、そこから、横方向に土壌水採水装置を導入し、本経費で購入した定圧ポンプを用いることで、土壌間隙水を効率的に採取できることを確認した。さらに、この土壌水に含まれる微生物の群集構造を解明するために、T-RFLP(末端蛍光修飾制限酵素断片多型性)法の有効性を検討した結果、多様な微生物群集を把握できることが確認された。しかし、同時に、多数のOUTが確認できたことで、PCRに際して、機会的に増幅されるOUTが決定されるバイアスが確認された。今後、さらに、このような問題を克服し、微生物群集とその生態系機能(物質循環)の関係を明らかにするための技術開発が望まれる。

Investigation and analysis methods of microbial communities in the underground soil circle of forests: に て て て, 検 exploration of <s:1> た. Survey technique と し て, tomakomai Hokkaido university study Lin に お い の て, surface land use が volcano lowered content under の に buried し た, humus の び biological cluster に and え る influence を beg す 検 る た め に, 縦 hole を carving り 込 み, そ こ か ら, transverse direction を import し 壌 に soil water collecting water device, this 経 で buy し た set 圧 ポ ン プ を with い る こ と The に of で and soil interspace water を efficiency is confirmed by で る る とを とを とを とを た. さ ら に, こ 壌 の soil contains water に ま れ る microbial の cluster structure を interpret す る た め に, T - RFLP limitations (end 蛍 light modification enzyme fragment polytypism) method is の have sharper を beg し 検 た results, and many others in な microbial clusters を grasp で き る こ と が confirm さ れ た. し か し, at the same time に, most の OUT が confirm で き た こ と で, PCR に interstate し て, opportunity に raised of さ れ る OUT が decided さ れ る バ イ ア ス が confirm さ れ た. In the future, さ ら に, こ の よ う な を overcome し, microbial clusters と そ の ecosystem function (material cycle) の masato を and Ming ら か に す る た め の technology open 発 が hope ま れ る.