Analysis of SECIS regulatory mechanism by noncoding RNA

非编码RNA分析SECIS调控机制

基本信息

  • 批准号:
    22K06606
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.75万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

本年度は、Selenoprotein P(SeP)のSECIS配列に相補的な配列を持つ新規noncoding RNA L-ISTによるSeP mRNAからタンパク質への翻訳阻害に必要な領域の同定を進めた。我々のこれまでの研究から、L-ISTによるSeP翻訳抑制には、相補的な領域だけでなく、5'側、3'側の日相動性配列部分も必要であることが明らかになっている。この情報をもとに、5'領域と3'領域の部分欠損変異体を作成し、SePを発現しているHepG2細胞にトランスフェクションを行った。その結果、5'非相補配列領域では、5'末端から500塩基まで欠損させたL-ISTでは翻訳抑制効果が見られたのに対し、600塩基まで欠損させると翻訳抑制が見られなくなった。500~600塩基のみを欠損させた変異体においても、翻訳抑制効果が見られなかったことから、5'非相補的領域内の必要領域は500~600塩基の間にあることが明らかになった。次に、3'非相補的配列領域でも同様の解析を行った。その結果、3'末端から500塩基までの欠損では翻訳抑制が起こったが、600塩基まで欠損させた変異体では、抑制が起こらなかった。これらのデータから、3'非相動性領域も末端部から500塩基から600塩基の間に必要配列があると推定された。long noncoding RNAによる翻訳抑制作用には、alu配列やSINB2配列のようなリピート配列が必要になることが多いことが知られているため、同定された必要領域内に繰り返し配列や機能性ドメインが存在するか確認を行ったが、5'領域、3'領域ともに、典型的な繰り返し配列や機能性ドメインは存在していないことがわかった。現在、詳細な必要配列の同定を進めている。
This year, the complementary alignment of Selenoprotein P(SeP) and SECIS is continuing to advance in the identification of essential areas for noncoding RNA L-IST and SeP mRNA. In this study, L-IST and SeP inversion inhibition are necessary for the diurnal dynamic alignment of the 5'-side and 3'-side. This information is transmitted to HepG2 cells in 5'and 3' regions. As a result, the 5'non-complementary array field has a 500-base loss at the 5' end and a 600-base loss at the 5 'end. 500 ~ 600 The second, 3'non-complementary array fields are the same as the analysis lines. The result is that the 3'-end is 500-base, the loss is 600-base, the loss is 100-base. The end of the 3'non-dynamic domain is 500 base, 600 base, and the necessary arrangement is presumed. long noncoding RNA in the presence of a reverse transcription inhibition, alu alignment SINB2 alignment necessary, multiple, identical, necessary domain, reverse transcription functional, 5'domain, 3' domain, typical reverse transcription functional, existence Now, the details of the necessary allocation and the same set of progress.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
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会议论文数量(0)
专利数量(0)
糖尿病関連タンパク質Selenoprotein Pが供給するセレンが,糖尿病による創傷治癒の遅延に与える影響の解析
糖尿病相关蛋白硒蛋白P供硒对糖尿病伤口愈合延迟的影响分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    村田汐梨;三田雄一郎;野口範子
  • 通讯作者:
    野口範子
Role of selenoprotein P expression in the function of pancreatic β cells: Prevention of ferroptosis-like cell death and stress-induced nascent granule degradation
  • DOI:
    10.1016/j.freeradbiomed.2022.03.009
  • 发表时间:
    2022-03-22
  • 期刊:
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Kitabayashi, Nanako;Nakao, Shohei;Toyama, Takashi
  • 通讯作者:
    Toyama, Takashi
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三田 雄一郎其他文献

DNA修復・複製遺伝子多型と膵癌発症リスク
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 作者:
    園山 隆之;堺 明子;三田 雄一郎;保田 雪子; 河本 博文;八木 孝仁;吉岡 正雄;三村 哲重;大内田 守;山本和秀;清水 憲二
  • 通讯作者:
    清水 憲二
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    辻田賢一,小川久雄
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  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
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  • 通讯作者:
    堤良平
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    2017
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
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  • 作者:
    長村 尭浩;稲荷 尚吾;三田 雄一郎;野口 範子;斎藤 芳郎
  • 通讯作者:
    斎藤 芳郎

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知道了