肺がん背景肺に潜むゲノム・エピゲノム異常の徹底的マッピングによる発がん機序の解明

肺癌的背景通过彻底绘制隐藏在肺部的基因组和表观基因组异常来阐明致癌机制

• 批准号: 22K06935
• 负责人: 谷野 美智枝
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Asahikawa Medical College
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06935/
• 关键词: 間質性肺炎; 特発性肺線維症; 肺癌; エピゲノム解析; 遺伝子解析; 肺がん; ゲノム; エピゲノム

特発性肺線維症(Idiopathic Pulmonary Fibrosis, IPF)の患者では肺癌の発生率が高く、IPFを伴わない肺癌と比べて予後が有意に不良である。IPF合併肺癌のなかで最多の組織型である扁平上皮癌症例を対象とし、組織標本を用いて形態学的評価（過形成、異形成、上皮内癌、浸潤癌）及び免疫組織化学染色を行った。IPFを伴う肺扁平上皮癌5症例および、IPFを伴わず肺気腫やIPF以外の間質性肺炎を伴う肺扁平上皮癌18症例を解析対象として選定した。また、肺癌の診断または予後のマーカーとして有用性が報告されているメチル化解析のターゲット遺伝子を文献から検索し、そのなかから免疫組織化学染色の抗体が確立しているCDH13、CDKN2A、RASSF1を選定した。それらの免疫組織化学染色条件を検討し、対象症例において腫瘍部・非腫瘍部を含む代表的な箇所で免疫組織化学染色を実施した。多くはCDH13が発現し、CDKN2A・RASSF1の発現は消失していたが、一部の症例では異なる発現パターンを示した。エピゲノム解析手法の検証として、ヒト肺原発扁平上皮癌の細胞株であるEBC-1を培養してDNAを抽出し、メチル化の定量解析実験を行った。バイサルファイト処理したDNAからリアルタイムPCRによる定量解析の系を立ち上げている。臨床検体は、免疫組織化学染色を実施した腫瘍部および腫瘍周囲の非腫瘍部や、腫瘍から離れた背景肺からDNAを抽出した。確立した測定系を用いて、臨床サンプルにおけるメチル化の定量解析を実施し、免疫組織化学染色結果との検討、臨床因子との比較検討を行っている。

The incidence of lung cancer in patients with Idiopathic Pulmonary Fibrosis (IPF) is higher than that in patients with IPF. IPF associated with lung cancer was most frequently diagnosed as squamous cell carcinoma (SCC), and histologic evaluation (metaplasia, heteroplasia, intraepithelial carcinoma, invasive carcinoma) and immunohistochemical staining were performed. IPF associated with squamous cell carcinoma 5 cases, IPF associated with interstitial pneumonia other than IPF, 18 cases of squamous cell carcinoma CDH13, CDKN2A and RASSF1 were selected for the diagnosis of lung cancer and for their usefulness in the future. Immunohistochemical staining was performed in all cases, including tumor and non-tumor. CDH13 appears in many cases, CDKN2A·RASSF1 appears in many cases, and CDKN2A·RASSF1 appears in many cases. EBC-1 cell line from lung squamous cell carcinoma was cultured, DNA extracted and quantified. The quantitative analysis of DNA by PCR was carried out on the whole. Clinical and immunohistochemical staining was performed on the tumor tissue and non-tumor tissue. DNA was extracted from the tumor tissue and lung tissue. Establishment of assay system, quantitative analysis of clinical profile, evaluation of immunohistochemical staining results, and comparative analysis of clinical factors

项目成果

非腫瘍性疾患病理アトラス 肺

肺非肿瘤性疾病病理图谱

• 发表时间: 2022
• 作者: Tai Y;Obayashi K;Yamagami Y;Yoshimoto K;Kurumatani N;Nishio K;Saeki K.;朔 啓太;大郷 恵子
• 通讯作者: 大郷 恵子

肺癌 第二版

肺癌第二版

• 发表时间: 2022
• 作者: Tsuda N;Tian Y;Arai E (11人中11人目) et al.;谷野美智枝他
• 通讯作者: 谷野美智枝他

旭川医科大学病院 病理部

旭川医科大学附属医院病理科