全前脳胞症スペクトラムに表現型の多様性をもたらす分子遺伝学的背景の解明

阐明导致前脑无裂畸形谱表型多样性的分子遗传背景

• 批准号: 22K07816
• 负责人: 阿部 裕
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07816/
• 关键词: Holoprosencephaly; 全前脳胞症; Binder症候群; Binderoid cleft lip; HPE; Binder 症候群

令和4年度は症例の収集を進めながら解析を継続した。対象症例は年齢・性別を問わず臨床症状として口唇顎口蓋裂・眼窩間距離の狭小化など、顔面正中部の低形成による顔貌異常を伴う症例とした。令和4年度までに新たに鶴岡市立荘内病院で1例の典型的なHPE症例(LOBAR型)と1例のBinderoid complete cleft lip/plate疑い例を同定した。対象症例は令和4年度末までに、宮城県立こども病院・八戸市立市民病院・鶴岡市立荘内病院から典型的なHPE症例3例、東北大学病院・鶴岡市立荘内病院からBinderoid complete cleft lip/plateとその疑い例18例となった。その中のHPE症例3例 (ALOBAR型1例、SEMILOBAR型1例、LOBAR型1例)、Binderoid complete cleft lip/plate症例2例において、患者もしくは家族よりインフォームドコンセントを取得し、患者本人、および両親から採血を実施した。5症例に対してG-bandingを行い、いずれも正常核型であることを確認した。続いて既知の遺伝子変異の同定、及びHPEの発症に関わる主要なpathwayに含まれる遺伝子の変異を同定するため、Targeted NGS panelを実施した。148の候補遺伝子のエクソン領域、およびECR browserを用いて同定した非コーディング領域のevolutionarily conseved reigion (脊椎動物において種を超えて保存されている領域)を解析領域とした。以上を含めた全975,605bp対象領域とし、Hiseq2000を用いてシークエンスした。そのうち八戸市立市民病院で同定されたALOBAR型のHPE症例で既知の原因遺伝子SIX3にde novoのフレームシフトを同定した。残りの4症例については解析を継続中である。

In 2004, the number of cases was increased. The symptoms include age, gender, clinical symptoms, cleft lip and palate, narrowing of the distance between the eye sockets, low formation of the middle part of the face, and abnormal facial appearance. In 2004, a case of typical HPE (LOBAR type) and a case of Binderoid complete cleft lip/plate were identified at the New Tsuruoka Municipal Hospital. Case Study: 3 typical cases of HPE at Miyagi Prefectural Hospital and Tsuruoka Prefectural Hospital, 18 suspicious cases of Binderoid complete cleft lip/plate Among them, there were 3 cases of HPE (ALOBAR type 1 case, SEMILOBAR type 1 case, LOBAR type 1 case), 2 cases of Binderoid complete cleft lip/plate syndrome. 5 cases of G-banding The NGS panel is implemented in the context of the identification of known genetic differences and the development of HPE. 148. Candidate genes are identified in the domain, and ECR browser is used to determine the evolutionary conformation of the non-vertebrate domain. The above includes all 975,605bp target areas, Hiseq2000, etc. The same determination was made in the case of ALOBAR type HPE at the Municipal Hospital of Kyoto, Japan. The known cause was identified in SIX3. 4 cases of residual disease