乾燥臍帯を用いたGATA1遺伝子解析－TAMの診断スコアリングシステム構築

使用干燥脐带进行GATA1基因分析-TAM诊断评分系统的构建

• 批准号: 22K07815
• 负责人: 岡本 年男
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: Asahikawa Medical College
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07815/
• 关键词: GATA1; 一過性骨髄異常増殖症; ダウン症候群; 一過性骨髄増殖症

一過性骨髄異常増殖症（TAM）はダウン症候群の新生児期の重要な合併症であるが，変異クローンが微量であるが故に見過ごされる症例も存在する．これらの症例でも重篤な経過を辿る場合や白血病に進展する場合があるため，新生児期にTAMを正確に診断することは極めて重要であると言える．本研究ではTAMのより正確な診断に向け，Down症候群児の乾燥臍帯を用いて次世代シーケンサーによるGATA1遺伝子検査を行いTAMを後方視的に診断し，新生児期の血液検査所見や臨床像を組み合わせた診断スコアリングシステムを構築することを目指している．当該年度では，これまでにダウン症候群の患者26名から研究参加の同意が得られた．全例の乾燥臍帯からゲノムDNAを抽出し，得られたDNAの濃度及び品質をアジレント社の Agilent 2200 TapeStation システムを用いて測定した．その結果，濃度の中央値は42.6ng/ml（範囲 6.21-206 ng/ml），DNA Integrity Number (DIN) 値の中央値は4.25（範囲 1.6-7.1）で，検体によって大きなばらつきが生じることが判明した．一方で，これらの検体を用いて従来法であるSanger法でGATA1遺伝子のエクソン2及び3の解析を行ったところ，濃度や品質に関わらずいずれの検体でも結果が得られ，TAMと臨床診断されていた症例全例でGATA1遺伝子変異を改めて同定することができた.この結果により，乾燥臍帯はTAMの後方視的診断に有用なツールとなることを証明できた．次世代シーケンサーによる解析は現在準備中で，対象患者数を一定数増やした後に解析を始める予定である．

Transient dysplasia of bone (TAM) is an important complication of neonatal period of the syndrome. This is the first time that a patient has been diagnosed with leukemia. This study aims to provide guidance for the correct diagnosis of TAM, the use of dry umbilical bands in Down syndrome, the next generation of GATA1 gene screening, the diagnosis of TAM, the clinical findings of neonatal blood screening, and the diagnosis of Down syndrome. During the year, 26 patients with this syndrome were enrolled in the study and consent was obtained. All samples were dried and DNA extracted from the umbilical cord, and the concentration and quality of DNA were determined by Agilent 2200 TapeStation. The results showed that the central value of concentration was 42.6 ng/ml (range 6.21-206 ng/ml), the central value of DNA Integrity Number (DIN) was 4.25 (range 1.6-7.1), and the detection of DNA Integrity Number (DIN) was significant. In one aspect, GATA1 gene was analyzed by Sanger method, concentration and quality of GATA1 gene were analyzed by Sanger method, and the results of TAM clinical diagnosis were obtained. The result is that the umbilicus is dry and the TAM is useful in the diagnosis of posterior vision. The next generation is in preparation for the analysis. The number of patients is increasing.