KMT2A再構成急性骨髄性白血病の新規検査技術確立とクローン構造解析

本研究では、急性骨髄性白血病(AML)における新規検査技術を確立し、KMT2A再構成症例を主な対象として詳細なクローン構造やその進化機構、臨床的意義を明らかにすることを目的としている。新規検査技術の確立については、レーザーマイクロダイセクション技術を用いて塗抹標本より採取した細胞からの全ゲノム解析を試みた。KPAM1細胞株を30, 100, 300細胞採取して、DNA抽出後に全ゲノム解析を実施したところ、100, 300細胞採取したサンプルでは既知のGATA1変異が検出された。よってレーザーマイクロダイセクションで採取したサンプルからの全ゲノム解析には、おおよそ100細胞程度必要と考えられた。また、クローン構造解析については、日本小児がん研究グループ(JCCG)AML-05/99臨床試験登録症例を含めたKMT2A再構成症例、計27例の初発時・再発時セット検体のターゲットシークエンス結果を比較した。その結果、27例中14例(51.9%)で再発時にsignaling pathway変異の消失がみられた。同様の解析をKMT2A再構成以外のAMLで実施したところ、signaling pathway変異の消失は122例中36例(29.5%)と、KMT2A再構成症例と比較して有意に割合が低い結果が得られた。再発時にsignaling pathway変異を消失したKMT2A再構成症例は、転写因子や細胞周期に関わる遺伝子の変異を獲得している頻度が有意に高かった。

本研究では、急性骨髄性白血病(AML)における新規検査技術を確立し、KMT2A再構成症例を主な対象として詳細なクローン構造やその進化機構、臨床的意義を明らかにすることを目的としている。新規検査技術の確立については、レーザーマイクロダイセクション技術を用いて塗抹標本より採取した細胞からの全ゲノム解析を試みた。KPAM1細胞株を30, 100, 300細胞採取して、DNA抽出後に全ゲノム解析を実施したところ、100, 300細胞採取したサンプルでは既知のGATA1変異が検出された。よってレーザーマイクロダイセクションで採取したサンプルからの全ゲノム解析には、おおよそ100細胞程度必要と考えられた。また、クローン構造解析については、日本小児がん研究グループ(JCCG)AML-05/99臨床試験登録症例を含めたKMT2A再構成症例、計27例の初発時・再発時セット検体のターゲットシークエンス結果を比較した。その結果、27例中14例(51.9%)で再発時にsignaling pathway変異の消失がみられた。同様の解析をKMT2A再構成以外のAMLで実施したところ、signaling pathway変異の消失は122例中36例(29.5%)と、KMT2A再構成症例と比較して有意に割合が低い結果が得られた。再発時にsignaling pathway変異を消失したKMT2A再構成症例は、転写因子や細胞周期に関わる遺伝子の変異を獲得している頻度が有意に高かった。