多発性骨髄腫の不均一性を考慮した経時的一細胞RNA解析による薬剤耐性遺伝子の同定

考虑多发性骨髓瘤的异质性，通过时程单细胞RNA分析鉴定耐药基因

• 批准号: 22K08506
• 负责人: 土師 正二郎
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08506/
• 关键词: 薬剤耐性; 多発性骨髄腫; single cell RNA-seq解析; Single cell RNA-seq解析

多発性骨髄腫（以下、MMと称する）は、多くの症例で薬剤耐性が生じ治癒が困難な疾患である。このため、新規薬剤耐性獲得の分子機構の解明とそれを踏まえた治療法の開発や薬剤選択指標の確立は喫緊の課題であるが、薬剤耐性遺伝子の同定が進んでおらず、耐性獲得の分子基盤は不明な点が多い。耐性遺伝子の同定が困難な原因としてMMの腫瘍内・腫瘍間不均一性が挙げられる。MMは同一個体内にも複数のクローンが存在することが知られており、従来の腫瘍細胞全体を対象とした解析では少数のクローンが持つ遺伝子の同定が困難なため、一細胞レベルでの解析が必要である。また、患者間で遺伝子発現プロファイルが大きく異なることが知られており、複数の患者データを一括に解析すると、少数のクローンが持つ遺伝子の同定が困難なため、同一患者の経時的検体を解析する必要があると考えられる。我々はごく最近、新規薬剤投与前後のMM骨髄検体を対象としたsingle cell RNA-sequencing (以下、scRNA-seqと称する)を行い、薬剤投与により消失する少数細胞集団を見出した。ついでこの集団が持つ発現変動遺伝子のうち、database解析により良好な予後と相関を持つものを、in vitro解析により薬剤感受性を増強するものを選別し、薬剤感受性遺伝子を同定することに成功し論文に報告した。この解析手法を用いて、薬剤耐性遺伝子の同定と治療法の開発や薬剤選択指標の確立を目的とした研究を行っている。令和4年度の研究実績は以下の通りである。一患者の、寛解期を含む経時的サンプルを対象としたscRNA-seq解析を行うことで、寛解期に減少しない細胞集団を同定した。Databaseを用いた解析により、これらの集団のみに特徴的に発現する遺伝子が予後に与える影響を解析したところ、予後不良遺伝子を多く持つ細胞集団を同定することに成功した。

Multiple bone swelling (hereinafter referred to as MM) is a disease that is difficult to cure due to multiple symptoms. The molecular mechanism of resistance acquisition is explained in detail in this paper, and the molecular matrix of resistance acquisition is unclear in many aspects. The cause of the difficulty in determining the consistency of tolerance genes is the heterogeneity within and between MM tumors. MM is the same body, multiple cells exist, and it is necessary to analyze a small number of cells. There are many differences between patients, and there are many differences between patients. There are many differences between patients. There are many differences between patients. It is difficult to determine the same number of patients. It is necessary to analyze the same patient's body. We found that a small number of cell clusters appeared in response to single cell RNA-sequencing (hereinafter scRNA-seq) in MM cells before and after recent, new, and new drug administration. This paper reports on the success of the research on the selection and identification of sensitive genes in the study of the group, the database analysis, the good correlation, the improvement of sensitivity, the selection and identification of sensitive genes. The analysis method is applied to the determination of the resistance gene, and the development of the treatment method is carried out for the purpose of establishing the selection index. The research results for the fourth year are as follows: A patient's cell population is reduced during the remission period. The Database uses the analysis method to analyze the characteristics of the group, and the results of the analysis method are as follows: