小細胞肺癌における神経変性疾患関連分子の役割の解明と新規個別化治療への応用

本研究の目的は、肺小細胞肺癌の悪性化機構における神経変性疾患関連分子の役割を解明し、新規個別化治療開発につなげることである。本年度は、「制御性細胞死経路と神経変性疾患関連分子の遺伝子プロファイルと標的探索」を行った。まず未治療肺小細胞癌切除標本と正常肺標本を収集した。凍結標本からRNA採取を行い、網羅的解析を委託する研究機関で品質検定を行っていただいたところ、解析に十分な品質ではないとの判定であったため、FFPE標本からサンプルを採取し、解析を行う方針に変更した。FFPE標本からRNAを採取後、小細胞肺癌Phenotypeを決定するためにqRT-PCR、ウェスタンブロットを行った。遺伝子発現の程度に応じてASCL1/NEUROD1/YAP1/POU2F3優位型サンプルを決定し、30標本を研究機関に郵送した。遺伝子の品質上の問題がないことがわかり、RNAシーケンス解析へと進めることができた。また小細胞肺癌細胞株、非小細胞肺癌細胞株、ヒト気管支上皮細胞（正常コントロール）より遺伝子、蛋白を抽出し、患者標本での実験と同様に、肺小細胞肺癌Phenotype決定のためのqRT-PCR、ウェスタンブロットを行った。本年度中に網羅的解析を終了し、制御性細胞死(フェロトーシス、アポトーシス、ネクロトーシス)関連遺伝子発現を確認する予定であった。さらに神経変性疾患関連癌遺伝子候補を選択する予定であった。しかし品質検定で時間を要してしまった。

本研究の目的は、肺小細胞肺癌の悪性化機構における神経変性疾患関連分子の役割を解明し、新規個別化治療開発につなげることである。本年度は、「制御性細胞死経路と神経変性疾患関連分子の遺伝子プロファイルと標的探索」を行った。まず未治療肺小細胞癌切除標本と正常肺標本を収集した。凍結標本からRNA採取を行い、網羅的解析を委託する研究機関で品質検定を行っていただいたところ、解析に十分な品質ではないとの判定であったため、FFPE標本からサンプルを採取し、解析を行う方針に変更した。FFPE標本からRNAを採取後、小細胞肺癌Phenotypeを決定するためにqRT-PCR、ウェスタンブロットを行った。遺伝子発現の程度に応じてASCL1/NEUROD1/YAP1/POU2F3優位型サンプルを決定し、30標本を研究機関に郵送した。遺伝子の品質上の問題がないことがわかり、RNAシーケンス解析へと進めることができた。また小細胞肺癌細胞株、非小細胞肺癌細胞株、ヒト気管支上皮細胞（正常コントロール）より遺伝子、蛋白を抽出し、患者標本での実験と同様に、肺小細胞肺癌Phenotype決定のためのqRT-PCR、ウェスタンブロットを行った。本年度中に網羅的解析を終了し、制御性細胞死(フェロトーシス、アポトーシス、ネクロトーシス)関連遺伝子発現を確認する予定であった。さらに神経変性疾患関連癌遺伝子候補を選択する予定であった。しかし品質検定で時間を要してしまった。