使用纳米孔测序仪开发基于血液微生物组分析的脓毒症诊断技术-猫眼课题宝

使用纳米孔测序仪开发基于血液微生物组分析的脓毒症诊断技术

批准号：

22K09106

负责人：

松尾禎之

金额：

$2.66万

依托单位：

Kansai Medical University

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

财政年份：

2022

资助国家：

日本

项目状态：

未结题

起止时间：

2022-04-01 至 2025-03-31

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K09106/

关键词：

細菌真菌ナノポアシークエンシングマイクロバイオーム感染血液メタゲノム

项目摘要

项目成果

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英文摘要

敗血症診断においては原因菌の早期同定が治療の要となるが、標準的検査である細菌培養法は迅速性に欠け精度・感度の点でも限界を有する。我々は遺伝子解析における革新的技術であるナノポアシークエンシングを活用し、検体の取得から４時間以内に病原細菌を種レベルで同定する手法を確立した。本技術を基盤とし、血液中に存在する微生物由来DNAの包括的解析法の開発に取り組んだ。微生物同定法として頻用されるアンプリコンシークエンシングの手法においては、系統分類の指標となるマーカー遺伝子をPCRにより増幅し配列解析を行う。血液等の臨床検体にはPCRを阻害する生体由来成分が含まれることが多いことから、血中の微量細菌DNAの検出法の確立を試みた。遠心分離による細胞成分の濃縮、および混在するヒト由来DNAの選択的分解により、血中細菌DNAの高感度検出に成功した。

期刊论文(0)

专著(0)

科研奖励(0)

会议论文

Nanopore Sequencing: Methods and Protocols.

纳米孔测序：方法和方案。

DOI： --

发表时间： 2023

期刊：

影响因子： --

作者：

[Omi Masatoshi, Matsuo Yoshiyuki, Araki-Sasaki Kaoru, Oba Shimpei, Yamada Haruhiko, Hirota Kiichi, Takahashi Kanji, Arakawa K. editor]

通讯作者： Arakawa K. editor

新規チオレドキシン関連分子TMXによるレドックス制御機構の解析

批准号：

02J20128
项目类别：

Grant-in-Aid for JSPS Fellows
资助金额：

$2.11万
财政年份：

2002
负责人：

松尾禎之
依托单位：

Kyoto University (2004-2005)National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (2003)