キメラがんタンパクの多層的腫瘍関連機構の解明と治療への応用を目指した基礎研究

骨軟部腫瘍のキメラ遺伝子は組織型ごとに特異的なものが多いが、それらは腫瘍の発生や進展に関与すると考えられる。一方、そのキメラ遺伝子を構成する遺伝子は機能的に共通する特徴を持つものも多いことから、様々な骨軟部腫瘍における共通の分子機構の存在も想定される。本研究は、粘液型脂肪肉腫特異的キメラがんタンパクTLS/FUS-CHOPの新規腫瘍関連機構の解明を通じて、様々な骨軟部腫瘍に共通する分子機構の同定とそれを利用した新規治療法開発への糸口をつかむことを目的とする。1. 次世代シークエンサーを用いたTLS/FUS-CHOPの新規下流分子の同定とその機能解析。現在、RNA-seq解析において粘液型脂肪肉腫細胞でTLS/FUS-CHOPをノックダウンした際に発現変動が見られたRNA群から、腫瘍関連機構への関与が期待される既知分子群の粘液型脂肪肉腫における機能を解析中である。その結果の一部は日本分子生物学会年会で発表した。2. TLS/FUS-CHOPのサーカディアンリズムへの影響に起因する腫瘍関連機構の検討。予備的な実験によりTLS/FUS-CHOPが概日時計タンパク質DEC1を発現抑制することが示唆されたため、研究分担者の佐藤博士とともにDEC1の機能およびDEC1とTLS/FUS-CHOPとの相互作用の解析を進めている。(Sato et al., Mol. Med. Rep. 2022)。3. TLS/FUSと結合するlong noncoding RNA (lncRNA)の機能発現における腫瘍関連機構の探索。研究代表者らが作成したTLS/FUS-CHOP抗体は量が限られているため、まず、通常は発現していないCHOPの抗体をTLS/FUS-CHOP抗体と同等なものとしてRIP-seq/CLIP-seqなどで利用できないか市販のCHOP抗体を検討し、それが有効である可能性が示唆された。

骨軟部腫瘍のキメラ遺伝子は組織型ごとに特異的なものが多いが、それらは腫瘍の発生や進展に関与すると考えられる。一方、そのキメラ遺伝子を構成する遺伝子は機能的に共通する特徴を持つものも多いことから、様々な骨軟部腫瘍における共通の分子機構の存在も想定される。本研究は、粘液型脂肪肉腫特異的キメラがんタンパクTLS/FUS-CHOPの新規腫瘍関連機構の解明を通じて、様々な骨軟部腫瘍に共通する分子機構の同定とそれを利用した新規治療法開発への糸口をつかむことを目的とする。1. 次世代シークエンサーを用いたTLS/FUS-CHOPの新規下流分子の同定とその機能解析。現在、RNA-seq解析において粘液型脂肪肉腫細胞でTLS/FUS-CHOPをノックダウンした際に発現変動が見られたRNA群から、腫瘍関連機構への関与が期待される既知分子群の粘液型脂肪肉腫における機能を解析中である。その結果の一部は日本分子生物学会年会で発表した。2. TLS/FUS-CHOPのサーカディアンリズムへの影響に起因する腫瘍関連機構の検討。予備的な実験によりTLS/FUS-CHOPが概日時計タンパク質DEC1を発現抑制することが示唆されたため、研究分担者の佐藤博士とともにDEC1の機能およびDEC1とTLS/FUS-CHOPとの相互作用の解析を進めている。(Sato et al., Mol. Med. Rep. 2022)。3. TLS/FUSと結合するlong noncoding RNA (lncRNA)の機能発現における腫瘍関連機構の探索。研究代表者らが作成したTLS/FUS-CHOP抗体は量が限られているため、まず、通常は発現していないCHOPの抗体をTLS/FUS-CHOP抗体と同等なものとしてRIP-seq/CLIP-seqなどで利用できないか市販のCHOP抗体を検討し、それが有効である可能性が示唆された。