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絨毛性疾患と関連するcircularRNAの同定とその臨床的意義に関する研究

滋养细胞疾病相关环状RNA的鉴定及其临床意义研究

基本信息

批准号：
22K09622
负责人：
長谷川ゆり
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Nagasaki University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K09622/
关键词：
絨毛性疾患全胞状奇胎 circRNA 発現胎盤特異的circRNA circular RNA

项目摘要

まずは、目的としていた絨毛性疾患を対象とする前に、胎盤に特異的なcircRNAを同定するため、データベース(circBase: http://www.circbase.org/))と論文検索を行った。Gongら(S Gong, et al. Nat Commun.2021 May 11;12(1):2639)は、302例の胎盤からtotalRNAを抽出し、RNA-seqによりサンプルの30％、90％から検出される3,279個、679個のcircRNAを同定した。胎盤サンプルの100％から検出されたcircRNA (POP100)は、230種類が同定された。circRNAのデータベース (circBase: http://www.circbase.org/)を参照した。Maassら(PG Maass, et al. J Mol Med. 2017 Nov;95(11):1179-1189)の先行研究をもとに、placentaのみに発現しているcircRNA 8種類を抽出した。deciduaのみは5種類、umbilical cordのみは4種類のcircRNAが存在した。これらの検索を元にベン図を作成し、胎盤のみに発現しているcircRNAを胎盤特異的circRNAの候補とし、RT-PCRを用いてこの結果が正しいかどうかを他の組織の発現と比較した。候補としたcircRNAは1種類あり、確かに妊娠初期、末期の絨毛組織で発現を認め、羊膜、臍帯、胎児脳、胎児腎、脱落膜では発現を認めないことを確認した。現在、妊婦の血液で検出可能かどうか、絨毛性疾患ではどのように発現が認められるのかを確認実験を進めているところである。

The purpose of this study is to investigate the effects of chorionic villi disease on the development of placenta specific RNA. Gong (S Gong, et al. Nat Commun.2021 May 11;12(1):2639) reported 302 totalRNA isolated from placenta, 30% and 90% of total RNA isolated from placenta, 679 total RNA isolated from placenta. 100% of placenta samples were detected by circRNA (POP100), 230 species were identified. See circBase: http://www.circbase.org/for more information. Maass (PG Maass, et al. J Mol Med. 2017 Nov;95(11):1179-1189), a pilot study, identified eight types of circRNA. 5 types of decidua, 4 types of umbilical cord and circular RNA exist. The results of RT-PCR were compared with those of other tissues. 1. Identification of early and late pregnancy chorionic villi, amniotic membrane, umbilical cord, fetal kidney, exfoliated membrane Now, pregnant women's blood may be detected, villous diseases may be detected, and confirmation may be made.