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絶滅危惧種シマフクロウ集団の変遷史の解明および保全遺伝学的研究

濒危鱼鸮种群变迁史阐明及保护遗传学研究

基本信息

批准号：
13J01622
负责人：
表渓太
金额：
$ 1.73万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2013
资助国家：
日本
起止时间：
2013-04-01 至 2016-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

北海道のシマフクロウ集団では遺伝的多様性の低下や地域集団の分化が生じていることが、これまでの研究で示唆されてきた。現在の北海道シマフクロウの集団構造形成の歴史的な経緯の解明のために、個体数減少以前の古い剥製サンプルを含めて、マイクロサテライトおよびミトコンドリアDNA配列の分析を行った。その結果、集団の有効集団サイズが1980年前後に非常に小さくなったこと、それ以前には地域間の交流が存在していたが、その後生息地の断片化によって地域集団の孤立が生じたことが示された。さらに、過去30年間の400個体以上を対象とした解析により地域ごとの遺伝的多様性の変化や近親交配の程度をより詳細に推定した結果、近親交配が特に多い地域や一部の個体の移動が明らかになった。これらの結果をまとめた論文はZoological lettersに掲載決定となった。今年度はロシア産のサンプルも加えて分析を行い、系統関係や遺伝的多様性の比較を行った。遺伝的多様性の減少は感染症等への抵抗力の低下をもたらす恐れがある。そこで、当初の計画に加えて、免疫反応に関わる主要組織結合遺伝子複合体（MHC）の多様性についても研究を行った。定量PCR法を応用した分析の結果、シマフクロウのMHCの遺伝子座数は、一般的な鳥類や他のフクロウ類に比べて多いことが明らかになった。また染色体マッピングの結果、MHC遺伝子は単一の微小染色体上に位置することが明らかになった。これは、MHC遺伝子群は１つの染色体上の小さな領域内で重複していることを意味する。シマフクロウではMHCクラスⅡの遺伝子座数は多いが、対立遺伝子の種類は少ないことが示され、シマフクロウの保全のためには免疫力の低下についても注意が必要であることが示唆された。

The diversity of Hokkaido's population and the diversity of its geographical population are reflected in the study. Analysis of DNA alignment in Hokkaido's cluster structure formation history, including the analysis of DNA alignment in Hokkaido's cluster structure formation history, and the analysis of DNA alignment in Hokkaido's cluster structure formation history. As a result, the group has a very small group around 1980, and before that, the communication between the regions has existed, and after that, the regional group has been isolated. More than 400 individuals in the past 30 years have been analyzed for diversity in geographic areas and for the degree of inbreeding. The result of this paper is Zoological Letters. This year's survey shows that there is a wide range of research and development activities, including the analysis of system relationships and the comparison of diversity. The diversity of the disease reduces the risk of infection. The diversity of the main tissue binding gene complex (MHC) was studied in the research of the original plan and immune response. The results of quantitative PCR analysis showed that the number of MHC loci in birds and other species was higher than that in other species. The results of chromosome mapping, MHC mapping and microchromosome mapping are discussed. The MHC gene subgroup has a small number of repeats on the chromosome. The number of MHC loci is high, and the number of species of MHC loci is low.