サンゴガニ属の系統推定に有用な固体発生パターンの探索

探索可用于珊瑚蟹属系统发育估计的实体发生模式

• 批准号: 08760185
• 负责人: 鹿谷 法一
• 金额: $ 0.64万
• 依托单位: University of the Ryukyus
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08760185/
• 关键词: Trapezia; mtDNA; 16S rRNA; molecular phylogeny; ontogeny; crab; zoea

カニ類のゾエア幼生の備える様々な付属肢の固体発生パターンの共有状態は、カニ類の類緑関係を類推できる可能性を示唆している。そこで、mtDNA塩基配列を直接解析する方法を用いて系統樹を構築し、これに従って幼生発生形質を整理することで、サンゴガニ類の類緑関係を類推する場合に有効と思われる複数の幼生形質を明らかにする。分析資料には、Trapezia属3種とTetralia属1種を用いた。抽出方法や抽出組織の検討、また、PCRに際してプライマー、温度、テンプレート濃度等について検討を加えた。ダイタ-ミネーター反応を用いて、ミトコンドリアDNAの16S,rRNA遺伝子領域の塩基配列を決定し、rRNAの二次構造を考慮にいれた多重アライメントを行ない、塩基サイトの相同性を確認した。分子系統学的分析による系統樹の推定には、最節約法(MP法、LogDet法)、最尤法(ML法)、近隣結合法(NJ法)を用いた。系統樹の各枝の信頼性を検討するため、ブートストラップを行なった。サンゴガニ類について、PCRならびにシークエンスの方法を新たに確立することで、全ての種において16SrRNAのほぼ半分に当たる約490塩基配列を決定した。多重アライメントの結果、484塩基の相同性が確認された。4つの異なる解析方法によって得られた系統樹のトポロジーは完全に一致し、生態の形態による分類と一致していた。幼生の発生パターンでは、側棘、触角、顎脚、腹部等の発達過程で対応が見られた。残る全てのサンゴガニ類の系統を明らかにすることで、さらに詳しい固体発生パターンの有用性が見い出せれば、それは多くの幼生発生情報が蓄積された十脚甲殻類(エビ、カニ、ヤドカリ)の系統を論ずるうえで、簡便な手法として大変有効なものとなる。

カニkind のゾエア小生の备える様々な annexed limb のsolid 発生 パターンの公There are status は, カニ class の class green relationship を analogy で き る possibility を indication し て い る.そこで、mtDNA base arrangement is directly analyzed and constructed using いて phylogenetic tree. Reason することで, サンゴガニkindのsimilar green relationshipをanalogyするoccasionにeffectiveと思われるpluralのyoung form qualityを明らかにする. The analysis data shows that 3 species of the genus Trapezia and 1 species of the genus Tetralia are used. The extraction method includes extraction of tissue, PCR, temperature, concentration of tissue, etc.ダイタ-ミネーターreverse いて, ミトコンドリアDNAの16S, rRNA genetic sub-domain base alignment The secondary structure of rRNA has been determined and considered, and the identity of the multiplexed structures has been confirmed. Molecular phylogenetic analysis includes the estimation of phylogenetic trees, the most parsimonious method (MP method, LogDet method), the optimal method (ML method), and the nearest neighbor method (NJ method). Each branch of the phylogenetic tree has its own characteristics.サンゴガニ级について、PCRならびにシークエンスのmethodを新たにEstablishmentすることで, all kinds of 16SrRNA half-divided 16SrRNA is determined when it is about 490 bases. Multiple アライメントの results, 484 base no identity confirmation された. 4つのdifferent analysis method is the same as the phylogenetic tree, and the ecological morphological classification is consistent. The growth process of juvenile urinary tracts, lateral spines, antennae, jaws, legs, abdomen, etc. The complete system of the complete system of the system is clear and the system is detailed. The usefulness of solid 発生パターのが见い出せれば、それは多くのyoung生発生 information が accumulates された十 crustaceans (エビ、カニ、ヤドカリ)のThe system is simple and effective, and the technique is simple and effective.