ヌクレオソームコア粒子とMeCP2、SUV39H1三者複合体の構造解析
核小体核心颗粒、MeCP2和SUV39H1三元复合物的结构分析
基本信息
- 批准号:22KJ2566
- 负责人:
- 金额:$ 1.41万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2023
- 资助国家:日本
- 起止时间:2023-03-08 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
MeCP2とH3K27me3修飾ヌクレオソームのクライオ電子顕微鏡による単粒子解析を行った結果、MeCP2の密度マップが得られず、MeCP2のどの領域が結合に関与しているのかが分からなかった。そのため、クライオ電子顕微鏡以外の方法で結合領域を特定することを試みた。MeCP2とH3K27me3修飾ヌクレオソームの結合領域を明らかにするため、クロスリンク質量分析を行った。解析の結果、3箇所に架橋が検出された。そのうち、2箇所に関して、MeCP2の180番目のリジンがH2A、H2Bの距離的に離れた領域と架橋していることがわかった。このことから、MeCP2はフレキシブルにヌクレオソームと結合している可能性が示唆された。今後はより多くの架橋を検出するため、架橋条件やサンプル調製条件、測定条件などを検討していく。クライオ電子顕微鏡による観察の結果、MeCP2-H3K27me3修飾ヌクレオソームは特徴的な構造を取っていることが明らかになった。また、構造のバラエティも豊富であり、MeCP2の構造の柔軟性がこのことに影響を及ぼしている可能性が考えられる。この複合体構造が、溶液中でも形成されるのか、今後マスフォトメトリーなど別の手法を用いて証明する予定である。また、MeCP2のどの領域がこの複合体形成に重要であるかを調べるため、現在H3K27me3修飾ヌクレオソーム結合に重要だとわかっているMeCP2のC末端領域を50アミノ酸残基ずつ欠損させた変異体を作製、調製した。この変異体MeCP2をH3K27me3修飾ヌクレオソームと混合し、クライオ電子顕微鏡で観察することで、MeCP2のどの領域が複合体形成に重要なのかを調べる予定である。
MeCP2 and H3K27 me3 modified microscopes were used to analyze individual particles. The density of MeCP2 was determined. The domain of MeCP2 was determined. There is no way to combine fields other than electron micromirrors. MeCP2 and H3K27 me3 modify the binding domain of the software to determine the quality of the software. The analysis results, three bridges were detected. The distance between H2A and H2B is 180 degrees. The distance between H2A and H2B is 180 degrees. This is the first time that MeCP2 has been able to combine all of its components. In the future, bridge conditions, modulation conditions and measurement conditions will be discussed. MeCP2-H3K27me3 modification of the structure of the electron microscope. The structural flexibility of MeCP2 and its influence on the structure and the possibility of its transformation are examined. The structure of the complex, the formation of the complex in solution, and the subsequent use of different methods to prove the predetermined MeCP2 domain is important for the formation of this complex. H3K27 me3 modification is important for the binding of MeCP2 C-terminal domain. 50 amino acid residues are not present in the complex. This heterogeneous MeCP2 H3K27 me3 modification is observed by electron microscopes, and the MeCP2 domain is important for complex formation.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
メチル化DNA結合タンパク質MeCP2のH3K27me3ヌクレオソーム結合部位の同定
甲基化 DNA 结合蛋白 MeCP2 的 H3K27me3 核小体结合位点的鉴定
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:牛島弘嗣;小沼剛;明石知子
- 通讯作者:明石知子
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
牛島 弘嗣其他文献
牛島 弘嗣的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
相似海外基金
慢性炎症によるヌクレオソーム振動の分子機構
慢性炎症引起核小体振动的分子机制
- 批准号:
24K02310 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
細胞外ヌクレオソームによる炎症誘発機構の構造的基盤
细胞外核小体炎症诱导机制的结构基础
- 批准号:
24K18462 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
エピジェネティクス制御によるヌクレオソーム高次構造形成とその意義の解明
表观遗传控制核小体高阶结构的形成及其意义的阐明
- 批准号:
24K08830 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
転写と共役したヌクレオソーム再構築の分子メカニズムの解明
阐明转录偶联核小体重塑的分子机制
- 批准号:
23K20300 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
熱帯熱マラリア原虫ヌクレオソームの構造と生化学的性質の解析
恶性疟原虫核小体的结构和生化特性分析
- 批准号:
24K09411 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
血中循環ヌクレオソーム結合DNAにおける大腸癌関連遺伝子及びエピゲノムの網羅的解析
循环核小体结合DNA中结直肠癌相关基因和表观基因组的综合分析
- 批准号:
24K10289 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
インターカレーターが引き起こすDNA・ヌクレオソーム構造変化メカニズム解析
嵌入剂引起DNA/核小体结构变化的机制分析
- 批准号:
23K05726 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ペプチド核酸による二本鎖DNA認識の構造学的解析と遺伝子工学応用
肽核酸识别双链DNA的结构分析及基因工程应用
- 批准号:
22KJ1567 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
植物におけるエピジェネティクス関連酵素のスクリーニング法の確立
植物表观遗传学相关酶筛选方法的建立
- 批准号:
22KJ0120 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
細胞内のクロマチンにおける多様な転写機構の構造基盤
细胞内染色质多种转录机制的结构基础
- 批准号:
23K17392 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)