ペプチド核酸による二本鎖DNA認識の構造学的解析と遺伝子工学応用
肽核酸识别双链DNA的结构分析及基因工程应用
基本信息
- 批准号:22KJ1567
- 负责人:
- 金额:$ 1.09万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2023
- 资助国家:日本
- 起止时间:2023-03-08 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
ペプチド核酸(PNA)は「インベージョン」と呼ばれる二本鎖DNAとの特徴的な結合様式が可能であり、生体内での二本鎖DNAの配列選択的な認識技術として応用が期待されている。本申請課題では、これまで詳細な立体構造が解明されていないインベージョン複合体について構造学的な分析に取り組み、二本鎖DNAを制御する基盤技術への展開を目指す。本年度はインベージョン複合体のX線結晶構造解析に取り組んだ。研究開始当初に設計したインベージョン複合体で得た結晶は安定性が低く、結晶化までに時間を要したためサンプルの再設計を行った。二本鎖DNAおよびPNAの鎖長をそれぞれ短縮し、さらにPNA/DNAの2か所の相補領域を同一の塩基配列として簡略化を行うことで、サンプル調製から結晶化スクリーニングまでの工程を迅速化した。また、測定条件において安定な結晶を得ることに成功した。また、インベージョン複合体の部分構造となるPNA/DNA二本鎖のX線結晶構造解析に取り組んだ。多波長異常散乱法での解析のため、チミン塩基と同様の塩基対形成が可能かつ、臭素原子を有するウラシル塩基誘導体を原料としてPNAモノマーを合成した。これを用いた固相合成により、PNAオリゴマーの合成、精製まで完了し、結晶化スクリーニングに取り組んでいる。真核生物の生体内のDNA のモデルとして、ヒストンタンパク質とDNA を人工的に複合化した再構成ヌクレオソームを標的とし、PNAによるインベージョンが可能か検証した。ヒストンタンパク質と二本鎖DNAが相互作用する複数の領域を標的として、蛍光標識PNAを合成した。ゲル電気泳動によって複合体の形成を評価した結果、ヒストンタンパク質と複合化していない二本鎖DNAに対してはインベージョン複合体が形成した一方で、ヌクレオソームに対しては複合体の形成がみられず、全く異なる挙動を確認した。
ペ プ チ ド nucleic acid (PNA) は "イ ン ベ ー ジ ョ ン" と shout ば れ る 2 lock DNA と の な combined with others in type of 徴 が may で あ り, born in vivo で の 2 lock の DNA match column sentaku な understanding technology と し て 応 with が expect さ れ て い る. This application subject で は, こ れ ま で な detailed three-dimensional structure が interpret さ れ て い な い イ ン ベ ー ジ ョ ン complex に つ い て tectonics な analysis に み り group, 2 lock DNA を suppression す る base plate technology へ を mesh refers to す の. Analysis of the <s:1> X-ray crystal structure of the んだ and <s:1> ベ and ジョ ジョ complexes in this year に take the んだ group んだ. Research started at the beginning に design し た イ ン ベ ー ジ ョ ン complex で た crystal は low stability が く, crystallization ま で に time を し た た め サ ン プ ル の redesign を line っ た. 2 lock DNA お よ び PNA の lock long を そ れ ぞ れ shortening し, さ ら に PNA/DNA の 2 か の fill phase field を same の salt base with column と し て briefly the line を う こ と で, サ ン プ ル modulation か ら crystallization ス ク リ ー ニ ン グ ま で の engineering を quickly turn し た. Youdaoplaceholder0, determination conditions にお て て stabilization な crystallization を る る とに とに success た た. Youdaoplaceholder0, <s:1> ベ ジョ ジョ ジョ <s:1> partial structure of the <s:1> complex となる analysis of X-ray crystallization structure of PNA/DNA binary lock <s:1> に take the <s:1> set んだ. Multiwavelength abnormal scattered method で の parsing の た め, チ ミ ン salt base と with others の salt base may form が seaborne か つ, smelly, atomic を す る ウ ラ シ ル salt induced を raw materials base と し て PNA モ ノ マ ー を synthetic し た. こ れ を with い た solid-phase synthesis に よ り, PNA オ リ ゴ マ ー の synthesis, refined ま で finished し, crystallization ス ク リ ー ニ ン グ に group take り ん で い る. Eukaryotes の raw の DNA in vivo の モ デ ル と し て, ヒ ス ト ン タ ン パ ク qualitative と DNA を artificial composite に し た reconstitution ヌ ク レ オ ソ ー ム を mark と し, PNA に よ る イ ン ベ ー ジ ョ ン が may か 検 card し た. ヒ ス ト ン タ ン パ ク qualitative と 2 lock DNA が interaction す る plural の field を mark と し て 蛍 light logo PNA を synthetic し た. ゲ ル electric 気 swimming に よ っ て complex の form を review 価 し た results, ヒ ス ト ン タ ン パ ク mass composite と し て い な い 2 lock DNA に し seaborne て は イ ン ベ ー ジ ョ ン complex が form し た で, ヌ ク レ オ ソ ー ム に し seaborne て は complex の form が み ら れ ず, whole く different な る 挙 dynamic を confirm し た.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
New Design of Peptide Nucleic Acids Recognizng Double-Stranded DNA
识别双链DNA的肽核酸的新设计
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:M. Shibata;Y. Aiba;M. Hibino;O. Shoji
- 通讯作者:O. Shoji
二本鎖DNAとのインベージョン複合体形成におけるparallel配向ペプチド核酸の特性評価
双链 DNA 入侵复合物形成中平行定向肽核酸的表征
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:柴田将成;愛場雄一郎;日比野柾;荘司長三
- 通讯作者:荘司長三
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
柴田 将成其他文献
DNA 認識を目指した核酸塩基修飾 α ヘリックスペプチドの開発
开发用于 DNA 识别的核碱基修饰 α-螺旋肽
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
塩澤 駿清;愛場 雄一郎;柴田 将成;有安 真也;荘司 長三 - 通讯作者:
荘司 長三
核酸認識を目指した核酸塩基修飾ペプチドの開発
用于核酸识别的核碱基修饰肽的开发
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
塩澤 駿清;愛場 雄一郎;柴田 将成;有安 真也;荘司 長三 - 通讯作者:
荘司 長三
柴田 将成的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
相似国自然基金
一段式PNA-DAMO生物膜的快速形成机制及脱氮功能微生物互作关系研究
- 批准号:
- 批准年份:2022
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
后国6阶段柴油车高效PNA和ASC催化技术基础研究
- 批准号:
- 批准年份:2022
- 资助金额:54 万元
- 项目类别:面上项目
PNA介导可视化预靶向肿瘤的新型PRRT:177Lu-DOTA-PNA2/PNA1-EB-RGD
- 批准号:82102093
- 批准年份:2021
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
161Tb标记的PNA导向预靶向放射性免疫治疗药物研究
- 批准号:22176182
- 批准年份:2021
- 资助金额:60 万元
- 项目类别:面上项目
PNA耦合SCRF降低柴油机尾气NOx及PM的机理研究
- 批准号:51876028
- 批准年份:2018
- 资助金额:60.0 万元
- 项目类别:面上项目
基于液相CH3-HS疏水结构域表征和PNA侵袭特性为基础的DNA甲基化定量分析关键技术研究
- 批准号:81873982
- 批准年份:2018
- 资助金额:57.0 万元
- 项目类别:面上项目
基于DNA/PNA纳米技术的可调控传感界面构建及在ctDNA检测中的应用
- 批准号:21804122
- 批准年份:2018
- 资助金额:26.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
利用PNA自组装技术进行多功能放射性药物的合成研究
- 批准号:21701155
- 批准年份:2017
- 资助金额:25.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
基于双重PNA钳制反应的循环肿瘤DNA突变检测新方法及其在肿瘤靶向治疗中的应用评价
- 批准号:81401745
- 批准年份:2014
- 资助金额:23.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
应用强磁场装置研究肽核酸PNA与端粒DNA形成的G四联体结构及其对端粒酶的抑制机理
- 批准号:U1232145
- 批准年份:2012
- 资助金额:60.0 万元
- 项目类别:联合基金项目
相似海外基金
三重鎖形成PNAによる次世代RNAウイルス感染診断・阻害剤スクリーニング技術の創製
利用三链体形成的PNA创建下一代RNA病毒感染诊断和抑制剂筛选技术
- 批准号:
23H00297 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.09万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
ペプチド核酸(PNA)による細胞内核酸操作技術の開発
使用肽核酸(PNA)开发细胞内核酸操作技术
- 批准号:
22K05350 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 1.09万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Collaborative Research: Nucleobase-Modified PNA for Sequence Selective Triple-Helical Recognition of Non-Coding RNA
合作研究:核碱基修饰的 PNA 用于非编码 RNA 的序列选择性三螺旋识别
- 批准号:
2107911 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 1.09万 - 项目类别:
Standard Grant
Collaborative Research: Nucleobase-Modified PNA for Sequence Selective Triple-Helical Recognition of Non-Coding RNA
合作研究:核碱基修饰的 PNA 用于非编码 RNA 的序列选择性三螺旋识别
- 批准号:
2107900 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 1.09万 - 项目类别:
Standard Grant
Comprehensive Upgrade of CIARS PNA X Network Analyzers
CIARS PNA X网络分析仪全面升级
- 批准号:
RTI-2021-00310 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 1.09万 - 项目类别:
Research Tools and Instruments
Delivery of chemically modified PNA oligomers
化学修饰的 PNA 寡聚物的递送
- 批准号:
10006671 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 1.09万 - 项目类别:
PNA Nanoparticles for Gene Editing In Vivo
用于体内基因编辑的 PNA 纳米颗粒
- 批准号:
10198735 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 1.09万 - 项目类别:
Protein-PNA conjugates as conditional BRET platforms for life cell mRNA imaging and quantification
蛋白质-PNA 缀合物作为用于生命细胞 mRNA 成像和定量的条件 BRET 平台
- 批准号:
423428279 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 1.09万 - 项目类别:
Research Grants
Development of novel environmentally sensitive fluorescent PNA probes
新型环境敏感荧光 PNA 探针的开发
- 批准号:
19K05700 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 1.09万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)














{{item.name}}会员




