シグナル伝達の数理モデルとゲノム比較の融合によるERKシグナル特性の網羅的解明

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本年度は予定としては特定された重要なパラメータに対応する因子およびその変異体をヒトHeLa細胞・カエルA6細胞に発現させ(生育温度の違いを考慮する)、蛍光タンパク質を付属させたシグナル伝達因子をコードするプ ラスミドを一過的に導入して生化学パラメータを測定するつもりだった。過去2年間に報告された研究から、タンパク質間の生化学パラメータ（反応速度定数と解離定数）を機械学習によって精確に予測できる見込みがあったため、試行を行った。しかし、結果的にはまだうまく機能しないと結論づけざるを得なかった。本年度はin silicoでの予測に特化したため、in vivoでのパラメータ測定には至らなかった。今後はin vivoでのパラメータ測定実験に移行する予定である。理論的に予測されたERKシグナル伝達系が持つシグナル伝達特性（線形性etc.）に強く影響するパラメータと弱い影響しか持たないパラメータを3つずつ抜き出し、ヒト培養細胞・カエル培養細胞においてパラメータ値を測定する。パラメータ値の差分を正規化し、シグナル伝達特性の保存度を定量・比較する。