シグナル伝達の数理モデルとゲノム比較の融合によるERKシグナル特性の網羅的解明

结合信号转导数学模型和基因组比较全面阐明ERK信号特征

• 批准号: 21J15051
• 负责人: 向井 正哉
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: The Graduate University for Advanced Studies
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-28 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21J15051/
• 关键词: パラメータ感受性; ERKシグナル伝達系; 進化的保存

本年度は予定としては特定された重要なパラメータに対応する因子およびその変異体をヒトHeLa細胞・カエルA6細胞に発現させ(生育温度の違いを考慮する)、蛍光タンパク質を付属させたシグナル伝達因子をコードするプ ラスミドを一過的に導入して生化学パラメータを測定するつもりだった。過去2年間に報告された研究から、タンパク質間の生化学パラメータ（反応速度定数と解離定数）を機械学習によって精確に予測できる見込みがあったため、試行を行った。しかし、結果的にはまだうまく機能しないと結論づけざるを得なかった。本年度はin silicoでの予測に特化したため、in vivoでのパラメータ測定には至らなかった。今後はin vivoでのパラメータ測定実験に移行する予定である。理論的に予測されたERKシグナル伝達系が持つシグナル伝達特性（線形性etc.）に強く影響するパラメータと弱い影響しか持たないパラメータを3つずつ抜き出し、ヒト培養細胞・カエル培養細胞においてパラメータ値を測定する。パラメータ値の差分を正規化し、シグナル伝達特性の保存度を定量・比較する。

This year's important factor is determined to be specific and important in the current year. A6 cells are exposed (the temperature of growth is violated and considered), the quality of the cells is reduced and the growth factor is reduced The ラスミドをone-passed にしてbiochemical パラメータをdetermination するつもりだった. In the past 2 years, we have reported on the research and development of biochemistry in the interstitial space (reaction rate fixed number). Dissociation fixed number) を Mechanical learning に よ っ て Precision で き る 见込 み が あ っ た た め、 Trial を 行 っ た.しかし、The result of the にはまだうまく function しないと Conclusion づけざるを got なかった. This year's in-silico prediction and specialization, in-vivo measurement and measurement. From now on, it will be determined that the in vivo test will be carried out in vivo. Theoretical Predictions ERK ERK シグナル伝da system holder つシグ ナル伝da characteristics (linearity, etc.) にstrong く influence するパラメータとweakいInfluenceしかholdたないパラメータを3つずつ抜き出し、ヒト Pei Cultured cells・カエルcultivated cellsにおいてパラメータ値をmeasurementする.パラメータ値のdifferenceをNormalizationし、シグナル伝Da characteristicのpreservationをquantification・comparisonする.