Physics and economics for microbial ecology and cellular metabolism
Physics and economics for microbial ecology and cellular metabolism
批准号:
22KJ0698
负责人:
山岸 純平
金额:
$1.6万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2023
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2023-03-08 至 2024-03-31
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英文摘要
2021年度は、リモートワーク(自宅での作業、オンラインでの議論や発表)を主として、2つのテーマについての研究活動を進めた。いずれにおいても、数値計算では主にC/C++、Python、Mathematicaなどを使用し、研究(II)では代謝系のデータベースなども参照した。・研究(I)「微生物生態系の構造や安定性についての力学系理論および統計物理学の視点からの研究」英語論文や日本語の依頼記事が出版され、国際学会でのオンライン口頭発表を行った。また、微生物生態系の定常状態における摂動応答の理論の構築にも取り組み、得られた結果を取りまとめて日本物理学会での口頭発表を行った。これは、「化学反応-細胞-生態系」という3階層のダイナミクスからなる力学系モデルに対して線形安定性解析(Jacobi行列の解析)や主成分分析などを数値的および解析的に適用することで、生態系における複数細胞種の共存や適応・進化の帰結としてその定常状態が有する構造や生態系全体の摂動応答と各細胞の摂動応答との関係を明らかにするための研究である。・研究(II)「細胞内代謝系の制御について経済学および熱力学の視点から」細胞の代謝制御をミクロ経済学の立場から捉える「代謝経済学」と名付けた新規な理論についての英語論文が出版された。また、その理論を一般化するとともに、解析計算から得られた「質的に異なる摂動応答について、任意の代謝反応ネットワークにおいて普遍的に成り立つ関係式」の有効性を大自由度の代謝反応ネットワーク(E. Coli Coreモデル)の数値計算を通して確かめた。得られた結果について日本物理学会などでの口頭発表を行い、英語論文の執筆を行った。
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増殖細胞の代謝応答における一般法則
增殖细胞代谢反应的一般规律
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Jumpei F. Yamagishi, Nen Saito, and Kunihiko Kaneko, 山岸純平,畠山哲央]
通讯作者:
山岸純平,畠山哲央
The advantage of leakage of essential metabolites and resultant symbiosis of diverse microbes
必需代谢物泄漏和由此产生的多种微生物共生的优势
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Jumpei F. Yamagishi, Nen Saito, and Kunihiko Kaneko]
通讯作者:
and Kunihiko Kaneko
Microbial Symbiosis through Advantageous Leakage of Essential Metabolites
通过必需代谢物的有利泄漏实现微生物共生
DOI:
10.2142/biophys.61.400
发表时间:
2021
期刊:
Seibutsu Butsuri
影响因子:
--
作者:
[山岸 純平, 斉藤 稔, 金子 邦彦]
通讯作者:
金子 邦彦
Microbial Potlatch: The advantage of leakage of essential metabolites and resultant symbiosis of diverse species
微生物夸富宴:必需代谢物泄漏和不同物种共生的优势
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Jumpei F. Yamagishi, Nen Saito, and Kunihiko Kaneko]
通讯作者:
and Kunihiko Kaneko
複合体形成を伴う触媒反応ネットワークにおける指数成長と休眠状態の転移
具有复杂形成的催化反应网络中的指数增长和休眠状态转变
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山岸純平, 金子邦彦]
通讯作者:
金子邦彦
共 6 条
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