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LINE-Retrotranspositions-Phylogenie der Vögel (Aves)

LINE-Retrotranspositions-Phylogenie der Vögel (Aves)
鸟类 (Aves) 的 LINE 逆转录转座系统发育
批准号:
80218076
负责人:
Privatdozent Dr. Jürgen Schmitz, since 3/2009
金额:
$0.0万
依托单位:
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2008
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2007-12-31 至 2012-12-31

项目摘要

项目成果

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Die Verwandtschaftsbeziehungen zwischen Vogelordnungen sind bis heute zu weiten Teilen ungeklärt. So gibt es zahlreiche auf Morphologie oder molekularen Methoden beruhende Analysen, die einander in vielen Punkten widersprechen. Diese Widersprüche kommen durch Homoplasien im Datensatz zustande, also Merkmale, die sekundär verloren oder unabhängig erworben wurden und damit zu fehlerhaften Ergebnissen führen. Im hier beantragten Projekt möchten wir die ungelösten Fragen des Vogel-Stammbaums anhand „springender Gene“ lösen, die einmal in einem gemeinsamen Vorfahren im Genom inseriert, die Zusammengehörigkeit abstammender Arten belegen. Verfügbare genomische Sequenzen von Zebrafink und Kondor sowie von uns partiell sequenzierte Genome von Haustaube und Kormoran sollen bioinformatisch analysiert werden. Die informativen Genorte werden dann in einem breiten Artenspektrum experimentell analysiert. In umfangreichen Vorarbeiten zu dem hier beantragten Projekt konnten wir bereits diverse Verzweigungen durch „springende Gene“ definieren. Dies zeigt, dass mit dieser Methode die Klärung tiefer ebenso wie junger Äste des Vogel-Stammbaumes ein realisierbares Ziel ist.
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1093/molbev/mss124
发表时间: 2012-10
期刊: Molecular biology and evolution
影响因子: 10.7
作者: [Alexander Suh;J. Kriegs;S. Donnellan;J. Brosius;J. Schmitz]
通讯作者: Alexander Suh;J. Kriegs;S. Donnellan;J. Brosius;J. Schmitz
DOI: 10.1038/ncomms2798
发表时间: 2013-04
期刊: Nature Communications
影响因子: 16.6
作者: [Alexander Suh;J. Brosius;J. Schmitz;J. Kriegs]
通讯作者: Alexander Suh;J. Brosius;J. Schmitz;J. Kriegs
Retroposon insertions and the chronology of avian sex chromosome evolution.
逆转录子插入和鸟类性染色体进化的年表
DOI: 10.1093/molbev/msr147
发表时间: 2011
期刊: Molecular biology and evolution
影响因子: 10.7
作者: [Kriegs JO, Brosius J, Schmitz J]
通讯作者: Schmitz J