matK遺伝子の塩基配列による日本産野生バラの系統解析

使用 matK 基因的核苷酸序列对日本野玫瑰进行系统发育分析

• 批准号: 09660018
• 负责人: 上田 善弘
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09660018/
• 关键词: バラ; 日本産野生種; 系統解析; matK遺伝子; ITS領域; 系統分類; 葉緑体DNA

(1)日本産バラ属野生種のほとんどを含む15分類群とその他アジア産の種を中心とする19分類群の併せて34分類群につき、matK遺伝子の塩基配列を解析し、分子系統樹を作製した。ノイバラを始めとする日本産野生種を多く含むSynstylae節のすべての種と中国産のIndicae節の種が一つの分岐群を形成し、これらの2節が近縁であること、花柱形質(花柱ががく筒から突出する)が重要な分類指標であることが分かった。それに対して、オオタカネイバラ、ハマナスなどを含む、Rosa節はいくつかの分岐群に分かれ、多系統である可能性が示された。特にオオタカネイバラは他のRosa節の種とは大きく分けられた。また、ハマナスはカラフトイバラと分岐群を形成し近縁であることが示された。(2)matK遺伝子の解析と同様に日本産バラ属野生種の15分類群とその他の15分類群の併せて30分類群につき、ITS領域の塩基配列を解析し、分子系統樹を作製した。Synstylae節のすべての種が一つの分岐群を形成し、本節を特徴付ける花柱形質(花柱が突出し融合する)が重要な分類指標であることが分かった。本節中、ヤマイバラは栽培バラの重要な祖先種、R.moschataと類縁性が高いことが示され、この種の育種的利用価値の高さを裏付ける結果となった。Rosa節はmatk解析同様、いくつかの分岐群に分かれ、多系統である可能性が示された。このうち、オオタカネイバラはサンショウバラおよびナニワイバラと分岐群を形成し、これらの分類群間の類縁関係についての見直しの必要性が示された。当初の計画に新たにITS領域の解析が加わったが、matK遺伝子と併せ、日本産野生バラの分類学的位置付けとそれらの問題点を明らかにすることができた。今後は、両遺伝子によって充分な解析ができなかった分類群について新たな遺伝子の検索が必要と思われる。

(1) Japan's wild species of the genus Hakura contains 15 taxa and is produced in Japan, and the center of the species is 19 Taxonomic classification of 34 taxonomic groups, analysis of matK base alignment, and production of molecular phylogenetic trees.ノイバラを开 start めとするJapanese wild species を多く中むSynstylae Festival のすべてのkind とChina-produced のIndicae Festival の species が一つの Branch Group を formation し, こ れ ら の 2 knots が near 縁 で あ る こ と, style morphology (style が が く tube か ら す る) are important な classification indicators で あ る こ と が か っ た.それに対して、オオタカネイバラ、ハマナスなどをHanむ、Rosa The section is divided into groups, and the possibility of multi-system is shown.特にオオタカネイバラはhis のRosa Festivalのkindとは大きく分けられた.また, ハマナスはカラフトイバラと Branch group をforms しNearly縁であることが Shows された. (2) analysis of matK inheritance and genus wild species, 15 taxa of Japanese wild species, 15 taxa and 30 taxa, analysis of base alignment in the field of ITS, and production of molecular phylogenetic trees. Synstylae Festivalのすべてのkindが一つの Branch groupをformationし、This sectionを特徴PayけStyle quality (style protrusion and fusion) is an important classification index. In this section, the important ancestral species of ヤマイバラは cultivated バラの, R. moschata and the class natureが高いことがshowされ、このkindの Breeding Utilization価値の高さを里发けるRESULTSとなった. Rosa knot matk analysis is the same as 様, いくつかのdivergent group に分かれ, multi-system であるpossibility がshow された.このうち、オオタカネイバラはサンショウバラおよびナニワイバラと分岐群をIt is necessary to form a categorical relationship between taxa and categorical groups. The original plan was new and the analysis of the ITS field was added and matK was completed. The taxonomic position of the native wild バラの is a problem. From now on, it is necessary to analyze the taxonomic group that has been fully analyzed and to think about it in the future.