matK遺伝子の塩基配列による日本産野生バラの系統解析

使用 matK 基因的核苷酸序列对日本野玫瑰进行系统发育分析

• 批准号: 09660018
• 负责人: 上田 善弘
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09660018/
• 关键词: バラ; 日本産野生種; 系統解析; matK遺伝子; ITS領域; 系統分類; 葉緑体DNA

(1)日本産バラ属野生種のほとんどを含む15分類群とその他アジア産の種を中心とする19分類群の併せて34分類群につき、matK遺伝子の塩基配列を解析し、分子系統樹を作製した。ノイバラを始めとする日本産野生種を多く含むSynstylae節のすべての種と中国産のIndicae節の種が一つの分岐群を形成し、これらの2節が近縁であること、花柱形質(花柱ががく筒から突出する)が重要な分類指標であることが分かった。それに対して、オオタカネイバラ、ハマナスなどを含む、Rosa節はいくつかの分岐群に分かれ、多系統である可能性が示された。特にオオタカネイバラは他のRosa節の種とは大きく分けられた。また、ハマナスはカラフトイバラと分岐群を形成し近縁であることが示された。(2)matK遺伝子の解析と同様に日本産バラ属野生種の15分類群とその他の15分類群の併せて30分類群につき、ITS領域の塩基配列を解析し、分子系統樹を作製した。Synstylae節のすべての種が一つの分岐群を形成し、本節を特徴付ける花柱形質(花柱が突出し融合する)が重要な分類指標であることが分かった。本節中、ヤマイバラは栽培バラの重要な祖先種、R.moschataと類縁性が高いことが示され、この種の育種的利用価値の高さを裏付ける結果となった。Rosa節はmatk解析同様、いくつかの分岐群に分かれ、多系統である可能性が示された。このうち、オオタカネイバラはサンショウバラおよびナニワイバラと分岐群を形成し、これらの分類群間の類縁関係についての見直しの必要性が示された。当初の計画に新たにITS領域の解析が加わったが、matK遺伝子と併せ、日本産野生バラの分類学的位置付けとそれらの問題点を明らかにすることができた。今後は、両遺伝子によって充分な解析ができなかった分類群について新たな遺伝子の検索が必要と思われる。

(1)The gene sequences of the wild species of Japanese species were analyzed and the phylogenetic tree was constructed. Japanese wild species include Synstylae, China Indicae, and Chinese wild species are classified into two groups. The two groups are close to each other. The style is prominent. The possibility of multiple systems is shown. The most important thing is that we have to be careful. A group of groups is formed. (2) Analysis and homology of matK genes in 15 taxa and other 15 taxa of Japanese wild species, analysis of base alignment in ITS domain, and construction of molecular phylogenetic tree. Synstylae are characterized by the formation of a divergent group of species, and their style quality (style prominence) is an important taxonomic indicator. In this section, the important ancestral species of R.moschata and R.moschata are highly valued, and the utilization value of these species is highly valued. Rosa section matk analysis identity, middle This paper shows the necessity of the classification relationship between taxa and taxa. The analysis of the new domain in the original project is based on the taxonomic position of the Japanese wild species and the problem points. In the future, it will be necessary to fully analyze the taxa of the genus and the genus.