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植物で最も動的な花弁運動に着目したバラ科樹木の開花日制御機構の解明

植物で最も動的な花弁運動に着目したバラ科樹木の開花日制御機構の解明
以植物中最动态的花瓣运动为重点，阐明蔷薇科树木的开花日期控制机制
批准号：
22K19192
负责人：
白澤 健太
金额：
$4.16万
依托单位：
Kazusa DNA Research Institute
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2022-06-30 至 2024-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19192/
关键词：
サクラトランスクリプトーム解析開花日

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
トランスクリプトームデータの収集の効率化を図るためにRNAの抽出法を比較検討し、多検体から短時間でRNAを簡易抽出する方法を確立した。この方法で「ソメイヨシノ」の複数年次のつぼみからRNAを抽出し、経時的なトランスクリプトームのデータを収集した。また、全国の「ソメイヨシノ」の全ゲノム解析を通して、同じ「ソメイヨシノ」であっても体細胞突然変異によりゲノムの塩基配列にわずかな違いがあること、そしてその一部は遺伝子機能に影響を及ぼす可能性が高いことを見出した。遺伝的に均一だと考えられている「ソメイヨシノ」において、このような体細胞突然変異は遺伝的なノイズとなりうる。さらに遺伝背景の異なるサクラ品種の開花制御機構を探るために遺伝解析集団を作成し、開花日関連遺伝子の特定に向けた遺伝解析に着手した。
英文摘要
トランスクリプトームデータの収集の効率化を図るためにRNAの抽出法を比較検討し、多検体から短時間でRNAを簡易抽出する方法を確立した。この方法で「ソメイヨシノ」の複数年次のつぼみからRNAを抽出し、経時的なトランスクリプトームのデータを収集した。また、全国の「ソメイヨシノ」の全ゲノム解析を通して、同じ「ソメイヨシノ」であっても体細胞突然変異によりゲノムの塩基配列にわずかな違いがあること、そしてその一部は遺伝子機能に影響を及ぼす可能性が高いことを見出した。遺伝的に均一だと考えられている「ソメイヨシノ」において、このような体細胞突然変異は遺伝的なノイズとなりうる。さらに遺伝背景の異なるサクラ品種の開花制御機構を探るために遺伝解析集団を作成し、開花日関連遺伝子の特定に向けた遺伝解析に着手した。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
小石川植物園のソメイヨシノ老木の全ゲノム解析
小石川植物园老吉野樱花树的全基因组分析
DOI： --
发表时间： 2023
期刊：
影响因子： --
作者： [白澤健太, 磯部祥子]
通讯作者： 磯部祥子
キクをモデルとした転写制御情報に基づく高次倍数体の高精度遺伝解析手法の開発
  • 批准号：
    21H02189
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $9.98万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    白澤 健太
  • 依托单位：
    Kazusa DNA Research Institute
コメの貯蔵性の改良のためのリポキシゲナーゼ欠失性遺伝子の同定とその利用
イネ登熟期の高温ストレス耐性遺伝子の単離
  • 批准号：
    05J04882
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.15万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    白澤 健太
  • 依托单位：
    Tohoku University
海外基金