植物で最も動的な花弁運動に着目したバラ科樹木の開花日制御機構の解明

以植物中最动态的花瓣运动为重点，阐明蔷薇科树木的开花日期控制机制

• 批准号: 22K19192
• 负责人: 白澤 健太
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: Kazusa DNA Research Institute
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19192/
• 关键词: サクラ; トランスクリプトーム解析; 開花日

トランスクリプトームデータの収集の効率化を図るためにRNAの抽出法を比較検討し、多検体から短時間でRNAを簡易抽出する方法を確立した。この方法で「ソメイヨシノ」の複数年次のつぼみからRNAを抽出し、経時的なトランスクリプトームのデータを収集した。また、全国の「ソメイヨシノ」の全ゲノム解析を通して、同じ「ソメイヨシノ」であっても体細胞突然変異によりゲノムの塩基配列にわずかな違いがあること、そしてその一部は遺伝子機能に影響を及ぼす可能性が高いことを見出した。遺伝的に均一だと考えられている「ソメイヨシノ」において、このような体細胞突然変異は遺伝的なノイズとなりうる。さらに遺伝背景の異なるサクラ品種の開花制御機構を探るために遺伝解析集団を作成し、開花日関連遺伝子の特定に向けた遺伝解析に着手した。

The efficiency of RNA extraction from the collection of samples was compared, and the method of RNA extraction in short time was established. This method is based on the analysis of RNA extraction and RNA collection in multiple years. The whole analysis of the "software" in the whole country has been carried out in the same way as that of the "software". The sudden change of somatic cells in the basic arrangement of the software has a high impact on the function of the software. The body cell suddenly changes to the body cell. The genetic analysis set was created to detect the flowering control mechanism of the variety, and the genetic analysis of the specific direction of the flowering date was started.

项目成果

小石川植物園のソメイヨシノ老木の全ゲノム解析

小石川植物园老吉野樱花树的全基因组分析

• 发表时间: 2023
• 作者: 白澤健太;磯部祥子
• 通讯作者: 磯部祥子