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線虫を用いた個体毎の老化・寿命制御メカニズムの解析

利用线虫分析个体衰老和寿命控制机制

基本信息

批准号：
22K19353
负责人：
宇野雅晴
金额：
$ 4.08万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-06-30 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19353/
关键词：
線虫老化機械学習

项目摘要

老化・寿命が、種を超えて保存された普遍的なメカニズムで制御されることがわかってきている。一方で、加齢に伴い罹患する疾病や機能低下する臓器が個体毎に異なることに代表されるように、老化は多様で複雑な過程であることが明らかになりつつある。本研究課題では、従来のように老化過程の変化を集団の平均ではなく、個体毎の変化に着目するという新しい解析アプローチを試みる。モデル生物線虫を用いて個体別のイメージデータ並びにトランスクリプトームデータを、老化過程の個別データとして取得する。個体レベルで詳細に解析することで、同一種内の「多様な老化過程を複数の老化パターンへと細分化する」といった新たな知見を得ることに挑戦する。それら新たな知見と既知の老化・寿命制御因子との関連を解析することで、個体毎の老化・寿命制御メカニズムを解析する。本年度は、モデル生物線虫の老化による見た目の変化を画像データとして取得した。そのデータをもとに日齢を予測する機械学習モデルの訓練を行った。その結果、加齢に伴い機械学習の正答率が下がることが分かった。このことから、加齢に伴い見た目の画一性を失っていくことが考えられる。また、個体毎の老化に伴う遺伝子発現変化を解析するために、線虫１匹からのRNA-seqの解析に着手した。現在、老化した線虫１個体から十分なクオリティのtotal RNAの抽出に成功したので今後RNA-seqを行う予定である。

Aging, life span, species, preservation, universal, etc. One side, plus, accompanied by disease, low function, organ, individual, different, aging, multiple, complex process, different, different. This research topic is to try to analyze the aging process from the perspective of aggregation and individual transformation. The biological bacteria are used in the process of obtaining individual data and information. Individual aging process, multiple aging process and subdivision within the same species Analysis of the relationship between new knowledge and known aging and life control factors This year, the aging of biological insects has been observed and analyzed. The first step is to predict the future of the company. The result of the machine learning is the correct answer rate. This is the first time I've ever seen a woman. The analysis of RNA-seq in each individual's aging companion gene expression was started. The total RNA was successfully extracted from one individual at present and aged, and the RNA-seq was determined in the future.