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Taming "untamed" generative AIs by developing compound optimization support tools that enable the interactive use of domain knowledge in medicinal chemistry

通过开发化合物优化支持工具来驯服“未驯服的”生成人工智能，这些工具能够交互式地使用药物化学领域的知识

基本信息

批准号：
22K12258
负责人：
山本一樹
金额：
$ 2.66万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

本研究は、創薬研究開発における化合物最適化に関して人-AI協奏を適用し、各種AI的アルゴリズムに基づく自由度の高い合成展開候補生成とドメイン知識に基づく人手による化合物選別とを連動・促進するプラットホームを開発し、野放図 (非実用的な構造式を多分に生成してしまう) になりがちな特性を持つ既存のAI創薬を、人手を介することによって実用に落とし込むことを目的としている。どの部分構造が不要なのかは状況によって異なるため、意味のある生成分子を得るためには標的や薬剤の投与形態などに応じて個別にフィルタを作る必要がある。実際にフィルタに用いる部分構造ルールを挙げるのは手間のかかる作業で、ユーザーの目視をサポートするツールが不可欠である。現存する化合物生成モデルにおいて、新規性の強化と化学・薬学的実現可能性はトレードオフの関係となることが多いが、逆に、そのトレードオフを受容し人手によるサポート作業を厭わず行えば、生成AIを充分に活かして、より画期的な化合物空間に切り込んだ創造性の高い化合物最適化の実現が見込まれる。本年度は、R2年度に完了した基盤研究(C)「ヒューマンコンピュテーションと計算創薬の融合的実装による創薬計算科学の深化」の成果である chemical.space ウェブサイトを機能拡張し、生成モデル等から生成された大量の化合物を人手で効率的に選別するためのウェブアプリケーション https://sanitizer.chemical.space/ を整備した。目視で構造式を評価し、共通部分構造や構造類似性でまとめて構造式を選別し SMILES 形式で出力することができる機能を提供している。評価結果をプロジェクトごとに URL でそのまま共有することもでき、オープンサイエンスとの親和性も意識した実装とした。ソースコードはオープンソースソフトウェア (OSS) として公開している。

In this study, we conducted a study on the most efficient chemical compounds, human-AI orchestral instruments, high-degree-of-freedom synthesis of all kinds of AI, and the generation of basic knowledge and knowledge of human compounds. The properties of the field release (which is not used in the field) are used to generate the existing AI, the manual and the manual are used for the purpose. In part of the system, you do not need to change the status of the generator, which means that the generating molecule is not affected. Do not do the necessary information. Some of the equipment used in the international market is used in the production of mobile phones, and equipment. In this paper, the possibility of the formation of chemical compounds, the possibility of the formation of chemical compounds, the possibility of chemical engineering, the possibility of chemical reaction, the possibility of high performance, high risk, high During the drawing period, the space-time analysis of the compounds was used to determine the chemical properties of the highly active compounds. This year, R2 has completed its basic research (C). This year, it has completed its basic research (C). This year, R2 has completed its basic research (C). This year, R2 has completed its basic research (C). This year, R2 has completed its basic research (C). In order to generate a large number of compounds, such as the production of a large number of compounds, the selection of a large number of compounds has a significant impact on the number of https://sanitizer.chemical.space/ equipment. In view of the system model, the common part of the system is similar to the system. The selection of the model is based on the SMILES format. The machine can provide information. The results show that there are three kinds of information, namely, the knowledge of sex, the knowledge of sex, and URL knowledge. I don't know. I don't know.