メダカで発見された巨大な新規ＤＮＡトランスポゾンＡｌｂａｔｒｏｓｓの解析

青鳉鱼中发现的巨大新 DNA 转座子信天翁的分析

• 批准号: 13J09339
• 负责人: 井上 雄介
• 金额: $ 1.73万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13J09339/
• 关键词: トランスポゾン; ウイルス; ゲノム; メダカ; ヘルペスウイルス

トランスポゾンは生物のゲノム上を転移するDNA配列であり、あらゆる生物種に普遍的に存在する。その転移は遺伝情報を変化させるため、宿主生物種のゲノム進化に寄与していると考えられている。当研究室の先行研究により、メダカDa変異体の原因因子として少なくとも42 kb以上である大型の新規DNAトランスポゾンが見出され、Albatrossと命名された。Albatrossの挿入が原因と推定されるメダカ変異体は他にも複数報告があり、メダカゲノムにおいて転移していることが示唆されていた。しかし、その全配列は決定されておらず、サイズ、内部配列の由来、転移活性の有無などは不明であった。昨年度までに、Albatrossはヘルペスウイルスゲノムと一体化した、長さ180 kbを上回る巨大なpiggyBac型DNAトランスポゾンであり、さらに転移活性を保持していることを示した。これより、Albatrossはトランスポゾンの転移機構を二次的に獲得して宿主ゲノム内に内在化したヘルペスウイルスである可能性が示唆された。今年度は本現象の普遍性を検証するために、他の生物種におけるAlbatross様配列の探索および系統解析を行った。その結果、ゲノムが解読されている約60種の真骨魚類のうち16種について、Albatrossと相同性の高いヘルペスウイルス様配列が検出された。系統解析の結果、これらのAlbatross様配列は互いに近縁であり、魚類・両生類感染型ヘルペスウイルス内で一つのクラスターを形成した。さらに、いくつかの種についてはAlbatross様配列がゲノム内で複数コピー存在していることが示唆され、メダカと同様にAlbatross様配列がゲノム内で増幅している可能性が示唆された。以上より、ゲノムに内在化する性質をもった新規のヘルペスウイルスの一群が存在している可能性が示唆された。

ト ラ ン ス ポ ゾ ン は biological の ゲ ノ ム を on planning move す る DNA match column で あ り, あ ら ゆ る biological に common に existence す る. そ の planning move は heritage 伝 intelligence を variations change さ せ る た め, host organism の ゲ ノ ム evolution に send し て い る と exam え ら れ て い る. When laboratory の first research に よ り, メ ダ カ Da - variant の reason factor と し て less な く と も more than 42 KB で あ る large の new rules on DNA ト ラ ン ス ポ ゾ ン が shows さ れ, Albatross と named さ れ た. Albatross の scions into presumption が reason と さ れ る メ ダ カ - variant は he に も plural report が あ り, メ ダ カ ゲ ノ ム に お い て planning move し て い る こ と が in stopping さ れ て い た. <s:1>, そ, そ, the full arrangement of されておらず determines されておらず, サ ズ ズ, the origin of the internal arrangement, and whether the 転 migration activity of 転 is な であった is unclear であった. Yesterday annual ま で に, Albatross は ヘ ル ペ ス ウ イ ル ス ゲ ノ ム と integration し た last time, long さ 180 KB を る huge な piggyBac type DNA ト ラ ン ス ポ ゾ ン で あ り, さ ら に move planning activity was を し て い る こ と を shown し た. こ れ よ り, Albatross は ト ラ ン ス ポ ゾ ン の planning move organization を secondary に get し て host ゲ ノ ム within に internalized し た ヘ ル ペ ス ウ イ ル ス で あ が る possibility in stopping さ れ た. Card of our は "this phenomenon is の universality を 検 す る た め に, he の biological に お け る Albatross others go の explore お よ び line system analytic を っ た. そ の results, ゲ ノ ム が solution 読 さ れ て い about 60 kinds of bone fish really の る の う ち 16 に つ い て, Albatross と identity の high い ヘ ル ペ ス ウ イ ル ス others go が 検 out さ れ た. System analytical の results, こ れ ら の Albatross others with it listed は い に nearly try で あ り, fish that struck raw infection type ヘ ル ペ ス ウ イ ル ス で within a つ の ク ラ ス タ ー を form し た. さ ら に, い く つ か の kind に つ い て は Albatross others go が ゲ ノ ム で within the plural コ ピ ー exist し て い る こ と が in stopping さ れ, メ ダ カ と with others に Albatross others go が ゲ ノ ム で raised within picture し て い が る possibility in stopping さ れ た. Above よ り, ゲ ノ ム に internalized す る nature を も っ た new rules の ヘ ル ペ ス ウ イ ル ス の exist a group of が し て い が る possibility in stopping さ れ た.

项目成果

A novel giant DNA transposon Albatross in medaka fish

青鳉鱼中新型巨型DNA转座子信天翁

• 发表时间: 2013
• 作者: Yusuke Inoue;Takumi Aikawa;Mariko kondo;Shinichi Morishita;Kiyoshi Naruse;Atsuko Shimada;Akihiko Koga;Hiroyuki Takeda
• 通讯作者: Hiroyuki Takeda

Novel active and giant DNA transposon Albatross in the medaka genome

青鳉基因组中新型活性巨型 DNA 转座子信天翁

• 发表时间: 2015
• 作者: ○井上 雄介;佐賀 友則;相川 拓海;森下 真一;成瀬 清;島田 敦子;古賀 彰彦;武田 洋幸
• 通讯作者: 武田 洋幸

メダカで発見された巨大な新規DNAトランスポゾンAlbatross

信天翁，在青鳉鱼中发现的一种巨大的新 DNA 转座子

• 发表时间: 2013
• 作者: 井上雄介;近藤真理子;森下真一;成瀬清;島田敦子;古賀章彦;武田洋幸
• 通讯作者: 武田洋幸

ヘルペスウイルスと一体化した巨大DNAトランスポゾンAlbatross

巨型 DNA 转座子信天翁与疱疹病毒整合

• 发表时间: 2015
• 作者: ○井上 雄介;佐賀 友則;相川 拓海;森下 真一;成瀬 清;島田 敦子;古賀 彰彦;武田 洋幸
• 通讯作者: 武田 洋幸

The largest DNA transposon, Albatross -its evolution and application

最大的DNA转座子信天翁-它的进化和应用

• 发表时间: 2014
• 作者: ○Yusuke Inoue;Takumi Aikawa;Mariko Kondo;Shinichi Morishita;Kiyoshi Naruse; Atsuko Shimada;Akihiko Koga;Hiroyuki Takeda
• 通讯作者: Hiroyuki Takeda