PPRタンパク質ネットワークを基盤とした植物オルガネラのRNA編集装置の解明

基于PPR蛋白网络的植物细胞器RNA编辑装置的阐明

基本信息

  • 批准号:
    13J03052
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2013
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2013-04-01 至 2015-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究は、基部陸上植物であるヒメツリガネゴケを用いて、植物オルガネラの新規RNA編集因子およびRNA編集酵素を同定することを目的に行った。これらの成果により、RNA編集の分子機構の解明につながることが期待される。1. オルガネラ部位特異的RNA編集因子の同定ヒメツリガネゴケの葉緑体RNA編集因子を同定するために、編集因子と予想される葉緑体局在型のDYWドメインを持つpentatricopeptide repeatタンパク質(PpPPR_45)をコードする遺伝子の発現抑制株および過剰発現株を作製して解析した。その結果、PpPPR_45が葉緑体rps14 mRNAのRNA編集に働くRNA編集因子であることを明らかにし、論文発表した(Ichinose et al. FEBS Letters 2014)。これにより、ヒメツリガネゴケに存在する全12カ所のRNA編集部位にそれぞれ作用する9種のRNA編集因子が同定され、研究目標の一つである「新規オルガネラRNA編集因子の同定」を達成することができた。2. オルガネラRNA編集におけるDYWドメインの機能領域の同定RNA編集反応はシチジン(C)が脱アミノ化によりウリジン(U)に変換されることから、RNA編集酵素はシチジンデアミナーゼ活性を持つことが予想される。これまでにヒメツリガネゴケで同定されたRNA編集因子は全てDYWドメインを持つが、DYWドメインに保存されたシチジンデアミナーゼ活性部位の類似アミノ酸残基がRNA編集に必須であることを昨年度明らかにしている。今年度は新たにDYWドメインがRNA編集部位特異的に作用することを明らかにし、RNA編集因子のDYWドメインがRNA編集酵素活性と編集部位認識の両方を担っている可能性が示唆された。
This study aims to identify new RNA editing factors and RNA editing enzymes for plant development in terrestrial plants. The results of RNA editing and molecular mechanism interpretation are expected. 1. The analysis of the identity of the chloroplast RNA editing factor and the identity of the chloroplast RNA editing factor and the expected chloroplast DNA type is carried out by the pentatricopeptide repeat protein (PpPPR_45). The results of this study, PpPR_45 and RNA editing of chloroplast rps14 mRNA, and RNA editing factors were reported (Ichinose et al. FEBS Letters 2014). All 12 RNA editing sites were identified and 9 RNA editing factors were identified. 2. The functional domain of the RNA assembly is the same as that of the RNA assembly (C), and the RNA assembly enzyme (U) is the same as that of the RNA assembly enzyme (U). The RNA editing factor is the same as that of the whole DYW gene. The RNA editing factor is the same as that of the DYW gene. The RNA editing factor is the same as that of the active site. This year, the possibility of RNA editing enzyme activity and RNA editing site-specific role in RNA editing factors has been demonstrated.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
RNA編集におけるPPRタンパク質のDYWドメインの役割
PPR 蛋白 DYW 结构域在 RNA 编辑中的作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    一瀬瑞穂;杉田 護
  • 通讯作者:
    杉田 護
葉緑体局在PPRタンパク質がコケ原糸体細胞の分化に関与する
叶绿体定位的 PPR 蛋白参与苔藓原丝细胞分化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    後藤誠也;一瀬瑞穂;杉田千恵子;杉田 護
  • 通讯作者:
    杉田 護
名古屋大学大学院理学研究科生命理学専攻ポームページ論文紹介
名古屋大学研究生院生命科学系Pompage论文介绍
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
パーティクルガンを用いたトランジェントアッセイによるヒメツリガネゴケの生物時計遺伝子の発現解析
使用粒子枪进行瞬态测定,分析苔藓立碗藓 (Physcomitrella moss) 中生物钟基因的表达
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    龍 昌志;一瀬瑞穂;樋口海杜;杉田 護;青木摂之
  • 通讯作者:
    青木摂之
植物オルガネラのPPRタンパク質とRNA編集
植物细胞器中的 PPR 蛋白和 RNA 编辑
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    一瀬瑞穂;杉田 護
  • 通讯作者:
    杉田 護
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一瀬 瑞穂其他文献

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  • 资助金额:
    $ 1.28万
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    Research Grant
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