副腎白質ジストロフィー患者における表現型を規定する修飾因子の探索

副腎白質ジストロフィー (ALD)の多彩な表現型の修飾遺伝子として可能性のある遺伝子として、ペルオキシソームで機能する遺伝子に注目し、 SNVs(single nucleotide variants)、Short insertions and deletions (indels)を網羅的に検出し、その上で、見出されたSNVsについて、それぞれの表現型における出現頻度に差があるかどうかを検定した。昨年から、症例を10例増やし、日本人ALD73家系77症例 [大脳型48例(小児大脳型ALD 14例、思春期大脳型ALD 6例、成人大脳型ALD 11例、AMNから大脳型への移行例 15例、小脳脳幹型から大脳型への移行例2例)、小脳脳幹型 3例、AMN 21例、Addison病 2例, 未発症3例)]、日本人コントロールとして、133人増やし、502人を解析対象とした。解析方法としては、ペルオキシソームで機能する95の遺伝子のexon, exon/intron境界域, 5’UTR, 3’UTRに存在するSNVsを網羅的に検出するために、直接塩基配列法及びイルミナ社Hiseq 2500を利用したエキソーム解析を施行した。ペルオキシソームで機能する95の遺伝子のSNVs, short indelsに着目し、表現型における出現頻度に差があるSNV, short indelsを同定した。ALD症例においては、ペルオキシオームで機能する遺伝子群において、1個の既知の病因遺伝子変異を認めた。また、4個のnonsense variants、frameshift variants、スプライス部位のvariants、47個の新規non-synonymous SNVsを認めた。複数の機能予測アルゴリズム(Polyphen-2、SIFT、Mutation Taster、LRT、Phylop)で機能障害が予測されるvaraintsの個数を19個認めた。今後詳細な解析結果の検討をさらに継続して行っていく。

副腎白質ジストロフィー (ALD)の多彩な表現型の修飾遺伝子として可能性のある遺伝子として、ペルオキシソームで機能する遺伝子に注目し、 SNVs(single nucleotide variants)、Short insertions and deletions (indels)を網羅的に検出し、その上で、見出されたSNVsについて、それぞれの表現型における出現頻度に差があるかどうかを検定した。昨年から、症例を10例増やし、日本人ALD73家系77症例 [大脳型48例(小児大脳型ALD 14例、思春期大脳型ALD 6例、成人大脳型ALD 11例、AMNから大脳型への移行例 15例、小脳脳幹型から大脳型への移行例2例)、小脳脳幹型 3例、AMN 21例、Addison病 2例, 未発症3例)]、日本人コントロールとして、133人増やし、502人を解析対象とした。解析方法としては、ペルオキシソームで機能する95の遺伝子のexon, exon/intron境界域, 5’UTR, 3’UTRに存在するSNVsを網羅的に検出するために、直接塩基配列法及びイルミナ社Hiseq 2500を利用したエキソーム解析を施行した。ペルオキシソームで機能する95の遺伝子のSNVs, short indelsに着目し、表現型における出現頻度に差があるSNV, short indelsを同定した。ALD症例においては、ペルオキシオームで機能する遺伝子群において、1個の既知の病因遺伝子変異を認めた。また、4個のnonsense variants、frameshift variants、スプライス部位のvariants、47個の新規non-synonymous SNVsを認めた。複数の機能予測アルゴリズム(Polyphen-2、SIFT、Mutation Taster、LRT、Phylop)で機能障害が予測されるvaraintsの個数を19個認めた。今後詳細な解析結果の検討をさらに継続して行っていく。