ｍＲＮＡ分解による新規のショ糖応答制御機構の解明

通过 mRNA 降解阐明新型蔗糖反应控制机制

• 批准号: 13J00043
• 负责人: 鈴木 悠也
• 金额: $ 1.15万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13J00043/
• 关键词: ポリA鎖; CCR4; RNA分解; シロイヌナズナ; mRNA分解; Poly(A)

1. GBSS1 mRNAの半減期の測定: 表現型の解析により，atccr4a/4bの二重変異株がより多くのアミロースを蓄積させていることを明らかにした。さらにマイクロアレイを用いた遺伝子の網羅的な解析により，アミロース合成酵素の1つであるGBSS1の発現量が二重変異株で増加していることを明らかにし，かつLM-PAT法により二重変異株では長いポリA鎖を持つGBSS1 mRNAが蓄積していることを明らかにした。ポリA鎖はmRNAの安定性や翻訳効率に影響を与え得ることから，転写阻害剤を用い，野生型株と二重変異株でGBSS1 mRNAの安定性を測定した。その結果，二重変異株はGBSS1 mRNAが長いポリA鎖を持つにも関わらず，その安定性は野生型株と二重変異株で差が見られなかった。このことから，二重変異株におけるGBSS1のポリA鎖はmRNAの安定性ではなく，タンパク質の翻訳効率に影響を与えていることが示唆された。2. 時計遺伝子の挙動: マイクロアレイを用いた解析により，二重変異株でmRNAの蓄積量が変化している遺伝子群に，発現が日周リズムを刻む遺伝子が有意に濃縮されていることが明らかとなった。植物の日周リズムは光シグナルや温度によって制御されており，リズム形成の中心を担うのが時計遺伝子である。そこで，二重変異株における時計遺伝子の発現パターンを解析したところ，時計遺伝子であるCCA1の発現が二重変異株において有意に遅れることを明らかにした。さらにCCA1のポリA鎖の長さをLM-PAT法により測定したところ，二重変異株では長いポリA鎖を持つCCA1が検出された。このことから，CCA1はAtCCR4による脱アデニル化反応を受ける標的遺伝子であることが明らかになった。

1. GBSS1 mRNA の half life の determination: phenotype の parsing に よ り, atccr4a / 4 b の double - different strains が よ り more く の ア ミ ロ ー ス を accumulation さ せ て い る こ と を Ming ら か に し た. さ ら に マ イ ク ロ ア レ イ を with い た heritage 伝 son の snare な parsing に よ り, ア ミ ロ ー ス synthetic enzyme の 1 つ で あ る GBSS1 の 発 now quantity が double - different strains で raised し て い る こ と を Ming ら か に し, か つ LM - PAT method に よ り double - different strains で は long い ポ リ A lock を hold つ GBSS1 mRNA が accumulation し て い る こ と を Ming ら か に し た. ポ リ A lock は mRNA の stability や turn 訳 sharper rate に を with え る こ と か ら, planning to write resistance against tonic を い, wild type strains と double - different strains で GBSS1 mRNA の stability determination of を し た. そ の results, double - vision strain は GBSS1 mRNA が long い ポ リ A lock を hold つ に も masato わ ら ず, そ の stability は wild type strains と double - different strains で poor が see ら れ な か っ た. こ の こ と か ら, double - different strains に お け る GBSS1 の ポ リ A lock は mRNA の stability で は な く, タ ン パ ク qualitative の turn 訳 に influence を and sharper rate え て い る こ と が in stopping さ れ た. 2 hour meter heritage 伝 son の 挙 move: マ イ ク ロ ア レ イ を with い た parsing に よ り, double - vision strain で mRNA の volume が variations change し て い る heritage 伝 subgroup に, 発 が now days weeks リ ズ ム を carved む heritage 伝 son が intentionally に enrichment さ れ て い る こ と が Ming ら か と な っ た. Plant の day week リ ズ ム は light シ グ ナ ル や temperature に よ っ て suppression さ れ て お り, リ ズ ム を bear form の center う の が chronometer heritage 伝 son で あ る. そ こ で, double - different strains に お け る chronometer posthumous son 伝 の 発 now パ タ ー ン を parsing し た と こ ろ, hour meter heritage 伝 son で あ る CCA1 の 発 now が double - different strains に お い て intentionally に 遅 れ る こ と を Ming ら か に し た. さ ら に CCA1 の ポ リ A long lock の さ を LM - PAT method に よ り determination し た と こ ろ, double - vision strain で は long い ポ リ A lock を hold つ CCA1 が 検 out さ れ た. こ の こ と か ら, CCA1 は AtCCR4 に よ る ア off デ ニ ル turn against 応 を by け る mark heritage 伝 son で あ る こ と が Ming ら か に な っ た.

项目成果

AtCCR4s degrade the poly(A) tail of GBSS1 mRNA which is responsible for amylose synthesis

AtCCR4s 降解负责直链淀粉合成的 GBSS1 mRNA 的聚腺苷酸尾

• 发表时间: 2014
• 作者: Yuya Suzuki;Pamela J. Green;Junji Yamaguchi;Yukako Chiba
• 通讯作者: Yukako Chiba

Plant deadenylases, AtCCR4a and AtCCR4b play an important role in determining the poly(A) length of CCA1 and TOC1 transcripts.

植物去腺苷酸酶 AtCCR4a 和 AtCCR4b 在确定 CCA1 和 TOC1 转录本的 Poly(A) 长度方面发挥着重要作用。

• 发表时间: 2015
• 作者: Yue Tang;Naomi Abe;Motoko Yoshimoto;Beiwei Zhu;Yoshiyuki Murata;Yoshimasa Nakamura;鈴木悠也，平井優美，Pamela J. Green，山口淳二，千葉由佳子
• 通讯作者: 鈴木悠也，平井優美，Pamela J. Green，山口淳二，千葉由佳子

AtCCR4a and AtCCR4b are Involved in Determining the Poly(A) Length of Granule-bound starch synthase 1 Transcript and Modulating Sucrose and Starch Metabolism in Arabidopsis thaliana

• DOI: 10.1093/pcp/pcv012
• 发表时间: 2015-05-01
• 期刊: PLANT AND CELL PHYSIOLOGY
• 影响因子: 4.9
• 作者: Suzuki, Yuya;Arae, Toshihiro;Chiba, Yukako
• 通讯作者: Chiba, Yukako

Poly(A) specific ribonucleases, AtCCR4s are important for the starch metabolism

Poly(A) 特异性核糖核酸酶 AtCCR4 对淀粉代谢很重要

• 发表时间: 2013
• 作者: 鈴木悠也;平井優美;Pamela J. Green;山口淳二;千葉由香子
• 通讯作者: 千葉由香子

Functional analysis of plant deadenylases AtCCR4s which regulate the sugar metabolism

调节糖代谢的植物去腺苷酸酶AtCCR4s的功能分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 鈴木悠也;平井優美;Pamela J. Green;山口淳二;千葉由香子
• 通讯作者: 千葉由香子