分子間距離測定に基づく脂質二重膜中アンフォテリシンB複合体の構造解析
分子間距離測定に基づく脂質二重膜中アンフォテリシンB複合体の構造解析
批准号:
13J01527
负责人:
中川 泰男
金额:
$1.28万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-04-01 至 2015-03-31
中文摘要
アンフォテリシンB (AmB)はその強力な抗カビ活性と耐性菌の出来にくい性質により、発見から50年以上経た現在でも深在性の真菌感染症治療薬として広く用いられている。AmBは、真菌細胞膜中でエルゴステロール(Erg)と共にイオン透過性チャネルを形成し生理活性を発現するといわれているが、ヒト細胞膜のコレステロールとも弱いながらも相互作用するため副作用を示す。このような薬理学的重要性にもかかわらず、AmB-Ergチャネル複合体の詳細な構造は明らかにはなっていない。そこで本研究では、近年、脂質膜中における構造解析法として注目されている固体NMRにより、複合体構造の全容を明らかにすることを目的とした。本研究により複合体構造が明らかになれば、よりErg選択性を高めた優れた薬の開発につながると期待される。本年度は特に、昨年度までに合成したF-AmBと13C-AmBおよび13C-Ergを用いたREDOR測定により分子間距離情報を取得することで、AmB-ErgおよびAmB-AmB二分子間の相互作用解析を行った。まず、F-AmBおよび13C-Ergを用いたREDOR測定により平行型および反平行型で相互作用しているAmB-Ergの分子間距離をそれぞれ2点ずつ取得した。その分子間距離を制限情報とした分子力学計算により両者の結合様式を推定することに成功した。また、13C-AmBおよびF-AmBを用いたREDOR測定を行うことで3点のAmB同士の分子間距離情報を取得した。さらに、その分子間距離を満たすようにAmBを配置することでチャネル複合体中におけるAmB同士の相対配置の推定に成功した。以上の実験から得られたAmB-ErgおよびAmB-AmBの相互作用を基に複合体の全体構造を推定することに成功した。本研究は脂質二重膜中で低分子が形成する複合体の構造を原子レベルで推定した初めての例であり、有機化学と固体NMRを組み合わせた本研究手法が膜環境下における分子間相互作用解析において有用な手法であることを示すことができた。
英文摘要
アンフォテリシンB (AmB)はその強力な抗カビ活性と耐性菌の出来にくい性質により、発見から50年以上経た現在でも深在性の真菌感染症治療薬として広く用いられている。AmBは、真菌細胞膜中でエルゴステロール(Erg)と共にイオン透過性チャネルを形成し生理活性を発現するといわれているが、ヒト細胞膜のコレステロールとも弱いながらも相互作用するため副作用を示す。このような薬理学的重要性にもかかわらず、AmB-Ergチャネル複合体の詳細な構造は明らかにはなっていない。そこで本研究では、近年、脂質膜中における構造解析法として注目されている固体NMRにより、複合体構造の全容を明らかにすることを目的とした。本研究により複合体構造が明らかになれば、よりErg選択性を高めた優れた薬の開発につながると期待される。本年度は特に、昨年度までに合成したF-AmBと13C-AmBおよび13C-Ergを用いたREDOR測定により分子間距離情報を取得することで、AmB-ErgおよびAmB-AmB二分子間の相互作用解析を行った。まず、F-AmBおよび13C-Ergを用いたREDOR測定により平行型および反平行型で相互作用しているAmB-Ergの分子間距離をそれぞれ2点ずつ取得した。その分子間距離を制限情報とした分子力学計算により両者の結合様式を推定することに成功した。また、13C-AmBおよびF-AmBを用いたREDOR測定を行うことで3点のAmB同士の分子間距離情報を取得した。さらに、その分子間距離を満たすようにAmBを配置することでチャネル複合体中におけるAmB同士の相対配置の推定に成功した。以上の実験から得られたAmB-ErgおよびAmB-AmBの相互作用を基に複合体の全体構造を推定することに成功した。本研究は脂質二重膜中で低分子が形成する複合体の構造を原子レベルで推定した初めての例であり、有機化学と固体NMRを組み合わせた本研究手法が膜環境下における分子間相互作用解析において有用な手法であることを示すことができた。
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Axial Hydrogen at C7 Position and Bumpy Tetracyclic Core Markedly Reduce Sterol’s Affinity to Amphotericin B in Membrane
C7 位轴向氢和凹凸不平的四环核心显着降低了膜中甾醇对两性霉素 B 的亲和力
DOI:
10.1021/bi5012942
发表时间:
2015
期刊:
Biochemistry
影响因子:
2.9
作者:
[Nakagawa, Y., Umegawa, Y., Nonomura, K., Matsushita, N., Takano, T., Tsuchikawa, H., Hanashima, S., Oishi, T., Matsumori, N., and Murata, M.]
通讯作者:
M.
Effect of sterol side chain on ion channel formation by amphotericin B in lipid bilayers.
甾醇侧链对两性霉素 B 在脂质双层中形成离子通道的影响。
DOI:
10.1021/bi500122c
发表时间:
2014
期刊:
Biochemistry
影响因子:
2.9
作者:
[Nakagawa, Y., Umegawa, Y., Takano, T., Tsuchikawa, H., Matsumori, N., and Murata, M.]
通讯作者:
M.
Interactions of synthetic ergosterol analogues with amphotericin B toward understanding drug’s selective toxicity
合成麦角甾醇类似物与两性霉素 B 的相互作用以了解药物的选择性毒性
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kanda GN, Yamada RG, Ueda HR, Yasuo Nakagawa]
通讯作者:
Yasuo Nakagawa
分子間距離に基づく脂質二重膜に形成されるアンフォテリシンB複合体の構造解析
基于分子间距离的脂质双层膜中两性霉素B复合物的结构分析
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kanda GN, Moriguchi H, Yamada RG, Tanaka Y, Ueda HR, 上杉晃生,平井義和,菅野公二,土屋智由,田畑修, Tudor S. Ratiu and Daisuke Tarama, 中川 泰男]
通讯作者:
中川 泰男
Solid-state NMR-based structure elucidation of ion channel assembly for med by amphotericin B in lipid bilayers
基于固态 NMR 的脂质双层中两性霉素 B 介导的离子通道组装结构解析
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[福田哲也, 橋本久子, 飛田博実, 中川 泰男]
通讯作者:
中川 泰男
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适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
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批准号:JCZRYB202500181
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
锌基复合金属氧化物催化CO2加氢反应的固体NMR谱学研究
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批准号:22372160
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:高攀
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依托单位:
超极化增强的固体NMR方法及在分子筛催化不饱和醛选择性加氢反应中的应用研究
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批准号:22372179
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:王伟宇
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分子筛上生物质加氢脱氧反应协同催化作用的固体NMR研究
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项目类别:面上项目
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批准年份:2022
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负责人:齐国栋
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依托单位:
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项目类别:面上项目
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资助金额:56万元
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批准年份:2021
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负责人:喻志武
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依托单位:
表面增强的二维固体NMR方法及在γ-Al2O3活性位研究中的应用
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资助金额:60万元
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批准年份:2021
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负责人:王强
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依托单位:
单链高分子纳米粒子及其纳米复合材料微观结构和动力学的固体NMR研究
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项目类别:面上项目
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资助金额:60万元
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批准年份:2021
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负责人:张荣纯
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依托单位:
高压LiCoO2的固体NMR与EPR研究
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项目类别:面上项目
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资助金额:60万元
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批准年份:2021
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负责人:沈明
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依托单位:
高分子玻璃化转变机理的固体NMR研究
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批准号:22073051
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项目类别:面上项目
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资助金额:63.0万元
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依托单位:
真实反应条件下分子筛Brønsted酸特性的固体NMR和理论研究
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批准号:22002174
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批准年份:2020
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