Pharmacogenomic effects of scavenger B1 in cardiovascular disease prevention

清除剂 B1 在心血管疾病预防中的药物基因组学效应

基本信息

  • 批准号:
    10541892
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 8.95万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2022-01-01 至 2024-12-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

PROJECT SUMMARY/ ABSTRACT Despite mixed evidence of efficacy, drugs like aspirin, and vitamin supplements, are widely used in the US population to prevent chronic diseases. The failure of randomized trials of these over-the-counter (OTC) drugs to consistently demonstrate efficacy, may in part be attributed to a complex interacting heterogeneity of genetic and other effects. Identifying pharmacogenomically defined subpopulations for benefit or harm from drugs and supplements, could enhance precision prevention of cardiovascular disease (CVD), one of the leading causes of death worldwide. Thus, pharmacogenomics, the study of how genomic variation modifies effects of pharmacologically active compounds, has the potential to guide development of precision CVD prevention strategies. Our group has identified candidate genes from multiple pathways related to cardiovascular function that modify the effects of aspirin, and vitamin E in randomized CVD prevention trials. Preliminary data from the Women’ Health Study (WHS), suggests that SCARB1, the gene encoding scavenger B1, a major HDL receptor, is a novel candidate gene for both aspirin and vitamin E effect modification in CVD prevention. Translation of pharmacogenomic markers requires identification of the full set of actionable pharmacogenomic targets, elucidation of their underlying mechanism, and replication of their effects in other cohorts. In this proposal, we examine SCARB1 pharmacogenomic effects on CVD in the WHS and four validation cohorts, ASPirin in Reducing Events in the Elderly (ASPREE), The Physician’s Health Study (PHS), The Alpha-Tocopherol, Beta-Carotene Cancer Prevention Study (ATBC), and The Partner’s Biobank (PBB), allowing broad generalizability of these findings. Given the complexity of CVD and the number of pathways highlighted by pharmacogenomic candidate genes, – estrogen and catecholamine metabolism (COMT), nitric oxide signaling (GUCY1A3), and cholesterol transport (LPA and SCARB1), – there are likely many more pharmacogenomic loci that give rise to a heterogeneity of effects. Identification of the full complement of treatment modifying genes is required to define effects of these overlapping pathways on efficacy and safety of CVD preventive therapy. Currently, discovery of pharmacogenomic loci is limited to candidate gene analysis because genome-wide association study (GWAS) datasets from clinical trials lack sufficient disease events to power classical statistical models. Machine learning approaches, like random forests (RF) obviate the need for statistical power offering an alternative path to discovery. Here, we propose to identify and validate combinatorial pharmacogenomic effects that influence aspirin and vitamin E in CVD prevention in The WHS and PBB by using the RF machine learning methodology. Thus, this proposal seeks to accelerate translation of precision cardiovascular disease prevention by identifying and validating individual and combinatorial effects of novel pharmacogenomic loci that influence the disease preventative effects of the widely used over-the-counter drugs, aspirin, and vitamin E.
项目摘要/摘要 尽管疗效参差不齐,但阿司匹林和维生素补充剂等药物在 美国民众预防慢性病。这些非处方药(OTC)的随机试验失败 持续显示疗效的药物,可能部分归因于复杂的交互异质性 遗传和其他影响。确定药物基因组学定义的亚群的益处或危害 药物和补充剂,可以增强心血管疾病(CVD)的精确预防,心血管疾病是 世界范围内的主要死因。因此,药物基因组学,即研究基因组变异如何改变 药理活性化合物的作用,有可能指导精密CVD的发展 预防策略。我们的团队已经从多个途径中确定了候选基因,这些基因与 在心血管疾病预防随机试验中,改变阿司匹林和维生素E效果的心血管功能。 来自妇女健康研究(WHS)的初步数据表明,编码清道夫的基因SCARB1 B1是一种主要的高密度脂蛋白受体,是阿司匹林和维生素E对心血管疾病影响的新的候选基因 预防。药物基因组标记的翻译需要识别全套可操作的 药物基因组靶点,阐明其潜在机制,并将其作用复制到其他 一群人。在这项建议中,我们研究了SCARB1药物基因组学对WHS和四个 验证队列,阿司匹林减少老年事件(ASPREE),医生健康研究(PHS), α-生育酚、β-胡萝卜素癌症预防研究(ATBC)和伴侣生物库(PBB), 使得这些发现具有广泛的概括性。 考虑到心血管疾病的复杂性和候选药物基因组所强调的途径的数量 基因、雌激素和儿茶酚胺代谢(COMT)、一氧化氮信号转导(GUCY1A3)和胆固醇 运输(LPA和SCARB1),-可能有更多的药物基因组座位导致 效果的异质性。需要鉴定整个治疗修改基因才能确定 这些交叉通路对心血管疾病预防治疗的有效性和安全性的影响。目前,发现 仅限于候选基因分析,因为全基因组关联研究 来自临床试验的(Gwas)数据集缺乏足够的疾病事件来支持经典统计模型。 机器学习方法,如随机森林(RF),消除了对提供统计能力的需求 另一条发现之路。在这里,我们建议识别和验证组合药物基因组效应 利用射频机器学习对阿司匹林和维生素E在WHS和PBB预防CVD中的影响 方法论。因此,这项建议寻求加快心血管疾病的精准翻译 通过识别和验证新的药物基因组学基因座的个体和组合效应来预防 影响广泛使用的非处方药阿司匹林和维生素E的疾病预防效果。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Kathryn Tayo Hall其他文献

Kathryn Tayo Hall的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Kathryn Tayo Hall', 18)}}的其他基金

Pharmacogenomic effects of scavenger B1 in cardiovascular disease prevention
清除剂 B1 在心血管疾病预防中的药物基因组学效应
  • 批准号:
    10347622
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
Epidemiological, pharmacogenomic and clinical impact of catechol-O-methyltransferase on cardiovascular disease
儿茶酚-O-甲基转移酶对心血管疾病的流行病学、药物基因组学和临床影响
  • 批准号:
    10438085
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
Epidemiological, pharmacogenomic and clinical impact of catechol-O-methyltransferase on cardiovascular disease
儿茶酚-O-甲基转移酶对心血管疾病的流行病学、药物基因组学和临床影响
  • 批准号:
    9017826
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:

相似国自然基金

Aspirin调控AKT/Foxo3a/BIM通路延缓吡咯替尼耐药作用机制研究
  • 批准号:
    n/a
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
Aspirin与自噬通路及核转录因子FoxG1在听觉系统退行性变中的协同调控机制研究
  • 批准号:
    81800915
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    21.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
Aspirin联合牙周膜干细胞再生全脱位牙牙周组织机制研究
  • 批准号:
    81760190
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    32.0 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
可注射温敏型水凝胶缓释Aspirin碳点和EPO促牙周组织再生的研究
  • 批准号:
    81600879
  • 批准年份:
    2016
  • 资助金额:
    17.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
Aspirin协同IFN-α抑制肝癌转移复发的作用及机制研究
  • 批准号:
    30972889
  • 批准年份:
    2009
  • 资助金额:
    31.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
胃癌microRNA特异表达与靶基因调控及Aspirin的作用
  • 批准号:
    30873099
  • 批准年份:
    2008
  • 资助金额:
    35.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

TRIAL OF VITAMIN E, BETA-CAROTENE AND ASPIRIN IN WOMEN
维生素 E、β-胡萝卜素和阿司匹林在女性中的试验
  • 批准号:
    2221213
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
TRIAL OF VITAMIN E, BETA CAROTENE, AND ASPIRIN IN WOMEN
维生素 E、β-胡萝卜素和阿司匹林在女性中的试验
  • 批准号:
    3191850
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
TRIAL OF VITAMIN E, BETA-CAROTENE AND ASPIRIN IN WOMEN
维生素 E、β-胡萝卜素和阿司匹林在女性中的试验
  • 批准号:
    2221214
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
TRIAL/VITAMIN E BETA CAROTENE & ASPIRIN IN WOMEN
试用/维生素E β-胡萝卜素
  • 批准号:
    2092812
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
TRIAL/VITAMIN E BETA CAROTENE & ASPIRIN IN WOMEN
试用/维生素E β-胡萝卜素
  • 批准号:
    2092813
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
VITAMIN E, BETA-CAROTENE, AND ASPIRIN TRIAL IN WOMEN
维生素 E、β-胡萝卜素和阿司匹林在女性中的试验
  • 批准号:
    3191849
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
TRIAL OF VITAMIN E, BETA CAROTENE, AND ASPIRIN IN WOMEN
维生素 E、β-胡萝卜素和阿司匹林在女性中的试验
  • 批准号:
    3191851
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
TRIAL OF ASPIRIN AND BETA-CAROTENE
阿司匹林和β-胡萝卜素的试验
  • 批准号:
    3347657
  • 财政年份:
    1986
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
TRIAL OF ASPIRIN AND BETA-CAROTENE IN U S MD'S
美国医学博士试用阿司匹林和 β-胡萝卜素
  • 批准号:
    3347659
  • 财政年份:
    1986
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
TRIAL OF ASPIRIN AND BETA-CAROTENE
阿司匹林和β-胡萝卜素的试验
  • 批准号:
    3347658
  • 财政年份:
    1986
  • 资助金额:
    $ 8.95万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了