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LINKER HISTONE/DNA INTERACTIONS

连接子组蛋白/DNA 相互作用

基本信息

批准号：
2459509
负责人：
KENSAL E. VAN HOLDE
金额：
$ 20.87万
依托单位：
OREGON STATE UNIVERSITY
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
1994
资助国家：
美国
起止时间：
1994-08-01 至 1999-07-31
项目状态：
已结题

来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/2459509
关键词：
DNA binding protein chemical binding chemical stability chromatin crosslink genetic regulation histones molecular site nonhistone nucleoprotein nucleic acid sequence nucleic acid structure nucleosomes polymerase chain reaction

项目摘要

Recent evidence from our laboratory indicates that the so-called "linker" histones (H1, H5, and their variants) can bind to certain DNA structures and sequences much more specifically than hitherto believed. In particular, these histones strongly bind to DNA crossover structures, typified by the four-way junction. These are the same structures favored by an abundant class of high mobility group proteins (HMG 1/2), and resemble the DNA structure at the entrance and exit from the nucleosome. Linker histones and HMG1 binding appear to be related to general mechanisms of genetic repression and expression. We propose a detailed investigation of this selective binding, including quantitation of binding by intact histones and their globular domains to the junction, and competition between histone variants and HMGI for such binding. The binding/competition experiments will then be extended to studies utilizing nucleosomes, as a more direct model of the in vivo structure. A second area of study will utilize PCR amplification methods in an attempt to discover DNA sequences or sequence types exhibiting strong linker histone binding. These will then be used in studies of the effects of such binding on DNA conformation.

我们实验室的最新证据表明，所谓的“连接子” 组蛋白（H1、H5 及其变体）可以结合某些 DNA 结构并且序列比迄今为止所认为的更加具体。在特别是，这些组蛋白与 DNA 交叉结构强烈结合，以四路交叉口为代表。这些都是受青睐的相同结构由丰富的高迁移率族蛋白 (HMG 1/2) 组成，以及类似于核小体入口和出口处的 DNA 结构。连接组蛋白和 HMG1 结合似乎与一般相关基因抑制和表达的机制。我们提出了详细的研究这种选择性结合，包括结合的定量由完整的组蛋白及其球状结构域连接到连接处，并且组蛋白变体和 HMGI 之间对这种结合的竞争。这然后结合/竞争实验将扩展到利用核小体，作为体内结构的更直接的模型。第二个研究领域将利用 PCR 扩增方法尝试发现表现出强大的DNA序列或序列类型接头组蛋白结合。然后这些将用于研究效果 DNA构象上的这种结合。

项目成果

期刊论文数量（13）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

High-affinity binding sites for histone H1 in plasmid DNA.

质粒 DNA 中组蛋白 H1 的高亲和力结合位点。

DOI：
10.1073/pnas.92.15.7060
发表时间：
1995
期刊：
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
影响因子：
11.1
作者：
Yaneva,J;Schroth,GP;vanHolde,KE;Zlatanova,J
通讯作者：
Zlatanova,J

H1 binding unwinds DNA. Evidence from topological assays.

H1 结合使 DNA 解旋。

DOI：
10.1074/jbc.271.51.32580
发表时间：
1996
期刊：
The Journal of biological chemistry
影响因子：
0
作者：
Ivanchenko,M;Hassan,A;vanHolde,K;Zlatanova,J
通讯作者：
Zlatanova,J

Binding to four‐way junction DNA: a common property of architectural proteins?

DOI：
10.1096/fasebj.12.6.421
发表时间：
1998-04
期刊：
The FASEB Journal
影响因子：
0
作者：
J. Zlatanova;K. Holde
通讯作者：
J. Zlatanova;K. Holde

What determines the folding of the chromatin fiber?

染色质纤维的折叠由什么决定？

DOI：
10.1073/pnas.93.20.10548
发表时间：
1996
期刊：
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
影响因子：
11.1
作者：
vanHolde,K;Zlatanova,J
通讯作者：
Zlatanova,J

The electrophoretic separation of curved cisplatin-modified DNA fragments on polyacrylamide gels is dependent on the voltage gradient.

弯曲的顺铂修饰的 DNA 片段在聚丙烯酰胺凝胶上的电泳分离取决于电压梯度。