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Open source pipelines for integrated metabolomics analysis by NMR and mass spectrometry

Open source pipelines for integrated metabolomics analysis by NMR and mass spectrometry
通过 NMR 和质谱进行集成代谢组学分析的开源管道
批准号：
BB/M019985/1
负责人：
Mark Viant
金额：
$6.54万
依托单位：
University of Birmingham
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2015
资助国家：
英国
项目状态：
已结题
起止时间：
2015 至 --
来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=BB%2FM019985%2F1
关键词：
Opensourcepipelinesintegratedmetabolomics

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会议论文
Computational tools and workflows in metabolomics: An international survey highlights the opportunity for harmonisation through Galaxy.
DOI： 10.1007/s11306-016-1147-x
发表时间： 2017
期刊： METABOLOMICS
影响因子： 3.6
作者： [Weber, Ralf J. M., Lawson, Thomas N., Salek, Reza M., Ebbels, Timothy M. D., Glen, Robert C., Goodacre, Royston, Griffin, Julian L., Haug, Kenneth, Koulman, Albert, Moreno, Pablo, Ralser, Markus, Steinbeck, Christoph, Dunn, Warwick B., Viant, Mark R.]
通讯作者： Viant, Mark R.
Galaxy-M: a Galaxy workflow for processing and analyzing direct infusion and liquid chromatography mass spectrometry-based metabolomics data.
DOI： 10.1186/s13742-016-0115-8
发表时间： 2016
期刊： GigaScience
影响因子： 9.2
作者： [Davidson RL, Weber RJ, Liu H, Sharma-Oates A, Viant MR]
通讯作者： Viant MR
mzML2ISA & nmrML2ISA: generating enriched ISA-Tab metadata files from metabolomics XML data.
DOI： 10.1093/bioinformatics/btx169
发表时间： 2017-08-15
期刊： Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子： --
作者： [Larralde M, Lawson TN, Weber RJM, Moreno P, Haug K, Rocca-Serra P, Viant MR, Steinbeck C, Salek RM]
通讯作者： Salek RM
Computational tools and workflows in metabolomics: An international survey highlights the opportunity for harmonisation through Galaxy
代谢组学中的计算工具和工作流程：一项国际调查强调了通过 Galaxy 进行协调的机会
DOI： 10.17863/cam.8310
发表时间： 2016
期刊：
影响因子： --
作者： [Weber R]
通讯作者： Weber R
Delivering ELIXIR-UK
  • 批准号：
    BB/L005077/1
  • 项目类别：
    Research Grant
  • 资助金额：
    $3.37万
  • 财政年份：
    2014
  • 负责人：
    Mark Viant
  • 依托单位：
    University of Birmingham
Implementing Metabolomics Analyses into Galaxy Workflows: Towards Genome-Metabolome Large-Scale Data Fusion
  • 批准号：
    NE/K011294/1
  • 项目类别：
    Research Grant
  • 资助金额：
    $3.5万
  • 财政年份：
    2013
  • 负责人：
    Mark Viant
  • 依托单位：
    University of Birmingham
MUSCLE: Multi-platform Unbiased-optimisation of Spectrometry via Closed Loop Experimentation
  • 批准号：
    BB/I024085/1
  • 项目类别：
    Research Grant
  • 资助金额：
    $11.41万
  • 财政年份：
    2012
  • 负责人：
    Mark Viant
  • 依托单位：
    University of Birmingham
From Airborne Exposures to Biological Effects (FABLE): the impact of nanoparticles on health
  • 批准号：
    NE/I008314/1
  • 项目类别：
    Research Grant
  • 资助金额：
    $201.03万
  • 财政年份：
    2011
  • 负责人：
    Mark Viant
  • 依托单位：
    University of Birmingham
国内基金
海外基金
数学之源书（Source book in mathematics)的翻译与出版
  • 批准号：
    11826405
  • 项目类别：
    数学天元基金项目
  • 资助金额：
    3.0万元
  • 批准年份：
    2018
  • 负责人：
    程晓亮
  • 依托单位：
    吉林师范大学
稀疏表示及其在盲源分离中的应用研究
  • 批准号：
    61104053
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    23.0万元
  • 批准年份：
    2011
  • 负责人：
    杨祖元
  • 依托单位：
    广东工业大学
产铀花岗岩体的铀源矿物及活化机制的精细矿物学研究
  • 批准号：
    41072028
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    48.0万元
  • 批准年份：
    2010
  • 负责人：
    胡欢
  • 依托单位：
    南京大学