MOLECULAR PATHOGENESIS OF JC VIRUS & PROGRESSIVE MULTIFOCAL LEUKOENCEPHALOPATHY
JC 病毒的分子发病机制
基本信息
- 批准号:3760211
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:
- 资助国家:美国
- 起止时间:至
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:DNA footprinting Polyomavirus hominis 2 analytical method biopsy gene expression genetic regulatory element genetic strain host organism interaction human tissue molecular pathology neurotropic virus nucleic acid sequence polymerase chain reaction progressive multifocal leukoencephalopathy reporter genes transcription factor virus DNA virus genetics
项目摘要
The presence of JCV in peripheral blood lymphocytes (PBLs) in both viral
induced progressive multifocal leukoencephalopathy (PML) and non-PML
patients has strengthened the concept that JCV is carried to the brain
by a hematogenous route. At the same time, it has focused a part of our
studies to develop a quantitative analysis of the level of JCV in these
cells and other tissues. It may be important in helping to assess the
risk of non-PML patients and to evaluate the affect nucleotide analogs
for the treatment of PML. Noncompetitive and competitive or quantitative
PCR (QPCR) analysis procedures are being developed to ascertain the level
of JCV present in different tissues. Control JCV DNA templates are being
constructed to serve as external or internal standards for the
quantitation of the virus. These procedures utilize the same primer set
used to detect JCV in patient samples by PCR analysis which eliminates
the possible differential hybridization kinetics when using different
primer sets. A rapid and sensitive chemiluminescent procedure is being
used to analyze the PCR products in these studies. An examination of the
nucleotide sequences present in the prototype (Mad1) and brain-type (Mad
8B) JCV is being made to assess the role of these sequences in the
pathogenicity of JCV. One major difference is the presence of a 23bp
sequence which is present in most strains of JCV isolated from brain
biopsies from PML patients. This 23bp sequence has a putative binding
site for the transcription factor SP1. However, we have found that SP1
binds to this sequence very weakly as seen by competitive binding and
DNase 1 protection assays. In addition, construction of CAT reporter
plasmids containing either the Mad1 or Mad8B regulatory region has shown
that the Mad1 sequence is much more active that from Mad8B. Further
studies are underway to understand the role of the 23-bp sequence in the
expression of the Mad8B strain in different tissues.
两种病毒感染者的外周血淋巴细胞(PBL)中JCV的存在均为阴性。
诱导的进行性多灶性白质脑病(PML)和非PML
患者加强了JCV被携带到大脑的概念,
通过血行途径 与此同时,它集中了我们的一部分,
研究开发定量分析的水平JCV在这些
细胞和其他组织。 这可能有助于评估
非PML患者的风险,并评估受影响的核苷酸类似物
用于治疗PML。非竞争性和竞争性或定量
正在制定PCR(QPCR)分析程序,以确定
JCV存在于不同的组织中。 对照JCV DNA模板正在
作为外部或内部标准,
病毒的定量。 这些程序使用相同的引物组
用于通过PCR分析检测患者样本中的JCV,
当使用不同的杂交剂时,
引物组。一种快速灵敏的荧光检测方法
用于分析这些研究中的PCR产物。 的检查
存在于原型(Mad 1)和脑型(Mad)中的核苷酸序列
8B)JCV正在评估这些序列在
JCV的致病性 一个主要的区别是存在一个23 bp的
该序列存在于从脑中分离的大多数JCV菌株中
PML患者的活检。 该23 bp的序列具有假定的结合
转录因子SP1的位点。 但是,我们发现SP1
通过竞争性结合可以看出,与该序列的结合非常弱,
DNA酶1保护测定。此外,CAT报告器的构建
含有Mad 1或Mad 8B调节区的质粒已经显示
Mad 1序列比Mad 8B序列更活跃。 进一步
研究正在进行中,以了解23-bp序列在
Mad 8B菌株在不同组织中的表达。
项目成果
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专著数量(0)
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