REFINEMENT OF PREDICTED PROTEIN STRUCTURES

预测蛋白质结构的精化

• 批准号: 6347920
• 负责人: MATTHEW R LEE
• 金额: $ 0.89万
• 依托单位: UNIVERSITY OF CALIFORNIA, SAN FRANCISCO
• 依托单位国家: 美国
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 美国
• 起止时间: 2000-07-01 至 2001-06-30
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://reporter.nih.gov/project-details/6347920
• 关键词: bioengineering /biomedical engineering; biological products; biomedical resource

I am working on the ab initio protein structure prediction of small proteins (<100 amino acids), such as POU1 and the villin headpiece. I am using molecular dynamics to perform high resolution conformational sampling in search of the native structure which we hope to be at the global minimum of our force field. Current methods used for overall fold prediction lack sufficient detail at the atomic level that will allow structure prediction to have significant practical application in areas such as drug design. The resources of the Computer Graphics Laboratory provide valuable tools to enable me to better analyze and visualize my data.

我正在研究从头开始的蛋白质结构预测 小蛋白质（<100 个氨基酸），例如 POU1 和绒毛蛋白 头巾。 我正在使用分子动力学来执行高分辨率 构象采样以寻找我们所研究的天然结构 希望处于我们力场的全球最低点。 目前的方法 用于整体折叠预测的原子缺乏足够的细节 水平将使结构预测具有显着的 药物设计等领域的实际应用。 的资源 计算机图形实验室提供了宝贵的工具，使我能够 更好地分析和可视化我的数据。