REFINEMENT OF PREDICTED PROTEIN STRUCTURES

预测蛋白质结构的精化

• 批准号: 6456758
• 负责人: MATTHEW R LEE
• 金额: $ 27.32万
• 依托单位: UNIVERSITY OF CALIFORNIA, SAN FRANCISCO
• 依托单位国家: 美国
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 美国
• 起止时间: 2001-07-01 至 2003-08-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://reporter.nih.gov/project-details/6456758
• 关键词: bioengineering /biomedical engineering; biological products; biomedical resource

I am working on the ab initio protein structure prediction of small proteins (<100 amino acids), such as POU1 and the villin headpiece. I am using molecular dynamics to perform high resolution conformational sampling in search of the native structure which we hope to be at the global minimum of our force field. Current methods used for overall fold prediction lack sufficient detail at the atomic level that will allow structure prediction to have significant practical application in areas such as drug design. The resources of the Computer Graphics Laboratory provide valuable tools to enable me to better analyze and visualize my data.

我正在进行蛋白质结构的从头预测 小蛋白（<100个氨基酸），如POU1和绒毛蛋白 头盔 我正在用分子动力学进行高分辨率的 构象取样，以寻找我们 希望能在全球范围内保持最小的力场。 当前方法 用于总体折叠预测的方法在原子处缺乏足够的细节， 水平，将允许结构预测有显着 在药物设计等领域的实际应用。 的资源 计算机图形实验室提供了宝贵工具，使我 来更好地分析和可视化我的数据。