Using ribosomes as molecular thermometers to predict optimal growth conditions and peer into the ancient history of life on Earth

使用核糖体作为分子温度计来预测最佳生长条件并探究地球上生命的古代历史

基本信息

  • 批准号:
    2601318
  • 负责人:
  • 金额:
    --
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    英国
  • 项目类别:
    Studentship
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    英国
  • 起止时间:
    2021 至 无数据
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

Introduction: We invite you to work with us to establish a new revolutionary method to peer into the ancient history of life on our planet. We will make this possible by studying ribosomes - the most ancient molecular machines in a living cell, the origin of which dates back to the beginning of life 4 billion years ago. Aims: We will use: 1. cryo-electron microscopy to determine structures of ribosomes from bacteria that are adapted to extreme environments, such as boiling water or extreme cold; 2. big data analysis to reveal hidden rules of ribosome adaptations to extreme environments; 3a. protein biophysics to assess how sequence variations in ribosomal proteins affect their melting temperatures; 3b. using plant genetics, assess how ribosomal mutations affect plant temperature tolerance; 4. using advanced 3D printing, create a museum exhibit to illustrate how biological molecules adapt to extreme environments. Outcomes: This study will reveal how ribosomes adapt to extreme temperatures and how ribosomes can be used as 'molecular thermometers': instead of running laboratory experiments, we will be able to accurately predict the optimal growth environment for a given organism by sequencing its ribosomal genes. This may forever change our approach to studying unculturable and extinct species and the history of climate change on our planet.Training: You will receive advanced training in structural biology and bioinformatics (at Newcastle University) and basic training in protein biophysics and plant genetics (at Durham University). You will also cooperate with a private company to master 3D printing of biological molecules and prepare part of our museum exhibit: 'Evolution in the world that Darwin never saw'.We encourage and train our students to master the arts of academic writing, oral communication and project/time management. We will help the student to publish at least two first-author papers and will do our best to support their transition to the next stage of their career in academia or industry. Requirements: We value most your intellectual curiosity, motivation, friendliness, and a strong work ethic. A basic understanding of molecular biology or physics is desired. Our mentorship philosophy: We believe that effective mentors help mentees succeed by adjusting the learning challenges to be 'just right' for them. We consider your Ph.D. training as your professional life from the stage of "birth" to "maturity": we will help you make your first baby steps and gradually become an independent, world-class expert leading your own research project.
简介:我们邀请您与我们合作,建立一种新的革命性方法,以窥视我们星球上生命的古老历史。我们将通过研究核糖体来实现这一目标-核糖体是活细胞中最古老的分子机器,其起源可以追溯到40亿年前生命的开始。目的:我们将用途:1.低温电子显微镜,以确定适应极端环境(如沸水或极冷)的细菌的核糖体结构; 2.大数据分析,揭示核糖体适应极端环境的隐藏规则; 3a.蛋白质生物物理学,以评估核糖体蛋白质中的序列变异如何影响它们的解链温度; 3b.利用植物遗传学,评估核糖体突变如何影响植物的温度耐受性; 4.使用先进的3D打印技术,创建一个博物馆展览,展示生物分子如何适应极端环境。成果:这项研究将揭示核糖体如何适应极端温度,以及核糖体如何被用作“分子温度计”:我们将能够通过对其核糖体基因进行测序来准确预测给定生物体的最佳生长环境,而不是进行实验室实验。这可能会永远改变我们研究不可培养和灭绝物种以及我们星球气候变化历史的方法。培训:您将接受结构生物学和生物信息学的高级培训(在纽卡斯尔大学)和蛋白质生物物理学和植物遗传学的基础培训(在达勒姆大学)。您还将与一家私人公司合作,掌握生物分子的3D打印,并准备我们博物馆展览的一部分:“达尔文从未见过的世界的进化”。我们鼓励和培养我们的学生掌握学术写作,口头交流和项目/时间管理的艺术。我们将帮助学生发表至少两篇第一作者论文,并将尽最大努力支持他们过渡到学术界或工业界职业生涯的下一阶段。要求:我们最看重你的求知欲、积极性、友好性和强烈的职业道德。对分子生物学或物理学有基本的了解。我们的指导理念:我们相信有效的导师通过调整学习挑战来帮助学员取得成功,使其“恰到好处”。我们认为你的博士学位。从“出生”到“成熟”的职业生涯:我们将帮助您迈出第一步,逐步成为独立的、世界级的专家,领导您自己的研究项目。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

其他文献

吉治仁志 他: "トランスジェニックマウスによるTIMP-1の線維化促進機序"最新医学. 55. 1781-1787 (2000)
Hitoshi Yoshiji 等:“转基因小鼠中 TIMP-1 的促纤维化机制”现代医学 55. 1781-1787 (2000)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
LiDAR Implementations for Autonomous Vehicle Applications
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
生命分子工学・海洋生命工学研究室
生物分子工程/海洋生物技术实验室
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
吉治仁志 他: "イラスト医学&サイエンスシリーズ血管の分子医学"羊土社(渋谷正史編). 125 (2000)
Hitoshi Yoshiji 等人:“血管医学与科学系列分子医学图解”Yodosha(涉谷正志编辑)125(2000)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Effect of manidipine hydrochloride,a calcium antagonist,on isoproterenol-induced left ventricular hypertrophy: "Yoshiyama,M.,Takeuchi,K.,Kim,S.,Hanatani,A.,Omura,T.,Toda,I.,Akioka,K.,Teragaki,M.,Iwao,H.and Yoshikawa,J." Jpn Circ J. 62(1). 47-52 (1998)
钙拮抗剂盐酸马尼地平对异丙肾上腺素引起的左心室肥厚的影响:“Yoshiyama,M.,Takeuchi,K.,Kim,S.,Hanatani,A.,Omura,T.,Toda,I.,Akioka,
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:

的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('', 18)}}的其他基金

An implantable biosensor microsystem for real-time measurement of circulating biomarkers
用于实时测量循环生物标志物的植入式生物传感器微系统
  • 批准号:
    2901954
  • 财政年份:
    2028
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Exploiting the polysaccharide breakdown capacity of the human gut microbiome to develop environmentally sustainable dishwashing solutions
利用人类肠道微生物群的多糖分解能力来开发环境可持续的洗碗解决方案
  • 批准号:
    2896097
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
A Robot that Swims Through Granular Materials
可以在颗粒材料中游动的机器人
  • 批准号:
    2780268
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Likelihood and impact of severe space weather events on the resilience of nuclear power and safeguards monitoring.
严重空间天气事件对核电和保障监督的恢复力的可能性和影响。
  • 批准号:
    2908918
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Proton, alpha and gamma irradiation assisted stress corrosion cracking: understanding the fuel-stainless steel interface
质子、α 和 γ 辐照辅助应力腐蚀开裂:了解燃料-不锈钢界面
  • 批准号:
    2908693
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Field Assisted Sintering of Nuclear Fuel Simulants
核燃料模拟物的现场辅助烧结
  • 批准号:
    2908917
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Assessment of new fatigue capable titanium alloys for aerospace applications
评估用于航空航天应用的新型抗疲劳钛合金
  • 批准号:
    2879438
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Developing a 3D printed skin model using a Dextran - Collagen hydrogel to analyse the cellular and epigenetic effects of interleukin-17 inhibitors in
使用右旋糖酐-胶原蛋白水凝胶开发 3D 打印皮肤模型,以分析白细胞介素 17 抑制剂的细胞和表观遗传效应
  • 批准号:
    2890513
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
CDT year 1 so TBC in Oct 2024
CDT 第 1 年,预计 2024 年 10 月
  • 批准号:
    2879865
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Understanding the interplay between the gut microbiome, behavior and urbanisation in wild birds
了解野生鸟类肠道微生物组、行为和城市化之间的相互作用
  • 批准号:
    2876993
  • 财政年份:
    2027
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship

相似海外基金

Identifying neurons for interoception using simultaneous profiling of activity- and projection- specific populations
使用活动和投射特定群体的同步分析来识别用于内感受的神经元
  • 批准号:
    10687590
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Development of methods for highly multiplexed quantification of cancer proteomes using large-scale nanobody libraries
使用大规模纳米抗体库开发癌症蛋白质组高度多重定量的方法
  • 批准号:
    10714023
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Using strain history to improve prediction of the evolution of antimicrobial resistance in Acinetobacter baumannii
利用菌株历史改进对鲍曼不动杆菌抗菌药物耐药性演变的预测
  • 批准号:
    10677362
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Targeting Viral RNA Using a Sequence Programmable Small Molecule-Oligonucleotide Conjugate
使用序列可编程小分子-寡核苷酸缀合物靶向病毒 RNA
  • 批准号:
    10512627
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Translational profiling of bladder sensory nerves and their cell type identities using dissociation free single nucleus sequencing
使用无解离单核测序对膀胱感觉神经及其细胞类型进行翻译分析
  • 批准号:
    10456999
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Structural Studies of Macromolecular Assemblies Using Cryo-EM
使用冷冻电镜进行大分子组装体的结构研究
  • 批准号:
    10552673
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Functional Interrogation Of Ribosomal Biology Using Continuous Evolution
利用连续进化对核糖体生物学进行功能探究
  • 批准号:
    10459135
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Form and function of the bacterial nucleoid: structural studies using cryo-ET
细菌核的形式和功能:使用冷冻电子断层扫描进行结构研究
  • 批准号:
    10534657
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Structural Studies of Macromolecular Assemblies Using Cryo-EM
使用冷冻电镜进行大分子组装体的结构研究
  • 批准号:
    10335173
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Translational profiling of bladder sensory nerves and their cell type identities using dissociation free single nucleus sequencing
使用无解离单核测序对膀胱感觉神经及其细胞类型进行翻译分析
  • 批准号:
    10309020
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了