Comprehensive phenotypic and genetic assessment of trachealesophageal (TE) birth defects patients

摘要，项目第1部分： -- -- 气管、食道和出生缺陷(TED)发生在气管和食道分离后。 常见的胎盘是在胎儿早期发育的过程中被打乱的。在出生时，TED通常是在没有产前检查的情况下出现的。 诊断：如果不纠正，TED可能会扰乱正常的呼吸和/或喂奶，通常会危及生命。 即使在手术矫正的情况下，他们也经常与长期的心脏合并症有关。 令人信服的证据表明，TED是一种主要的遗传基因成分，其病因在很大程度上是未知的。大约有40%的候选人。 突变也没有被认为与TED有不同程度的信心，但这些基因中只有十几个与突变有关。 他们已经在动物模型中得到了验证，即使在那时，他们用来监管这些动物的发展和机制也很糟糕。 明白了。我们的前提是，没有任何独特的、未经研究的基因突变会导致TED。 这些基因在不同的发育途径中发挥作用，以进一步确定不同的TED解剖结构和组织学表型。 并最终决定了这些患者的临床和病理转归。加深了我们对TED的临床和病理特征的了解。 由于缺乏一份详细的、大规模的遗传学、解剖学、医学和临床医学调查报告，这一问题一直受到阻碍。 因此，这项研究项目的主要目标是进一步提高我们对人类遗传学和遗传物质的认识。 探讨气管、食道及出生缺陷(TEDS)的解剖学基础，以期提高诊断水平，确定相关因素。 这将影响患者的预后，并推动治疗和战略的制定。第二个目标目标被认为是实现该目标的催化剂。 发展生物生物学将通过建立一个更全面的生物数据库的创建计划，在第二季度和第三季度的两个项目中进行研究。 整合组织学和解剖学表型、基因分型、基因和临床预后数据。 -- 目标1：通过使用TED的三个基因组测序技术，识别患有TED的患者中可能存在的致病基因突变。 患者与他们的亲生父母在一起。 -- 目的2：探讨老年TEDs患者的食道、气管、纵隔及肺部解剖特点。 手术前和手术后。 -- 目标3：创建一个多中心的TED注册中心，该注册中心集成了最新的临床医学和解剖学基础的详细描述信息。 TTED患者的表型、基因分型、手术修复策略、预后及远期临床预后。

Summary, Project 1      Tracheal esophageal birth defects (TEDs) occur when the separation of the trachea and esophagus from the  common  foregut  is  disrupted  during  early  fetal  development.    TEDs  often  present  at  birth  without  a  prenatal  diagnosis and if left uncorrected, TEDs disrupt proper breathing and/or feeding and are usually life threatening.   Even  when  corrected  surgically,  they  are  often  associated  with  long-­term  comorbidity.  Although  there  is  compelling evidence for a major genetic component, the etiology of TEDs is largely unknown. About 40 candidate  mutations have been associated with TEDs with varying degrees of confidence, but only a dozen of these genes  have  been  validated  in  animal  models  and  even  then  the  development  mechanisms  they  regulate  are  poorly  understood.  Our Premise is that there are unique unstudied genetic mutations that cause TEDs and that  these act in distinct developmental pathways to determine the TED anatomic and histological phenotype  and ultimately the clinical outcome of these patients.  Our understanding of the clinical pathology of TEDs  has  been  hampered  by  the  lack  of  a  detailed  large  scale  genetic,  anatomic,  and  clinical  investigation  of  this  patient population.  Therefore, the primary goal of this project is to improve our understanding of the genetic and  anatomic  basis  of  tracheal  esophageal  birth  defects  (TEDs)  in  order  to  enhance  diagnosis,  determine  factors  that  influence  prognosis  and  advance  treatment  strategies.    The  second  goal  is  to  serve  as  catalyst  for  the  developmental biology studies in projects 2 and 3 through the creation of a comprehensive database that will  integrate histological and anatomic phenotype, genotype, and clinical outcome data.      Aim 1: Identify candidate causative mutations in patients with TEDs using trio genomic sequencing of TED  patients and their parents.      Aim  2:  Investigate  the  esophageal,  tracheal,  mediastinal  and  pulmonary  anatomy  in  patients  with  TEDs  before and after surgical repair.    Aim 3: Create a multi-­center TED registry that integrates a detailed description of the clinical and anatomic  phenotype, genotype, surgical repair strategy, and long term clinical outcome in TED patients.