Research Center for Cancer Systems Biology: Cancer Cell Map Initiative

中国癌症细胞图谱研究倡议：中国 一个国家癌症系统和生物学研究中心。 总体而言，报告摘要。 第一个癌症基因组图谱项目和其他姊妹项目现在已经完成了对超过1万个肿瘤基因组的分析工作。 提供一个新的基因和突变的目录表，复制一些变异体和其他可能导致的新的基因突变。 癌症。在许多癌症病例中，目前尚不清楚，然而，在一种情况下，哪些是突变的主要原因，还是依赖关系的原因。 鉴于癌症的发生和这些因素如何影响发病机制和对治疗的反应，尽管这些肿瘤属于相似的肿瘤类型。 而临床试验的结果也可能有一些基因突变的模式，这些突变是非常不同的，但它正变得越来越明显。 这些基因突变反复地被劫持，这是分子信号通路和网络的相同标志。出于这个原因，我们需要。 癌症的研究和治疗越来越依赖于生物信息网的知识，而不是多种多样的。 类型，包括蛋白质之间的物理相互作用和合成致命性相互作用以及上位性相互作用。 基因。在这里，我们将寻求对一项新的研究努力的支持，这是一项新的研究努力，即旨在促进人类健康的癌症研究细胞图谱研究倡议(CCMI)。 全面详细地介绍了癌症、基因和蛋白质之间的这些复杂的相互作用，以及它们之间的区别。 在患病的加州和健康的加州之间。CCMI是加州大学洛杉矶分校的一项新的多校区教育倡议。 以加州大学旧金山分校和加州大学圣地亚哥分校为中心，后者利用先进的数据网络映射和计算能力。 分析癌症和癌症研究的平台是由多名CCMI调查人员在过去十年中开发的。因此， 准备就绪后，这些生物平台将被重新转换，以高效地生成、组装和分析癌症和分子生物学网络。 从长远的角度出发，向基于路径的治疗和基于网络的个性化治疗迈进。具体地说，将在未来五年内完成这一目标。 CCMI委员会还将寻求机会，以全面推动中国在癌症、研究和治疗领域的重大三个阶段的过渡。 绘制癌症和蛋白质之间相互作用的物理网络图，揭示主要蛋白质和蛋白质复合体的结构和功能。 更高阶的分子单位在癌症;研究(2)的选择下被映射到合成致命的生物的第一个平行分子网络中。 以及癌症相关基因之间的上位性相互作用，进一步揭示了癌症;基因的功能和逻辑模式(3)。 强大的计算技术方法论，以及最终用户的软件、计算机和计算机数据库，可用于组装和使用癌症细胞。 网络地图出现在基础医疗和临床医疗模式;大楼(4)中，是领先的癌症研究人员的关键和大规模医疗活动。 在全球范围内，将CCMI计划扩展为一个新的全球协调合作伙伴关系;计划和计划(5)，以培训当前的计划和计划。 下一代科学家致力于网络生物学研究，并将其应用于癌症和研究。

THE CANCER CELL MAP INITIATIVE:  A NATIONAL RESEARCH CENTER FOR CANCER SYSTEMS BIOLOGY  OVERALL SUMMARY  The Cancer Genome Atlas and sister projects have now completed analysis of over 10,000 tumor genomes,  providing  a  catalog  of  the  gene  mutations,  copy  number  variants  and  other  genetic  alterations  that  cause  cancer. In many cases it remains unclear, however, which are the key driver mutations or dependencies in a  given cancer and how these influence pathogenesis and response to therapy. Although tumors of similar types  and clinical outcomes can have patterns of mutations that are strikingly different, it is becoming apparent that  these  mutations  recurrently  hijack  the  same  hallmark  molecular  pathways  and  networks.  For  this  reason,  cancer  research  and  treatment  is  increasingly  dependent  on  knowledge  of  biological  networks  of  multiple  types,  including  physical  interactions  among  proteins  and  synthetic­lethal  and  epistatic  interactions  among  genes.  Here  we  seek  support  for  a  new  effort,  The  Cancer  Cell  Map  Initiative  (CCMI),  aimed  at  comprehensively detailing these complex interactions among cancer genes and proteins and how they differ  between  diseased  and  healthy  states.  The  CCMI  is  a  multi­campus  initiative  of  the  University  of  California,  centered at UC San Francisco and UC San Diego, which leverages advanced network mapping, computational  analysis and cancer research platforms developed by multiple CCMI investigators over the past decade. Thus  primed, these platforms will be turned to efficiently generate, assemble and analyze cancer molecular networks  with a view towards pathway and network­based personalized therapy. Specifically, over the next five years  the CCMI will seek to catalyze major phase transitions in cancer research and therapy by (1) Comprehensively  mapping  the  networks  of  physical  interactions  among  cancer  proteins,  revealing  the  protein  complexes  and  higher­order  molecular  units  under  selection  in  cancer;  (2)  Mapping  the  parallel  networks  of  synthetic­lethal  and epistatic interactions among cancer genes, revealing the functional logic of cancer; (3) Establishing the  robust  computational  methodology,  end­user  software,  and  databases  for  assembly  and  use  of  cancer  cell  network maps in both basic and clinical modalities; (4) Building a critical mass of leading cancer investigators  worldwide  to  expand  CCMI  into  a  global  coordinated  partnership;  and  (5)  Training  the  current  and  next­generation of scientists in Network Biology and its applications to cancer research.