The role of DOT1L methyltransferase in controlling the noncoding transcriptome

DOT1L 甲基转移酶在控制非编码转录组中的作用

基本信息

  • 批准号:
    10809451
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.58万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2023
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2023-05-22 至 2023-07-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

The broad goal of our research is to understand how gene expression is regulated during animal development. Our specific interest is in finding natural regulators of endogenous double-stranded RNA production and nuclear RNA interference. In this regard, we are focusing on the relationship between RNA interference and the histone H3 lysine 79 DOT1L methyltransferase complex. A connection between the DOT1L interacting partner ZFP-1 (AF10 in mammals) and RNAi in C. elegans was suggested by genetic experiments 13-15 years ago. To understand this connection, my laboratory undertook molecular and genomic studies of ZFP-1 and DOT1L. These studies not only confirmed the connection to RNAi, but also provided novel insights about the conserved role of DOT1L in transcription regulation. The DOT1L enzyme is essential for mammalian development and has been implicated in the pathogenesis of leukemia and breast cancer. However, the exact role of DOT1L in gene regulation is not clear. Preliminary work from our lab has begun to reveal this role; we have discovered that DOT1L and H3K79 methylation globally suppress non-coding RNA transcription in C. elegans, including that of antisense and enhancer RNAs. Our preliminary data strongly suggest ectopic dsRNA formation and small RNA production upon DOT1L loss-of-function. Our main goals are: 1) to detect and characterize these dsRNA and small RNA molecules in C. elegans; 2) to explore the possibility that the dsRNA suppressing function of DOT1L is conserved in mammals, and 3) to investigate the mechanism of transcription regulation by DOT1L in development using the C. elegans and zebrafish systems. The project is not specific to bioethics research or capacity building in bioethics. Undergraduate and high school students will actively participate in the proposed research.
我们研究的主要目标是了解动物发育过程中基因表达是如何调节的。 我们的具体兴趣是寻找内源性双链RNA产生和核的天然调节因子 RNA干扰。在这方面,我们重点关注RNA干扰与组蛋白之间的关系 H3 赖氨酸 79 DOT1L 甲基转移酶复合物。 DOT1L 交互伙伴 ZFP-1 之间的连接 (哺乳动物中的 AF10)和线虫中的 RNAi 是在 13-15 年前通过基因实验提出的。到 为了了解这种联系,我的实验室对 ZFP-1 和 DOT1L 进行了分子和基因组研究。 这些研究不仅证实了与 RNAi 的联系,而且提供了关于保守的新见解 DOT1L 在转录调控中的作用。 DOT1L 酶对于哺乳动物的发育至关重要,并且具有 与白血病和乳腺癌的发病机制有关。然而,DOT1L 在基因中的确切作用 监管不明确。我们实验室的初步工作已经开始揭示这一作用;我们发现 DOT1L 和 H3K79 甲基化全面抑制线虫中的非编码 RNA 转录,包括 反义RNA和增强子RNA。我们的初步数据强烈表明异位 dsRNA 形成和小 RNA DOT1L 功能丧失后的生产。我们的主要目标是:1)检测和表征这些 dsRNA 线虫中的小 RNA 分子; 2)探讨DOT1L抑制dsRNA功能的可能性 在哺乳动物中是保守的,3) 研究 DOT1L 在哺乳动物中的转录调控机制 使用线虫和斑马鱼系统进行开发。 该项目并非专门针对生物伦理​​学研究或生物伦理学能力建设。本科和高中 学生将积极参与拟议的研究。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Small RNAs Worm Up Transgenerational Epigenetics Research.
  • DOI:
    10.3390/dna1020005
  • 发表时间:
    2021-12
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Grishok A
  • 通讯作者:
    Grishok A
DOT1L stimulates MYC/Mondo transcription factor activity by promoting its degradation cycle on chromatin.
DOT1L 通过促进染色质上的降解循环来刺激 MYC/Mondo 转录因子活性。
  • DOI:
    10.1101/2024.02.06.579191
  • 发表时间:
    2024
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Sepulveda,GianP;Gushchanskaia,EkaterinaS;Mora-Martin,Alexandra;Esse,Ruben;Nikorich,Iana;Ceballos,Ainhoa;Kwan,Julian;Blum,BenjaminC;Dholiya,Prakruti;Emili,Andrew;Perissi,Valentina;Cardamone,MariaD;Grishok,Alla
  • 通讯作者:
    Grishok,Alla
Shaking up the silence: consequences of HMGN1 antagonizing PRC2 in the Down syndrome brain.
  • DOI:
    10.1186/s13072-022-00471-6
  • 发表时间:
    2022-12-03
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
  • 通讯作者:
The proline-rich domain of MML-1 is biologically important but not required for localization to target promoters.
  • DOI:
    10.17912/micropub.biology.000498
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ceballos A;Esse R;Grishok A
  • 通讯作者:
    Grishok A
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Alla Grishok其他文献

Alla Grishok的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Alla Grishok', 18)}}的其他基金

The role of DOT1L methyltransferase in controlling the noncoding transcriptome
DOT1L 甲基转移酶在控制非编码转录组中的作用
  • 批准号:
    10581918
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
The role of DOT1L methyltransferase in controlling the noncoding transcriptome
DOT1L 甲基转移酶在控制非编码转录组中的作用
  • 批准号:
    10460485
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
The role of DOT1L methyltransferase in controlling the noncoding transcriptome
DOT1L 甲基转移酶在控制非编码转录组中的作用
  • 批准号:
    10223379
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
The role of DOT1L methyltransferase in controlling the noncoding transcriptome
DOT1L 甲基转移酶在控制非编码转录组中的作用
  • 批准号:
    10669669
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
Regulation of RNA processing and transcription by endogenous RNAi
内源性 RNAi 对 RNA 加工和转录的调节
  • 批准号:
    8757055
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
Regulation of RNA processing and transcription by endogenous RNAi
内源性 RNAi 对 RNA 加工和转录的调节
  • 批准号:
    9010960
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
Investigating the Potential of Endogenous RNAi in Mediating Adaptation to Environ
研究内源性 RNAi 介导环境适应的潜力
  • 批准号:
    7840683
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:

相似海外基金

University of Aberdeen and Vertebrate Antibodies Limited KTP 23_24 R1
阿伯丁大学和脊椎动物抗体有限公司 KTP 23_24 R1
  • 批准号:
    10073243
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
    Knowledge Transfer Partnership
Role of Natural Antibodies and B1 cells in Fibroproliferative Lung Disease
天然抗体和 B1 细胞在纤维增生性肺病中的作用
  • 批准号:
    10752129
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
CAREER: Next-generation protease inhibitor discovery with chemically diversified antibodies
职业:利用化学多样化的抗体发现下一代蛋白酶抑制剂
  • 批准号:
    2339201
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Isolation and characterisation of monoclonal antibodies for the treatment or prevention of antibiotic resistant Acinetobacter baumannii infections
用于治疗或预防抗生素耐药鲍曼不动杆菌感染的单克隆抗体的分离和表征
  • 批准号:
    MR/Y008693/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
    Research Grant
Discovery of novel nodal antibodies in the central nervous system demyelinating diseases and elucidation of the mechanisms through an optic nerve demyelination model
发现中枢神经系统脱髓鞘疾病中的新型节点抗体并通过视神经脱髓鞘模型阐明其机制
  • 批准号:
    23K14783
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Elucidation of the mechanisms controlling the physicochemical properties and functions of supercharged antibodies and development of their applications
阐明控制超电荷抗体的理化性质和功能的机制及其应用开发
  • 批准号:
    23KJ0394
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Developing first-in-class aggregation-specific antibodies for a severe genetic neurological disease
开发针对严重遗传神经系统疾病的一流聚集特异性抗体
  • 批准号:
    10076445
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
    Grant for R&D
PLA2G2D Antibodies for Cancer Immunotherapy
用于癌症免疫治疗的 PLA2G2D 抗体
  • 批准号:
    10699504
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
Genetic adjuvants to elicit neutralizing antibodies against HIV
基因佐剂可引发抗艾滋病毒中和抗体
  • 批准号:
    10491642
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
Novel Immunogens to Elicit Broadly Cross-reactive Antibodies That Target the Hemagglutinin Head Trimer Interface
新型免疫原可引发针对血凝素头三聚体界面的广泛交叉反应抗体
  • 批准号:
    10782567
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.58万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了