Combinatorial algorithms for complex rearrangement discovery in whole genome sequences of tumour genomes

用于肿瘤基因组全基因组序列中复杂重排发现的组合算法

基本信息

  • 批准号：
    425866-2012
  • 负责人：
    McPherson, Andrew
  • 金额：
    $ 2.55万
  • 依托单位：
    Simon Fraser University
  • 依托单位国家：
    加拿大
  • 项目类别：
    Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Doctoral
  • 财政年份：
    2012
  • 资助国家：
    加拿大
  • 起止时间：
    2012-01-01 至 2013-12-31
  • 项目状态：
    已结题

项目摘要

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项目成果

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McPherson, Andrew其他文献

Clonal Decomposition and DNA Replication States Defined by Scaled Single-Cell Genome Sequencing
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    2019-11-14
  • 期刊：
    CELL
  • 影响因子：
    64.5
  • 作者：
    Laks, Emma;McPherson, Andrew;Aparicio, Samuel
  • 通讯作者：
    Aparicio, Samuel
Interfaces of Malignant and Immunologic Clonal Dynamics in Ovarian Cancer
  • DOI：
    10.1016/j.cell.2018.03.073
  • 发表时间：
    2018-06-14
  • 期刊：
    CELL
  • 影响因子：
    64.5
  • 作者：
    Zhang, Allen W.;McPherson, Andrew;Shah, Sohrab P.
  • 通讯作者：
    Shah, Sohrab P.
MHC class II transactivator CIITA is a recurrent gene fusion partner in lymphoid cancers.
  • DOI：
    10.1038/nature09754
  • 发表时间：
    2011-03-17
  • 期刊：
    NATURE
  • 影响因子：
    64.8
  • 作者：
    Steidl, Christian;Shah, Sohrab P.;Woolcock, Bruce W.;Rui, Lixin;Kawahara, Masahiro;Farinha, Pedro;Johnson, Nathalie A.;Zhao, Yongjun;Telenius, Adele;Ben Neriah, Susana;McPherson, Andrew;Meissner, Barbara;Okoye, Ujunwa C.;Diepstra, Arjan;van den Berg, Anke;Sun, Mark;Leung, Gillian;Jones, Steven J.;Connors, Joseph M.;Huntsman, David G.;Savage, Kerry J.;Rimsza, Lisa M.;Horsman, Douglas E.;Staudt, Louis M.;Steidl, Ulrich;Marra, Marco A.;Gascoyne, Randy D.
  • 通讯作者：
    Gascoyne, Randy D.
Single-cell genomic variation induced by mutational processes in cancer.
  • DOI：
    10.1038/s41586-022-05249-0
  • 发表时间：
    2022-12
  • 期刊：
    NATURE
  • 影响因子：
    64.8
  • 作者：
    Funnell, Tyler;O'Flanagan, Ciara H.;Williams, Marc J.;McPherson, Andrew;McKinney, Steven;Kabeer, Farhia;Lee, Hakwoo;Salehi, Sohrab;Vazquez-Garcia, Ignacio;Shi, Hongyu;Leventhal, Emily;Masud, Tehmina;Eirew, Peter;Yap, Damian;Zhang, Allen W.;Lim, Jamie L. P.;Wang, Beixi;Brimhall, Jazmine;Biele, Justina;Ting, Jerome;Au, Vinci;Van Vliet, Michael;Liu, Yi Fei;Beatty, Sean;Lai, Daniel;Pham, Jenifer;Grewal, Diljot;Abrams, Douglas;Havasov, Eliyahu;Leung, Samantha;Bojilova, Viktoria;Moore, Richard A.;Rusk, Nicole;Uhlitz, Florian;Ceglia, Nicholas;Weiner, Adam C.;Zaikova, Elena;Douglas, J. Maxwell;Zamarin, Dmitriy;Weigelt, Britta;Kim, Sarah H.;Paula, Arnaud Da Cruz;Reis-Filho, Jorge S.;Martin, Spencer D.;Li, Yangguang;Xu, Hong;de Algara, Teresa Ruiz;Lee, So Ra;Llanos, Viviana Cerda;Huntsman, David G.;McAlpine, Jessica N.;Shah, Sohrab P.;Aparicio, Samuel
  • 通讯作者：
    Aparicio, Samuel
Integrated genome and transcriptome sequencing identifies a novel form of hybrid and aggressive prostate cancer.
  • DOI：
    10.1002/path.3987
  • 发表时间：
    2012-05
  • 期刊：
    JOURNAL OF PATHOLOGY
  • 影响因子：
    7.3
  • 作者：
    Wu, Chunxiao;Wyatt, Alexander W.;Lapuk, Anna V.;McPherson, Andrew;McConeghy, Brian J.;Bell, Robert H.;Anderson, Shawn;Haegert, Anne;Brahmbhatt, Sonal;Shukin, Robert;Mo, Fan;Li, Estelle;Fazli, Ladan;Hurtado-Coll, Antonio;Jones, Edward C.;Butterfield, Yaron S.;Hach, Faraz;Hormozdiari, Fereydoun;Hajirasouliha, Iman;Boutros, Paul C.;Bristow, Robert G.;Jones, Steven J. M.;Hirst, Martin;Marra, Marco A.;Maher, Christopher A.;Chinnaiyan, Arul M.;Sahinalp, S. Cenk;Gleave, Martin E.;Volik, Stanislav V.;Collins, Colin C.
  • 通讯作者：
    Collins, Colin C.

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  • 财政年份：
    2017
  • 资助金额：
    $ 2.55万
  • 项目类别：
Enhancing miRNA Therapeutics through Combinatorial Targeting and Vehicle Free Delivery
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    9247601
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    2017
  • 资助金额：
    $ 2.55万
  • 项目类别：
Enhancing miRNA Therapeutics through Combinatorial Targeting and Vehicle Free Delivery
通过组合靶向和无载体递送增强 miRNA 治疗
  • 批准号：
    10237907
  • 财政年份：
    2017
  • 资助金额：
    $ 2.55万
  • 项目类别：
Combinatorial algorithms for complex rearrangement discovery in whole genome sequences of tumour genomes
用于肿瘤基因组全基因组序列中复杂重排发现的组合算法
  • 批准号：
    425866-2012
  • 财政年份：
    2013
  • 资助金额：
    $ 2.55万
  • 项目类别：
    Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Doctoral
Combinatorial microRNA regulation of cardiac transcription factors
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    2011
  • 资助金额：
    $ 2.55万
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Combinatorial microRNA regulation of cardiac transcription factors
心脏转录因子的组合 microRNA 调节
  • 批准号：
    8392248
  • 财政年份：
    2011
  • 资助金额：
    $ 2.55万
  • 项目类别：
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