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Impact of personalized genomes in bionformatics and genomic analysis

个性化基因组对生物信息学和基因组分析的影响

基本信息

批准号：
542988-2019
负责人：
Groza, Cristian
金额：
$ 1.27万
依托单位：
McGill University
依托单位国家：
加拿大
项目类别：
Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Master's
财政年份：
2019
资助国家：
加拿大
起止时间：
2019-01-01 至 2020-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=676322
关键词：
Impact personalized genomes bionformatics genomic

项目摘要

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项目成果

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Groza, Cristian其他文献

Personalized and graph genomes reveal missing signal in epigenomic data

DOI：
10.1186/s13059-020-02038-8
发表时间：
2020-05-25
期刊：
GENOME BIOLOGY
影响因子：
12.3
作者：
Groza, Cristian;Kwan, Tony;Bourque, Guillaume
通讯作者：
Bourque, Guillaume

Pangenome graphs improve the analysis of structural variants in rare genetic diseases.

DOI：
10.1038/s41467-024-44980-2
发表时间：
2024-01-22
期刊：
NATURE COMMUNICATIONS
影响因子：
16.6
作者：
Groza, Cristian;Schwendinger-Schreck, Carl;Cheung, Warren A.;Farrow, Emily G.;Thiffault, Isabelle;Lake, Juniper;Rizzo, William B.;Evrony, Gilad;Curran, Tom;Bourque, Guillaume;Pastinen, Tomi
通讯作者：
Pastinen, Tomi

A draft human pangenome reference.

DOI：
10.1038/s41586-023-05896-x
发表时间：
2023-05
期刊：
NATURE
影响因子：
64.8
作者：
Liao, Wen-Wei;Asri, Mobin;Ebler, Jana;Doerr, Daniel;Haukness, Marina;Hickey, Glenn;Lu, Shuangjia;Lucas, Julian K.;Monlong, Jean;Abel, Haley J.;Buonaiuto, Silvia;Chang, Xian H.;Cheng, Haoyu;Chu, Justin;Colonna, Vincenza;Eizenga, Jordan M.;Feng, Xiaowen;Fischer, Christian;Fulton, Robert S.;Garg, Shilpa;Groza, Cristian;Guarracino, Andrea;Harvey, William T.;Heumos, Simon;Howe, Kerstin;Jain, Miten;Lu, Tsung-Yu;Markello, Charles;Martin, Fergal J.;Mitchell, Matthew W.;Munson, Katherine M.;Mwaniki, Moses Njagi;Novak, Adam M.;Olsen, Hugh E.;Pesout, Trevor;Porubsky, David;Prins, Pjotr;Sibbesen, Jonas A.;Siren, Jouni;Tomlinson, Chad;Villani, Flavia;Vollger, Mitchell R.;Antonacci-Fulton, Lucinda L.;Baid, Gunjan;Baker, Carl A.;Belyaeva, Anastasiya;Billis, Konstantinos;Carroll, Andrew;Chang, Pi-Chuan;Cody, Sarah;Cook, Daniel E.;Cook-Deegan, Robert M.;Cornejo, Omar E.;Diekhans, Mark;Ebert, Peter;Fairley, Susan;Fedrigo, Olivier;Felsenfeld, Adam L.;Formenti, Giulio;Frankish, Adam;Gao, Yan;Garrison, Nanibaa'A.;Giron, Carlos Garcia;Green, Richard E.;Haggerty, Leanne;Hoekzema, Kendra;Hourlier, Thibaut;Ji, Hanlee P.;Kenny, Eimear E.;Koenig, Barbara A.;Kolesnikov, Alexey;Korbel, Jan O.;Kordosky, Jennifer;Koren, Sergey;Lee, HoJoon;Lewis, Alexandra P.;Magalhaes, Hugo;Marco-Sola, Santiago;Marijon, Pierre;McCartney, Ann;McDaniel, Jennifer;Mountcastle, Jacquelyn;Nattestad, Maria;Nurk, Sergey;Olson, Nathan D.;Popejoy, Alice B.;Puiu, Daniela;Rautiainen, Mikko;Regier, Allison A.;Rhie, Arang;Sacco, Samuel;Sanders, Ashley D.;Schneider, Valerie A.;Schultz, Baergen I.;Shafin, Kishwar;Smith, Michael W.;Sofia, Heidi J.;Abou Tayoun, Ahmad N.;Thibaud-Nissen, Francoise;Tricomi, Francesca Floriana;Wagner, Justin;Walenz, Brian;Wood, Jonathan M. D.;Zimin, Aleksey V.;Bourque, Guillaume;Chaisson, Mark J. P.;Flicek, Paul;Phillippy, Adam M.;Zook, Justin M.;Eichler, Evan E.;Haussler, David;Wang, Ting;Jarvis, Erich D.;Miga, Karen H.;Erik, Garrison;Tobias, Marschall;Ira, M. Hall;Li, Heng;Paten, Benedict
通讯作者：
Paten, Benedict

Transposable elements are associated with the variable response to influenza infection.

DOI：
10.1016/j.xgen.2023.100292
发表时间：
2023-05-10
期刊：
CELL GENOMICS
影响因子：
0
作者：
Chen, Xun;Pacis, Alain;Aracena, Katherine A.;Gona, Saideep;Kwan, Tony;Groza, Cristian;Lin, Yen Lung;Sindeaux, Renata;Yotova, Vania;Pramatarova, Albena;Pastinen, Tomi;Simon, Marie -Michelle;Pastinen, Tomi;Barreiro, Luis B.;Bourque, Guillaume
通讯作者：
Bourque, Guillaume