Microbial dynamics in the ocean: An integrated approach

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Bactéries marines utilisent plus de 50% de la production primaire dans l'océan, leur biomasse dépasse souvent celle des producteurs primaires, ils ont des rôles importants dans les principaux processus biogéochimiques et ces processus ont des rétroactions importantes pour le climat mondial. Communautés microbiennes marines entraînement les plus importants au niveau mondial les processus écologiques et biogéochimiques, tels que le carbone marin, d'azote et de soufre cycles, mais nous savons très peu sur la composition de la commuity et leur rôle spécifique dans l'océan. Les questions que nous proposons d'aborder sont assez simples. Nous demandons qui est là, que font-ils et comment seront-ils changer lorsque les changements climatiques de l'océan! Bien que les questions semblent simples et directes, les réponses ne sont pas! Jusqu'à l'introduction de la culture indépendante en utilisant des techniques de l'analyse des séquences du gène 16S RNA directement amplifié par PCR de DNA de l'environnement (ie métagénomique), notre capacité à caractériser "qui est là» et «ce qu'ils font» a été très limitée. La recherche proposée va utiliser une combinaison de la taxonomie, les techniques physiologiques, isotopiques et moléculaires dans les zones côtières et au large des milieux marins afin d'examiner les variations spatiales et temporelles dans chaque espèce bactérienne, les mécanismes sous-jacents des changements dans la structure des communautés et leurs contributions à la médiation microbienne de carbone et élémentaire débit. Cette recherche sera de répondre à certaines questions fondamentales écologiques et évolutionnaires de savoir si les changements observés spatiale ou temporelle dans la communauté microbienne sont sont dus à une adaptation ou un changement dans la structure de l'assemblage. Ceci a des implications profondes sur la façon dont les communautés microbiennes sont influencées par les processus climatiques et dans les processus biogéochimiques l'influence tour dans l'océan supérieur.