Renewal of essential flow cytometry instrumentation for the study of marine microbes

更新海洋微生物研究所需的流式细胞仪

基本信息

  • 批准号:
    RTI-2021-00138
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 7.71万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    加拿大
  • 项目类别:
    Research Tools and Instruments
  • 财政年份:
    2020
  • 资助国家:
    加拿大
  • 起止时间:
    2020-01-01 至 2021-12-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Marine microbes provide essential ecosystem services, including the vast majority of marine primary productivity and the addition of huge quantities of new nitrogen to the ocean. In order to understand how marine microbes support these ecosystem services, and how that might change in the future, high-quality measurements of the abundance and physical characteristics of marine microbes are required. Flow cytometry enables counting and characterization of cells by flowing them through a beam of focused light. That light is scattered and fluorescence is emitted in a manner that is specific to the characteristics of each cell. This enables researchers to determine the abundance, size and pigment content of marine microbes at the single cell level. Here we request funds to replace a discontinued flow cytometer, which was used heavily by two research groups in the last 7 years. A new model of this sensitive, robust, user-friendly instrument will enable these two large research groups to continue studies that (1) determine the responses of marine microbes to changes in temperature, in the laboratory and in the field, (2) examine who the important nitrogen cycling marine microbes are and what controls their growth and abundance, and (3) determine the role of micronutrients and microbial interactions in controlling the growth of marine primary producers. The results of these studies will enhance our understanding of how productivity in the ocean may change in the future, as the Earth's climate warms. This is important for Canadians because this ocean productivity is directly related to both the production of fisheries resources and to the movement of carbon dioxide from the atmosphere to the deep ocean.
海洋微生物提供基本的生态系统服务,包括绝大多数海洋初级生产力和向海洋添加大量新氮。为了了解海洋微生物如何支持这些生态系统服务,以及未来可能如何变化,需要对海洋微生物的丰度和物理特性进行高质量的测量。流式细胞术能够通过使细胞流过聚焦光束来对细胞进行计数和表征。光被散射,荧光以特定于每个细胞特征的方式发射。 这使研究人员能够在单细胞水平上确定海洋微生物的丰度,大小和色素含量。在这里,我们要求资金,以取代停产的流式细胞仪,这是大量使用的两个研究小组在过去7年。这种灵敏、坚固、用户友好的仪器的新模型将使这两个大型研究小组能够继续进行以下研究:(1)确定海洋微生物对实验室和野外温度变化的反应,(2)研究谁是重要的氮循环海洋微生物,以及是什么控制着它们的生长和丰度,(3)确定微量营养素和微生物相互作用在控制海洋初级生产者生长中的作用。这些研究的结果将提高我们对未来海洋生产力如何随着地球气候变暖而变化的理解。这对加拿大人很重要,因为海洋生产力与渔业资源的生产和二氧化碳从大气层向深海的移动直接相关。

项目成果

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LaRoche, Julie其他文献

Short-term response to iron resupply in an iron-limited open ocean diatom reveals rapid decay of iron-responsive transcripts.
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0280827
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Behnke, Joerg;Cai, Yun;Gu, Hong;LaRoche, Julie
  • 通讯作者:
    LaRoche, Julie
Compact and automated eDNA sampler for in situ monitoring of marine environments.
  • DOI:
    10.1038/s41598-023-32310-3
  • 发表时间:
    2023-03-30
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Hendricks, Andre;Mackie, Connor M.;Luy, Edward;Sonnichsen, Colin;Smith, James;Grundke, Iain;Tavasoli, Mahtab;Furlong, Arnold;Beiko, Robert G.;LaRoche, Julie;Sieben, Vincent
  • 通讯作者:
    Sieben, Vincent
Combining multi-marker metabarcoding and digital holography to describe eukaryotic plankton across the Newfoundland Shelf.
  • DOI:
    10.1038/s41598-022-17313-w
  • 发表时间:
    2022-07-29
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    MacNeil, Liam;Desai, Dhwani K.;Costa, Maycira;LaRoche, Julie
  • 通讯作者:
    LaRoche, Julie
EMILIANIA HUXLEYI (PRYMNESIOPHYCEAE): NITROGEN-METABOLISM GENES AND THEIR EXPRESSION IN RESPONSE TO EXTERNAL NITROGEN SOURCES
  • DOI:
    10.1111/j.1529-8817.2010.00809.x
  • 发表时间:
    2010-04-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Bruhn, Annette;LaRoche, Julie;Richardson, Katherine
  • 通讯作者:
    Richardson, Katherine
Seasonal bacterial niche structures and chemolithoautotrophic ecotypes in a North Atlantic fjord.
  • DOI:
    10.1038/s41598-022-19165-w
  • 发表时间:
    2022-09-12
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Raes, Eric;Tolman, Jennifer;Desai, Dhwani;Ratten, Jenni-Marie;Zorz, Jackie;Robicheau, Brent M.;Haider, Diana;LaRoche, Julie
  • 通讯作者:
    LaRoche, Julie

LaRoche, Julie的其他文献

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  • 通讯作者:
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{{ truncateString('LaRoche, Julie', 18)}}的其他基金

The impact of oceanic microbial communities on marine biogeochemistry now and in the future
海洋微生物群落对现在和未来海洋生物地球化学的影响
  • 批准号:
    RGPIN-2021-04060
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
Marine Microbial Genomics and Biogeochemistry
海洋微生物基因组学和生物地球化学
  • 批准号:
    CRC-2018-00159
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Canada Research Chairs
Marine Microbial Genomics And Biogeochemistry
海洋微生物基因组学和生物地球化学
  • 批准号:
    CRC-2018-00159
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Canada Research Chairs
The impact of oceanic microbial communities on marine biogeochemistry now and in the future
海洋微生物群落对现在和未来海洋生物地球化学的影响
  • 批准号:
    RGPIN-2021-04060
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
OFI SF6 Biosurveillance of MSX and other oyster diseases in the Bras d'Or Lakes: Establishment of an end-to-end platform for rapid on-site detection of known oyster parasites from environmental DNA
OFI SF6 对布拉多尔湖 MSX 和其他牡蛎疾病的生物监测:建立一个端到端平台,用于从环境 DNA 中快速现场检测已知的牡蛎寄生虫
  • 批准号:
    568548-2021
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Alliance Grants
The impact of oceanic microbial communities on marine biogeochemistry now and in the future
海洋微生物群落对现在和未来海洋生物地球化学的影响
  • 批准号:
    421436-2012
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
Canada Research Chair in Marine Microbial Genomics and Biogeochemistry
加拿大海洋微生物基因组学和生物地球化学研究主席
  • 批准号:
    1000227305-2011
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Canada Research Chairs
The impact of oceanic microbial communities on marine biogeochemistry now and in the future
海洋微生物群落对现在和未来海洋生物地球化学的影响
  • 批准号:
    421436-2012
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
Characterizing the modification of the gut microbiome of farmed salmon as a function of feeding regimes designed to reduce summer gut syndrome in British Columbia salmon farms
描述养殖鲑鱼肠道微生物组的改变作为旨在减少不列颠哥伦比亚省鲑鱼养殖场夏季肠道综合症的喂养方案的功能
  • 批准号:
    514569-2017
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Engage Grants Program
Canada Research Chair in Marine Microbial Genomics and Biogeochemistry
加拿大海洋微生物基因组学和生物地球化学研究主席
  • 批准号:
    1000227305-2011
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Canada Research Chairs

相似国自然基金

DDAH/ADMA/NOS系统基因多态性与原发性高血压易感性及其机制研究
  • 批准号:
    30671149
  • 批准年份:
    2006
  • 资助金额:
    28.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Roles of Glial Autophagy in Breast Cancer Brain Metastasis
胶质细胞自噬在乳腺癌脑转移中的作用
  • 批准号:
    10660141
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.71万
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  • 批准号:
    10905168
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.71万
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Map Paravascular Fluid Dynamic Signatures of Key Aging and AD Processes Using Dynamics Diffusion-Weighted Imaging
使用动力学扩散加权成像绘制关键衰老和 AD 过程的血管旁流体动态特征
  • 批准号:
    10739365
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    2023
  • 资助金额:
    $ 7.71万
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Metabolites regulating macrophage function in colorectal cancer
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  • 批准号:
    10727502
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
CRISPR interference of essential stage-specific gene function in Chlamydia trachomatis
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  • 批准号:
    10644789
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
Investigation of the essential structural and sequence features for the recognition of RNA methylations during post-transcriptional regulation of gene expression
研究基因表达转录后调控过程中识别 RNA 甲基化的基本结构和序列特征
  • 批准号:
    10796260
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
In Vivo Characterizations of Retinal Hemodynamics
视网膜血流动力学的体内表征
  • 批准号:
    10503497
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
Directing Tryptophan Immunometabolism to Ameliorate Liver Ischemic-Reperfusion Injury
指导色氨酸免疫代谢改善肝脏缺血再灌注损伤
  • 批准号:
    10595020
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
The role of Sertad4 in pathologic cardiac remodeling.
Sertad4 在病理性心脏重塑中的作用。
  • 批准号:
    10642929
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
Sympathetic Restraint of Exercising Muscle Blood Flow is Not Essential For Arterial Blood Pressure Regulation During Submaximal Intensity Exercise
运动肌肉血流的交感神经抑制对于次最大强度运动期间的动脉血压调节不是必需的
  • 批准号:
    577954-2022
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 7.71万
  • 项目类别:
    Canadian Graduate Scholarships Foreign Study Supplements
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知道了