核桃埋干复幼促根过程中生长素响应基因的CpG岛甲基化重编程研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31171933
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1503.果树生长发育
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

埋干复幼实现了核桃等木本植物成龄树扦插生根(裴东等,2007年国家发明专利),但对复幼促进生根的机制缺乏深入认识。近年来研究表明,基因CpG岛甲基化重编程与复幼和生长素关系密切,而生长素又是生根关键的内源激素。本研究选取15年生核桃'强悍'品种,以经过埋干复幼获得的易生根嫩枝和成龄树上相同状态难生根嫩枝(对照)为试材,扦插诱导生根。采用同源克隆和转录组测序、同源分析方法,获得生长素响应差异表达基因,克隆其全长序列,分析其CpG岛的分布,筛选含有尤其是启动子区含有较多CpG岛的目标基因。利用BSP测序法分析目标基因在复幼过程中CpG岛的甲基化变化频率和规律,从重要或关键基因的DNA甲基化等表观遗传方面,揭示埋枝复幼促进核桃成龄品种生根的分子机制,深化对木本植物复幼和不定根发生机制的认识。

结项摘要

核桃(Juglans regia L. )属扦插难生根树种,成龄核桃品种更难。研究表明,通过埋干等复幼处理可以明显提高成龄核桃品种的不定根发生能力,扦插成活率达95%以上。组织形态学研究发现,核桃根原基发生于髓射线正对的形成层,属于单位点发生。运用免疫胶体金组织化学定位技术,对核桃‘中宁盛’品种不定根发生过程中IAA、ABA、GA和ZT时空分布研究发现,复幼处理不仅提高了生长素的累积水平,而且显著改变了IAA、ABA、GA和ZT的运输。生根诱导前,成熟态和幼态嫩枝插穗基部的IAA、ABA、GA和ZT均分布在韧皮部维管组织及其周围细胞中。生根诱导1d集中分布区不变,但幼态嫩枝中发生了这4类激素由筛管组织向嫩茎基部运输的现象;诱导3~5d,这4类激素的多数已转移至形成层细胞中,在部分木质部射线细胞和导管细胞的伴胞中也有分布;诱导6~9d,不定根原基形成,而成熟嫩茎基部的IAA、ABA、GA和ZT的分布位置无明显变化。在DNA甲基化研究中,筛选出了39对适用于核桃 MSAP 分析的稳定多态引物,采用 MSAP 标记对核桃埋干复幼嫩枝韧皮部组织进行DNA甲基化水平分析,共扩增出1363条清晰可辨的电泳谱带,平均每对引物扩增出35条条带。在复幼嫩枝中,检测出的DNA 甲基化修饰位点595个,甲基化比例为43.65 %,其中内侧胞嘧啶全甲基化位点441个,占全部扩增位点的32.36 %;外侧胞嘧啶半甲基化位点为158个,占全部扩增位点的11.59%。此外,复幼和成熟嫩枝总DNA甲基化(CCGG位点)均以双链甲基化为主,并且复幼嫩枝总DNA甲基化水平低于成熟态的。对获得的甲基化差异条带进行克隆和测序,得到5条反应甲基化模式变异的变异条带序列,Blast分析表明,差异条带主要与线粒体中参与编码NADH脱氢酶亚单位的基因以及编码硝酸还原酶的基因片段高度同源, 这一结果较好地解释了埋干黄化改变了细胞的能量代谢和细胞活力现象。DNA甲基化如何调控基因表达和改变代谢通路进而提高了不定根发生能力还需开展进一步研究。

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
组织定位分析生长素IAA在核桃花芽分化过程中时空表达特性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Journal of the American Society for Horticultural Science
  • 影响因子:
    1.9
  • 作者:
    高英;刘浩;董宁光;裴东
  • 通讯作者:
    裴东
Immunohistochemical localization of IAA during induction of adventitious root formation from cotyledon explants of walnut
核桃子叶外植体诱导不定根形成过程中 IAA 的免疫组织化学定位
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    Journal of the American Society for Horticultural Science
  • 影响因子:
    1.9
  • 作者:
    Ningguang Dong;Qingmin Wang;Junpei Zhang;Dong Pei
  • 通讯作者:
    Dong Pei
Temporal and Spatial Pattern of Indole-3-acetic Acid Occurrence during Walnut Pistillate Flower Bud Differentiation as Revealed by Immunohistochemistry
免疫组织化学揭示核桃雌花花芽分化过程中吲哚-3-乙酸发生的时空格局
  • DOI:
    10.21273/jashs.137.5.283
  • 发表时间:
    2012-09-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF THE AMERICAN SOCIETY FOR HORTICULTURAL SCIENCE
  • 影响因子:
    1.9
  • 作者:
    Gao, Ying;Liu, Hao;Pei, Dong
  • 通讯作者:
    Pei, Dong
核桃BES-SSR 的开发及在遗传多样性分析中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014-10
  • 期刊:
    北京林业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    马庆国;张俊佩;周贝贝;裴东
  • 通讯作者:
    裴东
Morphological Characteristics and In Situ Auxin Production during the Histogenesis of Staminate Flowers in Precocious Walnut
早熟核桃雄花组织发生过程中的形态特征及生长素原位产生
  • DOI:
    10.21273/jashs.139.2.185
  • 发表时间:
    2014-03-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF THE AMERICAN SOCIETY FOR HORTICULTURAL SCIENCE
  • 影响因子:
    1.9
  • 作者:
    Gao, Ying;Liu, Hao;Pei, Dong
  • 通讯作者:
    Pei, Dong

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其他文献

不同砧木品种对核桃树体生长及光合特性的影响
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    裴东
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  • 发表时间:
    2017
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  • 影响因子:
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  • 通讯作者:
    裴东
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    园艺学报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    裴东
  • 通讯作者:
    裴东
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    计算机工程
  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭威彤;裴东;杨鸿武;梁青青
  • 通讯作者:
    梁青青

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早实核桃优异性状遗传解析与种质创新
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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