序列特征研究及其在基因组分析中的应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    60671018
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    25.0万
  • 负责人：
    孙啸
  • 依托单位：
    东南大学
  • 学科分类：
    F0124.生物电子学与生物信息处理
  • 结题年份：
    2009
  • 批准年份：
    2006
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

研究基因组序列信息组织或结构上的规律，发现新的基因组序列特征，用以辨别来自不同物种的基因组序列，分析基因组之间的进化关系。我们的研究将跨越传统序列特征的局限，重点研究DNA 序列上非相邻碱基之间的关联性，由此提出基于特征的基因组序列分析和搜索方法，发展新的基因组孤岛或DNA水平转移识别方法，同时建立一个基于特征的基因组序列数据库搜索系统。本项目研究的意义在于发现新的基因组序列碱基关联性特征，这种特征与传统的序列组成特征完全不同，能够更好地反映序列信息组织结构的特点；所提出的基于特征的分析方法是针对大规模基因组序列而发展的新方法，可以适应越来越多、越来越大的全基因组序列；而将基于序列特征的基因组数据库搜索方法与传统的序列搜索方法结合起来，可望扩大基因组数据搜索方法适用的范围，提高搜索的效率，所建立的基因组序列特征搜索系统可以作为分析和发现DNA水平转移的一种计算平台。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（10）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（11）
专利数量（0）
蛋白质序列的特征周期研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物物理学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘宏德;孙啸
  • 通讯作者：
    孙啸
基于Web挖掘构建精神与行为相关基因数据库
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机与数字工程
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    陶怡;陈亮;孙啸;周远
  • 通讯作者：
    周远
Support vector machine for prediction of horizontal gene transfers in bacteria genomes
用于预测细菌基因组中水平基因转移的支持向量机
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2007-07
  • 期刊：
    生物化学与生物物理进展
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Sun Xiao;Wu Jian-Sheng;Xie Jian-Ming;Zhou Tong;Weng Jian-Hong
  • 通讯作者：
    Weng Jian-Hong
基因相关生物医学文献挖掘研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    电脑知识与技术
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    袁毅;谢建明;张晓东;张丹;孙啸
  • 通讯作者：
    孙啸
Comparability of gene expression in human blood, immune and carcinoma cells
人类血液、免疫细胞和癌细胞中基因表达的可比性
  • DOI：
    10.1016/j.amc.2008.05.023
  • 发表时间：
    2008-11
  • 期刊：
    Applied Mathematics and Computation
  • 影响因子：
    4
  • 作者：
    Xinan Yang;Jianming Xie;Xiao Sun;Zuhong Lu
  • 通讯作者：
    Zuhong Lu

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

一种面向基因与疾病关系的文本挖掘方法
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    东南大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    龚乐君;谢建明;袁志栋;韦有兵;孙啸
  • 通讯作者：
    孙啸
Hi-C的干细胞染色质多重相互作用特征分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    生物信息学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张峰;刘亚军;谢建明;孙啸;刘宏德
  • 通讯作者：
    刘宏德
蛋白质-核酸复合物界面氨基酸与核苷酸偏好性分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物物理学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    孙啸;谢建明;伍洪涛;吴建盛;胡栋
  • 通讯作者：
    胡栋
染色质构象解析技术——Hi-C及染色质构象信息提取
  • DOI：
    10.13417/j.gab.034.002319
  • 发表时间：
    2015-12
  • 期刊：
    基因组学与应用生物学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    胡文桥;侯越;张峰;刘宏德;孙啸
  • 通讯作者：
    孙啸
基于ERT的地下含水区域混凝土浇筑均质性评价方法
  • DOI：
    10.20040/j.cnki.1000-7709.2022.20212634
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
    水电能源科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    赵锦平;田正宏;孙啸;马原山
  • 通讯作者：
    马原山

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

孙啸的其他基金

G-四链体DNA与染色质相互作用及其对转录与复制的影响
  • 批准号：
  • 批准年份：
    2019
  • 资助金额：
    59 万元
  • 项目类别：
    面上项目
影响产电微生物胞外电子转移的关键细胞色素和菌毛蛋白研究
  • 批准号：
    61472078
  • 批准年份：
    2014
  • 资助金额：
    80.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
核小体定位的动态调控信息分析
  • 批准号：
    61073141
  • 批准年份：
    2010
  • 资助金额：
    30.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
基因芯片设计方法和可靠性分析方法的研究
  • 批准号：
    69971010
  • 批准年份：
    1999
  • 资助金额：
    14.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码