发掘成株期抗条锈病关键基因对于解析小麦成株期抗病网络，揭示抗病机制具有重要意义。本项目以兴资9104等多个成株期抗条锈小麦抗源为材料，创制了一系列重组自交系群体和近等基因系材料，采用集群分离分析（BSA）策略，利用RNA-seq等基因分型技术，分析、鉴定抗病差异表达序列；利用遗传群体对差异序列进行染色体定位，获得在功能上相关且染色体位点相近的序列，寻找小麦抗病关键基因；利用小麦SNP芯片建立目标区域高密度标记图谱，并结合比较基因组学和生物信息学等手段，设计开发新的分子标记，实现抗病主效QTL的精细作图，试图将抗病差异表达序列、抗病性表现、染色体定位和精细作图联系起来，探索基于BSA差异表达的精细定位抗病QTLs的技术体系。获得如下主要结果：1）建立了基于小麦iselect 90K SNP芯片的兴资9104/Avocet S群体的高密度遗传连锁图谱，在12条染色体上定位到位27个与小麦成株期抗条锈病相关的QTL，其中在2B染色体上发现一个新的主效抗病QTL，定名为Qyrxz.nwafu_2B.3，在5个环境中其效应值达到13.7872~36.4159%；同时发现， 小麦3BS染色体的Qyrxz.nwafu_3B位点与成株期抗白粉病位点QPmxz.nwafu_3BS为同一区间，其对条锈病和白粉病的抗性效应值分别为4.9219~23.6857%和7.8769~12. 5723%，认为该QTL为兼抗性位点，因此在小麦抗病育种中具有重要价值。2）针对2BL主效抗条锈QTL（QYrxz.nwafu_2B），构建大分离群体，根据目标区段SNP标记，开发KASP标记，筛选重组交换单株，建立了基于BSA 的RNA-seq差异表达技术体系，并结合遗传定位结果及小麦参考基因组信息，开发分子标记，进行精细作图，已将目标区段锁定在2B:676024022-677356979 (1.32Mb) 物理区间，依据小麦参考基因组注释信息，在该区间内注释到15个基因，结合BSA-seq差异表达结果，分析鉴定了候选基因；3）开发了多个用于成株期抗锈性育种中辅助选择分子标记。 .本项目完成了兴资9104成株期抗条锈病主效QTL的精细定位，为进一步克隆该QTL，揭示成株期抗病机制奠定基础；完成了多个抗源的发掘工作，开发了主效QTL的辅助选择标记，为我国小麦抗病育种不仅提供了抗源，同时提供了育种选择手段。