基于中国汉族人群的快速突变Y-STR基因座进行男性个体识别的研究
批准号:
81273347
项目类别:
面上项目
资助金额:
69.0 万元
负责人:
孙宏钰
依托单位:
学科分类:
法医物证学及法医人类学
结题年份:
2016
批准年份:
2012
项目状态:
已结题
项目参与者:
欧雪玲、BruceBudowle、王小广、陈勇、张胤鸣、刘素娟、洪丽
中文摘要
目前常用的Y-STR分型体系因不同父系男性个体之间可能的共有单倍型的存在及同一父系男性个体之间单倍型相同的特点,个体识别证据价值较低,仅侧重于排查。本研究拟针对非重组Y染色体区域(NRY)全序列,搜寻适于中国汉族男性群体的≥20个突变率高于1.0×10-2/代的快速突变(rapidly mutating,RM)Y-STR基因座;构建多重荧光标记复合扩增RM Y-STR分型体系;对1000个中国汉族三代或三代以上无关家系的父系男性个体进行RM Y-STR分型并与Yfiler对比;评估RM Y-STR体系对不同父系男性个体的识别能力和同一父系男性个体的区分能力;探讨该体系应用于性犯罪案件混合斑等物证检验的结果解释和应用策略。本研究对打破Y-STR的法医学应用局限有突破性意义,将显著提高Y-STR的男性个体识别能力,更有效地发挥Y-STR分型的证据价值,促进法医物证DNA检验技术的发展。
英文摘要
Because the common haplotype may be shared by the males from different paternal lineages and the identical haplotype will be shared by all the males from the same paternal lineages, the evidential power of match for the current available Y-STR sets is relatively low and its forensic value is mainly exclusion. The proposal is planned to aim the whole genome sequence of the non-recombining portion of the Y-chromosome (NRY) and screen ≥20 rapid mutating (RM) Y-STR loci with the mutation rate higher than 1.0×10-2/generation in Chinese Han male population. The fluorescent labeled multiplex RM Y-STR typing system is to be established. The males from 1000 unrelated Chinese Han paternal lineages with three or more generations will be typed using the developed RM Y-STR system and compared with Yfiler system. The capability of the RM Y-STR system to discriminate the males from different paternal lineages and the same paternal lineage is to be evaluated. The study will also discuss the ways of interpreting the RM Y-STR typing results and draw up a guideline to the strategy of RM Y-STR system using in forensic casework. The study will evolutional break the current limitations of Y-STR analysis in forensic genetics, significantly increase its resolution capability of male identification and provide a promising solution for better applications of Y-STR for identity testing, which will improve the DNA typing in forensic investigations.
目前常用的Y-STR 分型体系因不同父系男性个体之间可能的共有单倍型的存在及同一父系男性个体之间单倍型相同的特点,个体识别证据价值较低,仅侧重于排查。本研究针对非重组Y染色体区域(NRY)全序列,根据文献和数据库资料初筛出46个Y-STR基因座,对中国广东汉族男性无关个体进行群体多态性调查,对中国六个民族群体进行群体间遗传结构分析,对父子对二代家系和多代大家系样本等位基因传递过程中的突变现象进行研究。结果显示广东汉族无关男性总的单倍型多态性(HD)为0.999996,系统识别能力(DC)值为0.998。基因多态性(GD)最高的为DYS385a/b(00.9597),其次为DYS387S1(0.9509)、DYS449(0.9597),最低的为DYS438(0.4401)。中国南方汉族群体与回族、朝鲜族、蒙古族、维族相对较紧密聚类,而藏族群体相对孤立和离散。但是因为Fst很小,亚群之间可以考虑不需校正。1033个父子对样本中共检测到36461次等位基因的遗传传递,观察到151次突变,平均突变率为4.1×10-3。其中突变率最高是DYS576、DYS518和DYS627;突变率超过4×10-3的有DYS458等15个基因座。综合GD值和突变率,本研究选取了23个Y-STR基因座构建了五色荧光标记的RM Y-STR复合扩增体系。比较本研究所建立的体系和Yfiler体系对1007个中国广东汉族男性无关个体的分型结果,显示本研究建立的体系使得唯一单倍型数目从972增加到1006,HD值从0.999878明显提高到0.999993,对Yfiler体系的共有单倍型较好地区分。在28次遗传传递中,同一家系男性个体两两之间Yfiler单倍型差异率为0.9104,本研究建立的RM Y-STR体系可提高至0.9301。采用本研究建立的RM Y-STR分型体系可以区分26.9%的男性近亲,是常用17个Yfiler单倍型的2倍。因此,本研究自建体系对不同父系男性个体的识别能力和同一父系男性个体的区分能力都较Yfiler更强。同时,本研究对Y-STR突变特点进行探索,提出基于逐步突变模型的Y-STR发生突变时的LR值计算方法。本研究对打破Y-STR 的法医学应用局限有突破性意义,将显著提高Y-STR 的男性个体识别能力,更有效地发挥Y-STR 分型的证据价值。
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Identification of the sequence variations of 15 autosomal STR loci in a Chinese population
中国人群15个常染色体STR基因座序列变异的鉴定
DOI:
10.3109/03014460.2014.897754
发表时间:
2014-11-01
期刊:
ANNALS OF HUMAN BIOLOGY
影响因子:
1.7
作者:
[Chen, Wenjing, Cheng, Jianding, Sun, Hongyu]
通讯作者:
Sun, Hongyu
DOI:
10.1016/j.fsigen.2015.08.007
发表时间:
2015-11
期刊:
Forensic science international. Genetics
影响因子:
--
作者:
[X. Ou;Ying Wang;Chao Liu;Donggui Yang;Chu-chu Zhang;Shujiao Deng;Hongyu Sun]
通讯作者:
X. Ou;Ying Wang;Chao Liu;Donggui Yang;Chu-chu Zhang;Shujiao Deng;Hongyu Sun
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
法医学杂志
影响因子:
--
作者:
[张楚楚, 洪丽, 欧雪玲, 孙宏钰]
通讯作者:
孙宏钰
Development of a 24-plex Y chromosomal STR loci typing system
24 重 Y 染色体 STR 位点分型系统的开发
DOI:
10.1016/j.fsigss.2013.10.034
发表时间:
2013-01-01
期刊:
FORENSIC SCIENCE INTERNATIONAL GENETICS SUPPLEMENT SERIES
影响因子:
--
作者:
[Liu, C., Liu, H., Sun, H. Y.]
通讯作者:
Sun, H. Y.
Identification of a rare off-ladder allele of the D13S325 locus during paternity testing
在亲子鉴定过程中鉴定 D13S325 位点的罕见梯外等位基因
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
Legal Medicine
影响因子:
1.5
作者:
[Tong DY, Liu SJ, Zhang YM, Sun HY]
通讯作者:
Sun HY
共 14 条
基于家系重建进行多个体组合亲缘关系分析的探索研究
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批准号:81971798
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项目类别:面上项目
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资助金额:55.0万元
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批准年份:2019
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负责人:孙宏钰
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依托单位:
多个体组合的精准亲缘鉴定研究
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批准号:--
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2019
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负责人:孙宏钰
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依托单位:
基于NGS-STR分型和IBS策略进行远亲缘关系鉴定的研究
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批准号:81671873
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2016
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负责人:孙宏钰
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依托单位:
DHPLC进行线粒体DNA分型的研究
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批准号:30400519
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:21.0万元
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批准年份:2004
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负责人:孙宏钰
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依托单位:
国内基金
海外基金